MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis B/TZ1A828/OT chromosome

Total Repeats: 2935

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_012687	CGA	2	6	367648	367653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_012687	GC	3	6	367737	367742	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1003	NC_012687	TGT	2	6	367749	367754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_012687	GAA	2	6	367790	367795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_012687	TAT	2	6	367832	367837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_012687	ACG	2	6	367841	367846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_012687	TTG	2	6	367891	367896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_012687	GCA	2	6	368014	368019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_012687	TGT	2	6	368020	368025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_012687	TC	3	6	368041	368046	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1011	NC_012687	ATC	2	6	368049	368054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_012687	TCT	2	6	368104	368109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_012687	TA	3	6	368111	368116	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_012687	CAA	2	6	368147	368152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_012687	AGGC	2	8	368165	368172	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1016	NC_012687	TCCA	2	8	368221	368228	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1017	NC_012687	A	7	7	368228	368234	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_012687	AGC	2	6	368272	368277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_012687	ACCA	2	8	368323	368330	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1020	NC_012687	CTT	2	6	368386	368391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_012687	CTC	2	6	368429	368434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1022	NC_012687	AAG	2	6	368441	368446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_012687	AGT	2	6	368541	368546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_012687	CAA	2	6	368547	368552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_012687	AGGGA	2	10	368577	368586	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_012687	GCT	2	6	368590	368595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1029	NC_012687	TAC	2	6	368667	368672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_012687	TAG	2	6	368711	368716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1032	NC_012687	TGAG	2	8	368820	368827	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_012687	AC	3	6	368848	368853	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1034	NC_012687	A	6	6	368949	368954	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_012687	CAA	2	6	368969	368974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_012687	CT	4	8	369020	369027	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1041	NC_012687	TGA	2	6	369226	369231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_012687	CT	3	6	369253	369258	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1043	NC_012687	CA	3	6	369262	369267	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1044	NC_012687	CAA	2	6	369308	369313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1049	NC_012687	TCT	2	6	369510	369515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_012687	TCG	2	6	369555	369560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_012687	TATG	2	8	369562	369569	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_012687	GT	3	6	369580	369585	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_012687	TAT	2	6	369591	369596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1055	NC_012687	AAC	2	6	369655	369660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_012687	A	6	6	369705	369710	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_012687	A	8	8	369725	369732	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_012687	TCTCT	2	10	369792	369801	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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1062	NC_012687	AAG	2	6	370149	370154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1064	NC_012687	GAA	2	6	370185	370190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1099	NC_012687	TAA	2	6	393179	393184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1101	NC_012687	TTTA	2	8	393233	393240	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_012687	CTT	2	6	393270	393275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_012687	GTT	2	6	393320	393325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1105	NC_012687	AATT	2	8	394041	394048	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_012687	A	6	6	394079	394084	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_012687	ATAA	2	8	394101	394108	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_012687	TGC	2	6	394133	394138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_012687	TTG	2	6	394184	394189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_012687	GTA	2	6	394197	394202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_012687	AAG	3	9	394210	394218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_012687	CA	3	6	394235	394240	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1113	NC_012687	TC	3	6	396782	396787	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1117	NC_012687	CTT	2	6	397263	397268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_012687	CT	3	6	397272	397277	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1119	NC_012687	CGA	2	6	397321	397326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1121	NC_012687	GA	3	6	397402	397407	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_012687	TTAT	2	8	397434	397441	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_012687	CAA	2	6	397449	397454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_012687	GCAA	2	8	397487	397494	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1125	NC_012687	GA	3	6	397533	397538	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1128	NC_012687	CAG	2	6	398525	398530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_012687	CTT	2	6	399500	399505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_012687	AAG	2	6	399513	399518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_012687	AAT	2	6	401147	401152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_012687	A	8	8	405536	405543	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_012687	T	9	9	405571	405579	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_012687	CTA	2	6	405597	405602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1135	NC_012687	TCC	2	6	405922	405927	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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