MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clostridium botulinum Ba4 str. 657 plasmid pCLJ2

Total Repeats: 232

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012657	T	6	6	61	66	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012657	ATG	2	6	75	80	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012657	A	6	6	126	131	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012657	A	7	7	197	203	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012657	GTTT	2	8	217	224	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012657	TG	3	6	243	248	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012657	A	7	7	249	255	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012657	AT	3	6	349	354	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012657	CTT	2	6	361	366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_012657	TAA	2	6	373	378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012657	ATTT	2	8	397	404	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012657	ATAGAT	2	12	411	422	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012657	AT	3	6	469	474	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012657	ACA	2	6	569	574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_012657	TTC	2	6	575	580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_012657	TCC	2	6	600	605	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_012657	TAAT	2	8	606	613	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012657	CTAA	2	8	614	621	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_012657	TTA	2	6	651	656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012657	ATA	2	6	685	690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012657	AT	4	8	692	699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012657	TA	3	6	723	728	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012657	AAT	2	6	739	744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012657	TGA	2	6	749	754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012657	AT	3	6	764	769	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012657	ATA	2	6	803	808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012657	A	6	6	814	819	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012657	A	6	6	832	837	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012657	ACA	2	6	863	868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_012657	TA	4	8	897	904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012657	AAAT	2	8	963	970	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012657	ATTT	2	8	985	992	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012657	TTA	2	6	998	1003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012657	CTAAT	2	10	1036	1045	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_012657	ATA	2	6	1059	1064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012657	A	7	7	1064	1070	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012657	TAC	2	6	1090	1095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_012657	AGTA	2	8	1105	1112	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012657	TCTA	2	8	1138	1145	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_012657	A	7	7	1145	1151	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012657	A	6	6	1156	1161	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012657	T	7	7	1179	1185	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012657	TAT	2	6	1292	1297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012657	ATAA	2	8	1302	1309	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012657	CTT	2	6	1378	1383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_012657	TATAA	2	10	1414	1423	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012657	A	6	6	1422	1427	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012657	TTTAA	2	10	1543	1552	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012657	ATTT	2	8	1557	1564	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012657	TA	3	6	1646	1651	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012657	TA	3	6	1736	1741	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012657	TTA	2	6	1775	1780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012657	TAT	2	6	1813	1818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012657	TTAT	2	8	1842	1849	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012657	T	7	7	1866	1872	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012657	ATTT	2	8	1911	1918	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012657	T	7	7	1916	1922	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012657	T	6	6	1942	1947	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012657	TTA	2	6	1951	1956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012657	T	6	6	1975	1980	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012657	TA	3	6	2003	2008	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012657	TA	3	6	2025	2030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012657	CCT	2	6	2414	2419	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_012657	TTC	2	6	2438	2443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_012657	ATT	2	6	2462	2467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012657	CTCC	3	12	2533	2544	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
67	NC_012657	TAA	2	6	2558	2563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012657	T	6	6	2594	2599	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012657	CAAC	2	8	2652	2659	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_012657	TACT	2	8	2765	2772	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_012657	T	6	6	2793	2798	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012657	ACCA	2	8	2814	2821	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_012657	CTA	2	6	2838	2843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_012657	ATT	2	6	2895	2900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012657	T	6	6	2910	2915	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012657	CAT	2	6	2950	2955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_012657	T	9	9	2955	2963	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012657	ATT	2	6	2982	2987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012657	ATT	2	6	3012	3017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012657	A	6	6	3093	3098	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012657	TAAT	2	8	3145	3152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012657	AT	3	6	3151	3156	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012657	TCTAT	2	10	3159	3168	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_012657	T	9	9	3314	3322	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012657	T	6	6	3337	3342	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012657	TTAA	2	8	3347	3354	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012657	ATATT	2	10	3364	3373	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012657	TAAA	2	8	3416	3423	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012657	TA	3	6	3429	3434	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012657	ATTT	2	8	3440	3447	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012657	TCA	2	6	3468	3473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_012657	TTTC	2	8	3495	3502	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_012657	A	6	6	3510	3515	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012657	CTT	2	6	3520	3525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_012657	T	6	6	3524	3529	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012657	AAT	2	6	3537	3542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012657	TCC	2	6	3555	3560	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_012657	CAA	2	6	3572	3577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_012657	ATC	2	6	3587	3592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_012657	AAAT	2	8	3594	3601	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012657	AACT	2	8	3610	3617	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_012657	TAA	2	6	3650	3655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012657	A	7	7	3689	3695	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012657	TCT	2	6	3696	3701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_012657	TTA	2	6	3749	3754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_012657	TTA	2	6	3766	3771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012657	TA	3	6	3770	3775	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012657	TA	3	6	3780	3785	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012657	TA	3	6	3805	3810	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012657	AT	3	6	3822	3827	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012657	ATT	2	6	3832	3837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012657	AATA	2	8	3950	3957	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012657	CAAA	2	8	4060	4067	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_012657	TAT	2	6	4093	4098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012657	ATA	2	6	4106	4111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012657	TTA	2	6	4112	4117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012657	CTT	2	6	4125	4130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_012657	ATA	2	6	4735	4740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012657	TA	4	8	4744	4751	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_012657	TA	4	8	4755	4762	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_012657	TA	3	6	4789	4794	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012657	A	6	6	4794	4799	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012657	TA	4	8	4806	4813	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_012657	TTA	3	9	4816	4824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012657	TA	3	6	4823	4828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_012657	TTTA	2	8	4855	4862	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_012657	AT	3	6	4871	4876	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012657	TA	3	6	4883	4888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_012657	A	6	6	4888	4893	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_012657	TATGT	2	10	4898	4907	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012657	TAT	2	6	4917	4922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012657	ATA	2	6	4937	4942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_012657	TCTCCA	2	12	4960	4971	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_012657	TA	3	6	4977	4982	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_012657	TAA	2	6	4990	4995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012657	ATT	2	6	5003	5008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_012657	A	6	6	5018	5023	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_012657	CTT	2	6	5042	5047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_012657	A	8	8	5094	5101	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_012657	ATA	2	6	5814	5819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_012657	AT	3	6	5865	5870	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_012657	T	6	6	5875	5880	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_012657	TATAA	2	10	5937	5946	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_012657	ATT	2	6	5949	5954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_012657	TAA	2	6	5983	5988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_012657	AAAT	2	8	5989	5996	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_012657	CTTTA	2	10	5999	6008	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
148	NC_012657	T	6	6	6025	6030	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_012657	TAA	2	6	6035	6040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_012657	TTA	2	6	6041	6046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_012657	TAA	2	6	6061	6066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_012657	TTA	2	6	6098	6103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_012657	AT	6	12	6124	6135	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_012657	TAA	2	6	6213	6218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_012657	TTA	2	6	6264	6269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_012657	TA	3	6	6268	6273	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_012657	A	7	7	6304	6310	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_012657	A	8	8	6316	6323	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_012657	TGA	2	6	6384	6389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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198	NC_012657	ATT	2	6	8325	8330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.