MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Candidatus Liberibacter asiaticus str. psy62 chromosome

Total Repeats: 6953

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012985	CAA	2	6	461	466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_012985	TTTA	2	8	865	872	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012985	GA	3	6	882	887	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012985	ACC	2	6	898	903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_012985	AG	3	6	933	938	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012985	GAA	2	6	2150	2155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012985	AAG	2	6	2190	2195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012985	TTG	2	6	6744	6749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012985	TCA	2	6	6797	6802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_012985	A	6	6	6805	6810	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012985	A	7	7	9618	9624	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012985	ATTTT	2	10	9695	9704	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012985	A	8	8	9725	9732	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012985	ATT	2	6	9745	9750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012985	ATA	2	6	11014	11019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012985	AT	3	6	11040	11045	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012985	ATAA	2	8	11054	11061	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012985	AAT	2	6	11076	11081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012985	AT	3	6	11132	11137	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012985	A	6	6	11143	11148	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012985	AT	3	6	11156	11161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012985	GCGA	2	8	11572	11579	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_012985	TCT	2	6	11602	11607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_012985	ATGG	2	8	11663	11670	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012985	AT	3	6	11681	11686	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012985	AGTA	2	8	11693	11700	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012985	TCAT	2	8	11712	11719	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_012985	CAGT	2	8	11752	11759	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_012985	TTG	2	6	11796	11801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012985	AAT	2	6	11851	11856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012985	TA	3	6	11872	11877	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012985	GAT	2	6	11892	11897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012985	AAG	2	6	11921	11926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012985	A	6	6	11980	11985	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012985	TAC	2	6	11994	11999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_012985	A	6	6	12003	12008	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012985	T	8	8	12064	12071	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012985	AGTG	2	8	12079	12086	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012985	TCG	2	6	12120	12125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_012985	AT	3	6	12148	12153	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012985	ATA	2	6	12190	12195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012985	A	6	6	12241	12246	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012985	AGAAA	2	10	12266	12275	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012985	AGT	2	6	12415	12420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012985	TCT	2	6	12446	12451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_012985	T	6	6	12495	12500	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012985	A	6	6	12508	12513	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012985	AGAT	2	8	12517	12524	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012985	TCC	2	6	12567	12572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_012985	ATG	2	6	12598	12603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012985	TTA	2	6	12618	12623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012985	ATC	2	6	12747	12752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_012985	AATA	2	8	12763	12770	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012985	GAA	2	6	12793	12798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012985	AT	3	6	15187	15192	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012985	AAT	2	6	15193	15198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012985	AGA	2	6	15262	15267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012985	AT	3	6	15279	15284	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012985	A	6	6	15304	15309	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012985	TA	3	6	15313	15318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012985	A	6	6	15400	15405	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012985	CAA	2	6	18731	18736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_012985	ATGG	2	8	18738	18745	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012985	T	8	8	19426	19433	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012985	A	6	6	19466	19471	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012985	T	6	6	19474	19479	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012985	A	6	6	19480	19485	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012985	TAA	2	6	19514	19519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012985	AAAC	2	8	19520	19527	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_012985	ATT	2	6	19539	19544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012985	A	7	7	19559	19565	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012985	A	6	6	19574	19579	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012985	TCA	2	6	19583	19588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_012985	A	7	7	19609	19615	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012985	TA	4	8	19616	19623	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012985	AAT	2	6	19635	19640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012985	AT	3	6	19659	19664	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012985	CAT	2	6	19674	19679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_012985	TAC	2	6	19703	19708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_012985	AT	3	6	19718	19723	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012985	ATT	2	6	19727	19732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012985	TAA	2	6	19740	19745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012985	TAC	2	6	19768	19773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_012985	TGA	2	6	19804	19809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012985	TCA	2	6	19823	19828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_012985	ATA	2	6	19849	19854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012985	TC	3	6	24130	24135	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_012985	A	6	6	24159	24164	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012985	A	6	6	24166	24171	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012985	TTCT	2	8	24172	24179	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_012985	T	6	6	28397	28402	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012985	GAA	3	9	29484	29492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012985	A	6	6	29517	29522	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012985	CA	3	6	29551	29556	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_012985	A	6	6	29556	29561	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012985	A	6	6	30720	30725	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012985	CAAC	2	8	30726	30733	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_012985	CTA	2	6	30734	30739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_012985	TA	3	6	30738	30743	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_012985	AAAC	2	8	30744	30751	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_012985	AAT	3	9	30760	30768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012985	CAA	2	6	31346	31351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_012985	A	7	7	31606	31612	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012985	AAT	2	6	31652	31657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012985	CCG	2	6	31706	31711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_012985	AT	3	6	31759	31764	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012985	TTA	2	6	31769	31774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012985	TC	3	6	32977	32982	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_012985	TC	3	6	32986	32991	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_012985	AATA	2	8	32998	33005	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012985	AGG	2	6	33027	33032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012985	A	8	8	33128	33135	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012985	ATA	2	6	33147	33152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012985	ATG	2	6	33189	33194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012985	ATG	2	6	33215	33220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012985	AC	3	6	34494	34499	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_012985	ATCA	2	8	34535	34542	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_012985	TTGA	2	8	34655	34662	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012985	CAA	2	6	34718	34723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_012985	TAA	2	6	34808	34813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_012985	CACT	2	8	34862	34869	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_012985	AT	3	6	34888	34893	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012985	TAA	2	6	34955	34960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_012985	ATA	2	6	34972	34977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012985	CA	3	6	34993	34998	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_012985	CAG	2	6	35048	35053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_012985	CAT	2	6	35060	35065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_012985	AT	3	6	35064	35069	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_012985	AAC	2	6	35114	35119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_012985	CTT	2	6	35162	35167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_012985	ATA	2	6	35176	35181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012985	AAT	2	6	35219	35224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_012985	A	6	6	35300	35305	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_012985	TCA	2	6	35413	35418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_012985	CCA	2	6	35425	35430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_012985	TAA	2	6	35441	35446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_012985	AC	4	8	35448	35455	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_012985	T	6	6	35494	35499	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_012985	TGA	2	6	35528	35533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_012985	A	6	6	35605	35610	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_012985	AGA	2	6	35657	35662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_012985	CAT	2	6	35960	35965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_012985	TCA	2	6	36072	36077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_012985	ATG	2	6	36100	36105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_012985	TCA	2	6	36117	36122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_012985	A	6	6	37307	37312	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_012985	TTA	2	6	37328	37333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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149	NC_012985	A	6	6	37375	37380	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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491	NC_012985	GTAT	2	8	87810	87817	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
492	NC_012985	AT	3	6	88651	88656	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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