MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Candidatus Hamiltonella defensa 5AT (Acyrthosiphon pisum) chromosome

Total Repeats: 9733

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_012751	GCGCGG	2	12	1098066	1098077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5002	NC_012751	ATG	2	6	1098092	1098097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_012751	CCT	2	6	1098107	1098112	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5004	NC_012751	TCA	2	6	1098591	1098596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5005	NC_012751	A	8	8	1098596	1098603	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_012751	ATA	2	6	1100159	1100164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_012751	ATTA	2	8	1100173	1100180	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_012751	A	8	8	1100193	1100200	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_012751	T	6	6	1100211	1100216	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_012751	T	6	6	1100239	1100244	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_012751	A	6	6	1100248	1100253	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_012751	TGT	2	6	1100258	1100263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_012751	TAGT	2	8	1100271	1100278	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_012751	T	7	7	1100287	1100293	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_012751	A	6	6	1100322	1100327	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_012751	CTG	2	6	1100337	1100342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5017	NC_012751	A	6	6	1100354	1100359	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_012751	GTT	2	6	1100434	1100439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_012751	TAA	2	6	1100448	1100453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_012751	A	7	7	1100452	1100458	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_012751	AATT	2	8	1100468	1100475	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_012751	TATT	2	8	1100498	1100505	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_012751	T	7	7	1100527	1100533	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_012751	TAAA	2	8	1100552	1100559	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_012751	TTA	2	6	1100569	1100574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_012751	AAT	2	6	1100577	1100582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_012751	T	7	7	1100666	1100672	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_012751	TAG	2	6	1100683	1100688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_012751	CTA	2	6	1100899	1100904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5030	NC_012751	AGT	2	6	1100909	1100914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_012751	GC	3	6	1100965	1100970	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5032	NC_012751	CTG	2	6	1101028	1101033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5033	NC_012751	TCT	2	6	1101108	1101113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5034	NC_012751	CAG	2	6	1101146	1101151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5035	NC_012751	T	7	7	1101320	1101326	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_012751	T	6	6	1101340	1101345	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_012751	ATT	2	6	1101348	1101353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_012751	TTA	2	6	1101358	1101363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_012751	ATTG	2	8	1101390	1101397	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_012751	CAAA	2	8	1101437	1101444	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5041	NC_012751	A	6	6	1101494	1101499	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_012751	ACT	2	6	1101506	1101511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5043	NC_012751	TCA	2	6	1101552	1101557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5044	NC_012751	TGA	2	6	1101577	1101582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_012751	GAT	2	6	1101589	1101594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_012751	GAT	2	6	1101637	1101642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_012751	ATA	2	6	1101653	1101658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_012751	TCA	2	6	1101782	1101787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5049	NC_012751	AAAT	2	8	1101800	1101807	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_012751	ATG	2	6	1107774	1107779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_012751	TTC	2	6	1107800	1107805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5052	NC_012751	CAT	2	6	1107823	1107828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5053	NC_012751	CAA	2	6	1108129	1108134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5054	NC_012751	A	6	6	1108133	1108138	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_012751	GACT	2	8	1108143	1108150	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5056	NC_012751	TA	3	6	1108382	1108387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_012751	TAA	2	6	1108412	1108417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_012751	A	7	7	1109018	1109024	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_012751	TTG	2	6	1109059	1109064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_012751	AAG	2	6	1109113	1109118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_012751	A	6	6	1109138	1109143	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_012751	CCG	2	6	1109150	1109155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5063	NC_012751	CGATG	2	10	1109229	1109238	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5064	NC_012751	GAT	2	6	1109278	1109283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_012751	GAA	2	6	1109334	1109339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_012751	ATT	2	6	1109914	1109919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_012751	ATT	2	6	1110056	1110061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_012751	AGA	2	6	1110090	1110095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_012751	AC	3	6	1110099	1110104	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5073	NC_012751	CTATG	2	10	1111845	1111854	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5074	NC_012751	CAT	2	6	1111858	1111863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5076	NC_012751	ATTT	2	8	1112021	1112028	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5080	NC_012751	TTA	2	6	1112964	1112969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_012751	TTA	2	6	1112978	1112983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5083	NC_012751	T	8	8	1113146	1113153	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5085	NC_012751	T	6	6	1113169	1113174	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5088	NC_012751	TTA	2	6	1113235	1113240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_012751	TAA	2	6	1113244	1113249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5093	NC_012751	A	6	6	1117087	1117092	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_012751	TC	3	6	1121195	1121200	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5095	NC_012751	T	8	8	1121306	1121313	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_012751	T	6	6	1121350	1121355	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_012751	A	6	6	1121381	1121386	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_012751	T	7	7	1121520	1121526	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_012751	CT	3	6	1121530	1121535	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5100	NC_012751	T	7	7	1121535	1121541	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_012751	ATT	2	6	1121542	1121547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_012751	ATTTTT	2	12	1125392	1125403	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_012751	T	7	7	1125399	1125405	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_012751	GAA	2	6	1125406	1125411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_012751	GAT	2	6	1125417	1125422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_012751	TA	5	10	1125445	1125454	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_012751	TCAT	2	8	1125473	1125480	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5108	NC_012751	GAT	2	6	1125501	1125506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_012751	TACC	2	8	1125528	1125535	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5110	NC_012751	CTC	2	6	1127131	1127136	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5111	NC_012751	CGA	2	6	1127137	1127142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5112	NC_012751	TTTA	2	8	1130211	1130218	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_012751	A	6	6	1130223	1130228	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_012751	TAAA	2	8	1130238	1130245	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_012751	ATT	2	6	1131987	1131992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_012751	CATC	2	8	1132012	1132019	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5117	NC_012751	A	7	7	1132051	1132057	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_012751	ATT	2	6	1132248	1132253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_012751	A	7	7	1132270	1132276	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_012751	TGA	2	6	1132279	1132284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_012751	CAA	2	6	1132317	1132322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5122	NC_012751	TAA	2	6	1132325	1132330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_012751	AT	3	6	1132333	1132338	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_012751	CTAA	2	8	1132677	1132684	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5125	NC_012751	GTC	2	6	1132762	1132767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5127	NC_012751	GTTC	2	8	1132844	1132851	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5128	NC_012751	ACG	2	6	1132855	1132860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5131	NC_012751	AGA	2	6	1133126	1133131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5132	NC_012751	AC	3	6	1135199	1135204	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5134	NC_012751	TAT	2	6	1135220	1135225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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