MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Chloroflexus sp. Y-400-fl chromosome

Total Repeats: 20181

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
20001	NC_012032	GA	3	6	5211163	5211168	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20002	NC_012032	A	6	6	5211226	5211231	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20003	NC_012032	CTAC	2	8	5211243	5211250	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
20004	NC_012032	ACC	2	6	5211283	5211288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20005	NC_012032	GCTC	2	8	5211329	5211336	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
20006	NC_012032	GCTC	2	8	5211406	5211413	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
20007	NC_012032	CGC	2	6	5211453	5211458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20008	NC_012032	GGT	2	6	5211497	5211502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20009	NC_012032	C	6	6	5211507	5211512	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
20010	NC_012032	AGGGT	2	10	5211522	5211531	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
20011	NC_012032	TCA	2	6	5211582	5211587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20012	NC_012032	CGC	2	6	5211595	5211600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20013	NC_012032	AC	3	6	5211665	5211670	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20014	NC_012032	CAC	2	6	5211708	5211713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20015	NC_012032	TAC	2	6	5211748	5211753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20016	NC_012032	ACA	2	6	5211764	5211769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20017	NC_012032	CCA	2	6	5211772	5211777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20018	NC_012032	ACA	2	6	5211816	5211821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20019	NC_012032	CCA	2	6	5211922	5211927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20020	NC_012032	CA	3	6	5211934	5211939	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20021	NC_012032	ACA	2	6	5213423	5213428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20022	NC_012032	ACG	2	6	5213801	5213806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20023	NC_012032	AGG	2	6	5213838	5213843	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20024	NC_012032	GGAAGA	2	12	5215448	5215459	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20025	NC_012032	A	6	6	5215459	5215464	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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20028	NC_012032	CAT	2	6	5215571	5215576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20029	NC_012032	T	6	6	5215623	5215628	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20030	NC_012032	ATG	2	6	5217135	5217140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20031	NC_012032	ATCCAC	2	12	5217159	5217170	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
20032	NC_012032	AG	3	6	5217179	5217184	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20033	NC_012032	GGA	2	6	5217230	5217235	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20034	NC_012032	CAC	2	6	5217245	5217250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20035	NC_012032	ACGG	2	8	5217694	5217701	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
20036	NC_012032	TGT	2	6	5218328	5218333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20037	NC_012032	AC	3	6	5218337	5218342	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20038	NC_012032	ACGGG	2	10	5218347	5218356	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
20039	NC_012032	CCCGT	2	10	5218365	5218374	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
20040	NC_012032	AGC	2	6	5219671	5219676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20041	NC_012032	TGC	2	6	5219680	5219685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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20043	NC_012032	GTA	2	6	5220476	5220481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20044	NC_012032	CTT	2	6	5221928	5221933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20045	NC_012032	TTG	2	6	5221989	5221994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20046	NC_012032	TCC	2	6	5223972	5223977	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20047	NC_012032	CT	3	6	5224021	5224026	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20048	NC_012032	TGT	2	6	5224959	5224964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20049	NC_012032	AAT	2	6	5224974	5224979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20050	NC_012032	CAGT	2	8	5226247	5226254	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20051	NC_012032	CAG	2	6	5226258	5226263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20052	NC_012032	ACA	2	6	5226297	5226302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20053	NC_012032	TA	3	6	5227035	5227040	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20054	NC_012032	AT	3	6	5227079	5227084	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20055	NC_012032	GAA	2	6	5227093	5227098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20056	NC_012032	AT	3	6	5227099	5227104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20057	NC_012032	GGCACA	2	12	5227195	5227206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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20059	NC_012032	GTGC	2	8	5227349	5227356	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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20073	NC_012032	ATC	2	6	5238325	5238330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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20092	NC_012032	CGAG	2	8	5244235	5244242	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
20093	NC_012032	GTC	2	6	5244256	5244261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20094	NC_012032	GCCT	2	8	5244263	5244270	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
20095	NC_012032	CAC	2	6	5244397	5244402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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20117	NC_012032	AAAG	2	8	5249599	5249606	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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20121	NC_012032	CA	3	6	5250431	5250436	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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20127	NC_012032	C	6	6	5250658	5250663	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
20128	NC_012032	GGGC	2	8	5250709	5250716	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
20129	NC_012032	GGCA	2	8	5250737	5250744	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
20130	NC_012032	GAT	2	6	5250786	5250791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20131	NC_012032	TGA	2	6	5250828	5250833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20132	NC_012032	G	6	6	5250927	5250932	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
20133	NC_012032	GGGC	2	8	5250951	5250958	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
20134	NC_012032	GGCA	2	8	5250979	5250986	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
20135	NC_012032	GAT	2	6	5251028	5251033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20136	NC_012032	TGA	2	6	5251070	5251075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20137	NC_012032	TTC	2	6	5251104	5251109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20138	NC_012032	G	6	6	5251169	5251174	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
20139	NC_012032	GGGC	2	8	5251193	5251200	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
20140	NC_012032	GGCA	2	8	5251221	5251228	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
20141	NC_012032	GAT	2	6	5251270	5251275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20142	NC_012032	TAT	3	9	5253630	5253638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20143	NC_012032	ACA	2	6	5253739	5253744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20144	NC_012032	TTC	2	6	5254497	5254502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20145	NC_012032	CAC	2	6	5255330	5255335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20146	NC_012032	ATG	2	6	5255423	5255428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20147	NC_012032	GTT	2	6	5260513	5260518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20148	NC_012032	AAC	2	6	5261961	5261966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20149	NC_012032	AC	3	6	5262026	5262031	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20150	NC_012032	TAG	2	6	5262053	5262058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20151	NC_012032	ACGCAC	2	12	5262069	5262080	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
20152	NC_012032	CTA	2	6	5263580	5263585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20153	NC_012032	CAC	2	6	5263591	5263596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20154	NC_012032	CAT	2	6	5263602	5263607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20155	NC_012032	CGG	2	6	5263616	5263621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20156	NC_012032	GAG	2	6	5263623	5263628	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20157	NC_012032	CAGC	2	8	5263663	5263670	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
20158	NC_012032	CCTG	2	8	5263796	5263803	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
20159	NC_012032	ATG	2	6	5265743	5265748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20160	NC_012032	CGT	2	6	5265838	5265843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20161	NC_012032	CGT	2	6	5265979	5265984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20162	NC_012032	GGA	2	6	5265994	5265999	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20163	NC_012032	CA	3	6	5266276	5266281	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20164	NC_012032	AGC	2	6	5266290	5266295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20165	NC_012032	TTC	2	6	5266299	5266304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20166	NC_012032	TCCTT	2	10	5267617	5267626	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
20167	NC_012032	TTC	2	6	5267718	5267723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20168	NC_012032	GCA	2	6	5268406	5268411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20169	NC_012032	ACA	2	6	5268444	5268449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20170	NC_012032	CAG	2	6	5268480	5268485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20171	NC_012032	AG	3	6	5268484	5268489	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20172	NC_012032	GAG	2	6	5268499	5268504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20173	NC_012032	ACC	2	6	5268521	5268526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20174	NC_012032	CGC	2	6	5268570	5268575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20175	NC_012032	GGC	2	6	5268608	5268613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20176	NC_012032	TGGAA	2	10	5268650	5268659	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
20177	NC_012032	ACA	2	6	5268699	5268704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20178	NC_012032	CCG	2	6	5268711	5268716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20179	NC_012032	AC	3	6	5268756	5268761	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20180	NC_012032	CCT	2	6	5268813	5268818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20181	NC_012032	ATCCAC	2	12	5268841	5268852	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding

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