MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Chloroflexus sp. Y-400-fl chromosome

Total Repeats: 20181

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19501	NC_012032	CGA	2	6	5013837	5013842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19502	NC_012032	CTT	2	6	5013849	5013854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19503	NC_012032	ACT	2	6	5013860	5013865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19504	NC_012032	CAG	2	6	5013891	5013896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19505	NC_012032	GCG	2	6	5013970	5013975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19506	NC_012032	CTG	2	6	5014062	5014067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19507	NC_012032	GCG	2	6	5014071	5014076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19508	NC_012032	ACG	2	6	5014149	5014154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19509	NC_012032	TGC	2	6	5014165	5014170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19510	NC_012032	TGC	2	6	5014175	5014180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19511	NC_012032	AGT	2	6	5014215	5014220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19512	NC_012032	ATC	2	6	5014344	5014349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19513	NC_012032	CGCT	2	8	5014357	5014364	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19514	NC_012032	GCGCAC	2	12	5014408	5014419	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
19515	NC_012032	TGG	2	6	5014426	5014431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19516	NC_012032	G	6	6	5014528	5014533	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
19517	NC_012032	GTG	2	6	5014564	5014569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19518	NC_012032	GA	3	6	5014674	5014679	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19519	NC_012032	GCCT	2	8	5015887	5015894	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19520	NC_012032	TTA	2	6	5015966	5015971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19521	NC_012032	GCAT	2	8	5015992	5015999	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19522	NC_012032	ACC	2	6	5016175	5016180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19523	NC_012032	TTTA	2	8	5016220	5016227	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19524	NC_012032	CAG	2	6	5027499	5027504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19525	NC_012032	AAC	2	6	5029189	5029194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19526	NC_012032	CTC	2	6	5030704	5030709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19527	NC_012032	AAT	2	6	5030823	5030828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19528	NC_012032	AAT	3	9	5030858	5030866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19529	NC_012032	AT	3	6	5030919	5030924	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19530	NC_012032	TGTTT	2	10	5030999	5031008	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
19531	NC_012032	TCA	2	6	5031033	5031038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19532	NC_012032	ACAG	2	8	5031899	5031906	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
19533	NC_012032	CAG	2	6	5031921	5031926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19534	NC_012032	ACA	2	6	5031927	5031932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19535	NC_012032	CCG	2	6	5031940	5031945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19536	NC_012032	CT	3	6	5031978	5031983	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19537	NC_012032	ACC	2	6	5031985	5031990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19538	NC_012032	ATG	2	6	5032010	5032015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19539	NC_012032	C	6	6	5032030	5032035	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
19540	NC_012032	ACC	2	6	5032570	5032575	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19541	NC_012032	AAT	2	6	5032663	5032668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19542	NC_012032	CT	3	6	5032730	5032735	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19543	NC_012032	TCCC	2	8	5032740	5032747	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
19544	NC_012032	ATA	2	6	5032766	5032771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19545	NC_012032	GGGGA	2	10	5032842	5032851	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
19546	NC_012032	CGA	2	6	5037420	5037425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19547	NC_012032	AC	3	6	5037498	5037503	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19548	NC_012032	AC	3	6	5037528	5037533	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19549	NC_012032	AC	3	6	5037558	5037563	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19550	NC_012032	AC	3	6	5037618	5037623	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19551	NC_012032	CCA	2	6	5037630	5037635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19552	NC_012032	CCA	2	6	5037690	5037695	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19553	NC_012032	CCAA	2	8	5037701	5037708	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19554	NC_012032	AC	3	6	5037888	5037893	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19555	NC_012032	AC	3	6	5037918	5037923	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19556	NC_012032	AC	3	6	5037948	5037953	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19557	NC_012032	AC	3	6	5037978	5037983	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19558	NC_012032	CCA	2	6	5038092	5038097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19559	NC_012032	CCAA	2	8	5038103	5038110	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19560	NC_012032	CCA	2	6	5038242	5038247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19561	NC_012032	CGA	2	6	5038278	5038283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19562	NC_012032	ACCA	2	8	5038288	5038295	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19563	NC_012032	CGA	2	6	5038308	5038313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19564	NC_012032	ACCA	2	8	5038318	5038325	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19565	NC_012032	AGT	2	6	5038348	5038353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19566	NC_012032	CTA	2	6	5038375	5038380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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19569	NC_012032	CCA	2	6	5038452	5038457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19570	NC_012032	GAC	2	6	5038534	5038539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19571	NC_012032	ACT	2	6	5038849	5038854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19572	NC_012032	TAGT	2	8	5050914	5050921	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19573	NC_012032	CAG	3	9	5050957	5050965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19574	NC_012032	GGGGA	2	10	5051753	5051762	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
19575	NC_012032	CCTGA	2	10	5055271	5055280	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
19576	NC_012032	CGG	2	6	5055288	5055293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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19578	NC_012032	GTT	2	6	5055318	5055323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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19584	NC_012032	G	6	6	5066817	5066822	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
19585	NC_012032	CAC	2	6	5067926	5067931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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19588	NC_012032	CA	3	6	5068024	5068029	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19589	NC_012032	CGGAGA	2	12	5068062	5068073	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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19591	NC_012032	GCA	2	6	5068187	5068192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19592	NC_012032	CTG	2	6	5068195	5068200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19593	NC_012032	GCA	2	6	5068204	5068209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19594	NC_012032	CCA	2	6	5068210	5068215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19595	NC_012032	CCAT	2	8	5068227	5068234	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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19599	NC_012032	CCG	2	6	5072150	5072155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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19604	NC_012032	GCG	2	6	5080854	5080859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19605	NC_012032	CTC	2	6	5080863	5080868	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19606	NC_012032	CT	3	6	5083023	5083028	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19607	NC_012032	AAG	2	6	5085199	5085204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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19609	NC_012032	TGT	2	6	5085914	5085919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19610	NC_012032	ATA	2	6	5085920	5085925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19611	NC_012032	ATC	3	9	5085946	5085954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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19626	NC_012032	GTG	2	6	5090253	5090258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19627	NC_012032	GAT	2	6	5090284	5090289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19628	NC_012032	CAT	2	6	5090293	5090298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19629	NC_012032	CGG	2	6	5090302	5090307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19630	NC_012032	CGGT	2	8	5090355	5090362	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19631	NC_012032	GAA	2	6	5090416	5090421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19632	NC_012032	ACG	2	6	5090447	5090452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19633	NC_012032	CGA	2	6	5090458	5090463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19634	NC_012032	GCCT	2	8	5090481	5090488	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19635	NC_012032	ACG	2	6	5090493	5090498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19636	NC_012032	ATC	2	6	5090610	5090615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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19639	NC_012032	TC	4	8	5090694	5090701	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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19641	NC_012032	GCGA	2	8	5090746	5090753	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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19649	NC_012032	ACC	2	6	5091272	5091277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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19654	NC_012032	TAC	2	6	5092728	5092733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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19657	NC_012032	GTT	2	6	5092778	5092783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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19659	NC_012032	CCA	2	6	5092819	5092824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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19661	NC_012032	GT	3	6	5092853	5092858	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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19686	NC_012032	CCAT	2	8	5115805	5115812	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
19687	NC_012032	ACA	2	6	5115847	5115852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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19695	NC_012032	AG	3	6	5119071	5119076	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19696	NC_012032	ACAT	2	8	5119121	5119128	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19697	NC_012032	ATTC	2	8	5120146	5120153	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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19743	NC_012032	TTGT	2	8	5134648	5134655	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
19744	NC_012032	ATT	2	6	5134702	5134707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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19752	NC_012032	AGCG	2	8	5136070	5136077	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19753	NC_012032	CAT	2	6	5136081	5136086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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