MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clostridium botulinum A2 str. Kyoto chromosome

Total Repeats: 25076

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012563	T	7	7	5	11	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012563	TA	3	6	17	22	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012563	T	7	7	47	53	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012563	CAA	2	6	54	59	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_012563	ATAA	2	8	73	80	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012563	TA	3	6	83	88	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012563	GTT	2	6	91	96	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012563	GGA	2	6	144	149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012563	TAA	2	6	1515	1520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012563	TTAT	2	8	1525	1532	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012563	TTG	2	6	1533	1538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012563	ATT	2	6	1611	1616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012563	TTA	2	6	1656	1661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012563	CAA	2	6	1668	1673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_012563	CTA	6	18	1677	1694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_012563	TAT	2	6	1698	1703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012563	TCTATT	2	12	1708	1719	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_012563	TAA	2	6	1737	1742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012563	AGG	2	6	1743	1748	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012563	ATT	2	6	3087	3092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012563	TA	3	6	3101	3106	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012563	AAT	2	6	3114	3119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012563	A	6	6	3127	3132	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012563	TAT	2	6	3133	3138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012563	TAAT	2	8	3143	3150	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012563	AGG	2	6	4548	4553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012563	ATA	2	6	9040	9045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012563	TTA	2	6	9075	9080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012563	AAC	2	6	9098	9103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_012563	A	9	9	9134	9142	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012563	TTAA	2	8	9172	9179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012563	ATA	2	6	9201	9206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012563	TAA	2	6	9255	9260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012563	A	6	6	9282	9287	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012563	AAC	2	6	9301	9306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_012563	GGC	2	6	9484	9489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_012563	CTTC	2	8	9521	9528	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_012563	GCG	2	6	9542	9547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_012563	ATA	2	6	9620	9625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012563	GGTAA	2	10	9697	9706	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012563	GCA	2	6	9794	9799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_012563	GCA	2	6	9834	9839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_012563	CGC	2	6	9841	9846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_012563	TGA	2	6	9852	9857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012563	AGG	2	6	9910	9915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012563	CAG	2	6	9937	9942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_012563	GAA	2	6	10129	10134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012563	GGC	2	6	10148	10153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_012563	AGC	2	6	10357	10362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_012563	GAA	2	6	10392	10397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012563	GGT	2	6	10465	10470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012563	GTC	2	6	10479	10484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_012563	TCGTG	2	10	10488	10497	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
54	NC_012563	TTA	2	6	10536	10541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012563	AGG	2	6	10589	10594	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012563	ATC	2	6	10614	10619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_012563	AC	3	6	10641	10646	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_012563	GGTA	2	8	10657	10664	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012563	AC	3	6	10810	10815	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_012563	CCT	2	6	10951	10956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_012563	AGAA	2	8	10970	10977	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012563	TTCT	2	8	10983	10990	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_012563	GA	3	6	11017	11022	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012563	TC	3	6	11027	11032	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_012563	ATC	2	6	11071	11076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_012563	TA	3	6	11148	11153	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012563	GAA	2	6	11229	11234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012563	GGA	2	6	11392	11397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012563	AGAA	2	8	11400	11407	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012563	GCG	2	6	11426	11431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_012563	AGA	2	6	11492	11497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012563	ACC	2	6	11628	11633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_012563	TAC	2	6	11647	11652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_012563	GGA	2	6	11942	11947	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012563	CGT	2	6	12055	12060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_012563	TAG	2	6	12105	12110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012563	TAAGT	2	10	12231	12240	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012563	AGC	2	6	12287	12292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_012563	ACC	2	6	12366	12371	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_012563	ACC	2	6	12616	12621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_012563	AGGT	2	8	12830	12837	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012563	GAG	2	6	12838	12843	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012563	GAA	2	6	12862	12867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012563	CGG	2	6	13085	13090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_012563	TGCT	2	8	13217	13224	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_012563	ACC	2	6	13356	13361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_012563	CGG	2	6	13384	13389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_012563	CCT	2	6	13444	13449	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_012563	CG	3	6	13497	13502	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_012563	GGT	2	6	13580	13585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012563	TCG	2	6	13695	13700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_012563	CGT	2	6	13775	13780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_012563	GAG	2	6	13824	13829	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012563	GAA	2	6	13999	14004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012563	TAA	2	6	14061	14066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012563	AAAAT	2	10	14082	14091	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012563	GA	3	6	14107	14112	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012563	A	7	7	14119	14125	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_012563	A	7	7	14151	14157	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_012563	ACA	3	9	14294	14302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_012563	CCA	2	6	14375	14380	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_012563	CCA	2	6	14454	14459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_012563	T	7	7	14498	14504	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012563	A	6	6	14515	14520	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012563	TAA	2	6	14540	14545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_012563	ATT	2	6	14552	14557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012563	TAA	2	6	14572	14577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012563	TA	3	6	14583	14588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012563	GGT	2	6	15080	15085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012563	ATA	2	6	19470	19475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012563	T	6	6	19530	19535	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012563	ATA	2	6	19560	19565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012563	TA	3	6	19570	19575	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012563	AATT	2	8	19579	19586	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012563	GA	3	6	20382	20387	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012563	AGG	2	6	21803	21808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012563	TTA	2	6	22227	22232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_012563	AG	3	6	22296	22301	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012563	TAA	2	6	22320	22325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_012563	AG	3	6	22391	22396	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_012563	T	7	7	22463	22469	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012563	ATTAT	2	10	22470	22479	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012563	TATT	2	8	22507	22514	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_012563	AATA	2	8	22524	22531	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012563	ATT	2	6	23826	23831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_012563	TA	4	8	23846	23853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_012563	TTTAA	2	10	23854	23863	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012563	ATTAA	2	10	23874	23883	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_012563	TAT	2	6	23913	23918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_012563	TAAA	2	8	23923	23930	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012563	TATTT	2	10	23946	23955	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012563	TAA	2	6	23966	23971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_012563	AAT	2	6	24067	24072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_012563	GA	3	6	24097	24102	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_012563	TC	3	6	24176	24181	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_012563	T	6	6	24325	24330	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_012563	A	6	6	24336	24341	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_012563	TTA	2	6	24366	24371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_012563	GAA	2	6	24429	24434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_012563	AAT	2	6	24444	24449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_012563	ATTT	2	8	24479	24486	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_012563	TAG	2	6	24490	24495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_012563	TA	4	8	24512	24519	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_012563	AAT	2	6	24520	24525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_012563	AT	3	6	24533	24538	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_012563	AT	3	6	24543	24548	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_012563	TTA	2	6	24567	24572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_012563	A	8	8	24592	24599	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_012563	GA	3	6	24604	24609	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_012563	TC	3	6	24683	24688	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_012563	TA	3	6	24698	24703	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_012563	TAT	2	6	24836	24841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_012563	AT	3	6	24876	24881	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_012563	ATAA	2	8	24965	24972	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_012563	A	6	6	25890	25895	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_012563	ATTA	2	8	25921	25928	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_012563	TAC	2	6	27592	27597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_012563	CT	3	6	27598	27603	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
159	NC_012563	TAAA	2	8	27628	27635	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_012563	TTA	2	6	27656	27661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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162	NC_012563	AT	3	6	28008	28013	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_012563	TAC	2	6	28016	28021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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165	NC_012563	ATT	2	6	28049	28054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_012563	AT	3	6	28105	28110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_012563	TAA	2	6	28138	28143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_012563	TAAAAG	2	12	28149	28160	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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171	NC_012563	T	6	6	28282	28287	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_012563	ATATA	2	10	28325	28334	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_012563	ATA	2	6	28337	28342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_012563	TAT	2	6	28345	28350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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176	NC_012563	TA	3	6	30028	30033	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
177	NC_012563	TAT	2	6	30050	30055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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179	NC_012563	AT	3	6	30073	30078	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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182	NC_012563	A	7	7	31368	31374	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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184	NC_012563	TA	3	6	31389	31394	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_012563	AATA	2	8	31395	31402	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_012563	AT	3	6	31865	31870	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_012563	AAT	2	6	31889	31894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
188	NC_012563	TATT	2	8	31910	31917	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
189	NC_012563	TAA	2	6	31919	31924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_012563	TTA	2	6	31968	31973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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229	NC_012563	TAT	2	6	38204	38209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
230	NC_012563	TA	3	6	38223	38228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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241	NC_012563	TA	4	8	39515	39522	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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287	NC_012563	GA	3	6	44430	44435	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
288	NC_012563	TC	3	6	44440	44445	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
289	NC_012563	GTTT	2	8	44465	44472	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
290	NC_012563	ATA	2	6	44492	44497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
291	NC_012563	GAA	2	6	44637	44642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
292	NC_012563	GGA	2	6	44800	44805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
293	NC_012563	AGAA	2	8	44808	44815	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
294	NC_012563	GCG	2	6	44834	44839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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