MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Chloroflexus sp. Y-400-fl chromosome

Total Repeats: 20181

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_012032	TTC	2	6	4912817	4912822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19002	NC_012032	CT	3	6	4912885	4912890	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19003	NC_012032	CTG	2	6	4912913	4912918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19004	NC_012032	GTC	2	6	4912959	4912964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19005	NC_012032	GC	3	6	4912977	4912982	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19006	NC_012032	TCGC	2	8	4913028	4913035	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19007	NC_012032	CTA	2	6	4913038	4913043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19008	NC_012032	TCC	2	6	4913061	4913066	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19009	NC_012032	GTGCC	2	10	4913195	4913204	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
19010	NC_012032	TCCT	2	8	4913208	4913215	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19011	NC_012032	CATC	2	8	4913234	4913241	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
19012	NC_012032	TCA	2	6	4913248	4913253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19013	NC_012032	TCCG	2	8	4913259	4913266	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19014	NC_012032	TGA	2	6	4913327	4913332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19015	NC_012032	TC	4	8	4913340	4913347	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19016	NC_012032	A	7	7	4913389	4913395	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19017	NC_012032	CTGCG	2	10	4913410	4913419	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
19018	NC_012032	GAC	2	6	4913425	4913430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19019	NC_012032	TCC	2	6	4913467	4913472	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19020	NC_012032	CAA	2	6	4913544	4913549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19021	NC_012032	CGA	2	6	4913613	4913618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19022	NC_012032	GAA	2	6	4913650	4913655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19023	NC_012032	T	6	6	4913685	4913690	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19024	NC_012032	GAG	2	6	4914437	4914442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19025	NC_012032	GTT	2	6	4915025	4915030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19026	NC_012032	CT	3	6	4916722	4916727	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19027	NC_012032	GAC	2	6	4916735	4916740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19028	NC_012032	ATG	2	6	4916771	4916776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19029	NC_012032	AGC	2	6	4916777	4916782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19030	NC_012032	ATTC	2	8	4917465	4917472	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19031	NC_012032	GAA	2	6	4917493	4917498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19032	NC_012032	CCA	2	6	4918741	4918746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19033	NC_012032	ATC	2	6	4918751	4918756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19034	NC_012032	CTTCA	2	10	4918778	4918787	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
19035	NC_012032	GC	3	6	4918885	4918890	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19036	NC_012032	CAT	2	6	4918937	4918942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19037	NC_012032	TGC	2	6	4918976	4918981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19038	NC_012032	ATC	2	6	4919062	4919067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19039	NC_012032	ACA	2	6	4919149	4919154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19040	NC_012032	CGA	2	6	4922160	4922165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19041	NC_012032	GTA	2	6	4922187	4922192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19042	NC_012032	CCG	2	6	4922324	4922329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19043	NC_012032	AG	3	6	4922368	4922373	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19044	NC_012032	TTA	2	6	4922391	4922396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19045	NC_012032	TCA	2	6	4922443	4922448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19046	NC_012032	CCG	2	6	4922535	4922540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19047	NC_012032	AG	3	6	4922579	4922584	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19048	NC_012032	TTA	2	6	4922602	4922607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19049	NC_012032	A	6	6	4922620	4922625	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19050	NC_012032	TCA	2	6	4922655	4922660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19051	NC_012032	AG	3	6	4922791	4922796	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19052	NC_012032	CGG	2	6	4922804	4922809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19053	NC_012032	TTA	2	6	4922814	4922819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19054	NC_012032	CAC	2	6	4922851	4922856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19055	NC_012032	TTG	2	6	4922863	4922868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19056	NC_012032	GTA	2	6	4922924	4922929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19057	NC_012032	AAT	3	9	4922931	4922939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19058	NC_012032	ATA	2	6	4922941	4922946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19059	NC_012032	TAAA	2	8	4922967	4922974	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19060	NC_012032	TCA	2	6	4923493	4923498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19061	NC_012032	ATA	2	6	4923588	4923593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19062	NC_012032	ACG	2	6	4924595	4924600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19063	NC_012032	TC	3	6	4924620	4924625	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19064	NC_012032	CAT	2	6	4924635	4924640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19065	NC_012032	CGC	2	6	4924652	4924657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19066	NC_012032	GTTC	2	8	4925926	4925933	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
19067	NC_012032	CTA	2	6	4926073	4926078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19068	NC_012032	GAT	2	6	4926116	4926121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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19070	NC_012032	ACC	2	6	4926148	4926153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19071	NC_012032	CGT	2	6	4926190	4926195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19072	NC_012032	CGA	2	6	4926238	4926243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19073	NC_012032	GGC	2	6	4926283	4926288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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19075	NC_012032	CCCG	2	8	4926375	4926382	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
19076	NC_012032	CGA	2	6	4926699	4926704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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19081	NC_012032	CCA	2	6	4927899	4927904	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19082	NC_012032	CAG	2	6	4927917	4927922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19083	NC_012032	AGCGC	2	10	4927938	4927947	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
19084	NC_012032	TACGCG	2	12	4927985	4927996	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19085	NC_012032	AAC	2	6	4928000	4928005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19086	NC_012032	CCGAC	2	10	4928019	4928028	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
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19092	NC_012032	CGT	2	6	4929380	4929385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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19095	NC_012032	CCGAC	2	10	4929519	4929528	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
19096	NC_012032	CAT	2	6	4929533	4929538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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19101	NC_012032	TTG	2	6	4931051	4931056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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19104	NC_012032	CCG	2	6	4931787	4931792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19105	NC_012032	CAGC	2	8	4931937	4931944	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
19106	NC_012032	CA	3	6	4931953	4931958	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19107	NC_012032	TGC	2	6	4931979	4931984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19108	NC_012032	AGC	2	6	4931992	4931997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19109	NC_012032	CAA	2	6	4932126	4932131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19110	NC_012032	T	6	6	4933089	4933094	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19111	NC_012032	ACGA	2	8	4933118	4933125	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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19114	NC_012032	TGCG	2	8	4933194	4933201	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19115	NC_012032	GCT	2	6	4933308	4933313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19116	NC_012032	ACCA	2	8	4933345	4933352	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19117	NC_012032	TC	3	6	4933389	4933394	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19118	NC_012032	CAT	2	6	4933403	4933408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19119	NC_012032	CAG	2	6	4933412	4933417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19120	NC_012032	AGCGC	2	10	4933433	4933442	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
19121	NC_012032	CGG	3	9	4933443	4933451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19122	NC_012032	AAC	2	6	4933495	4933500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19123	NC_012032	CCGAC	2	10	4933514	4933523	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
19124	NC_012032	CTGGCG	2	12	4933615	4933626	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
19125	NC_012032	CGG	3	9	4933662	4933670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19126	NC_012032	CGC	2	6	4933686	4933691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19127	NC_012032	TCG	2	6	4933757	4933762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19128	NC_012032	TGT	2	6	4933826	4933831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19129	NC_012032	GCAAG	2	10	4933836	4933845	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
19130	NC_012032	CGA	2	6	4933902	4933907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19131	NC_012032	CAT	2	6	4934004	4934009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19132	NC_012032	GACC	2	8	4934031	4934038	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
19133	NC_012032	TGG	2	6	4934981	4934986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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19136	NC_012032	TC	3	6	4936656	4936661	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19137	NC_012032	CAT	2	6	4936671	4936676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19138	NC_012032	CGC	2	6	4936688	4936693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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19143	NC_012032	AGG	2	6	4938475	4938480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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19145	NC_012032	ACGCC	2	10	4938508	4938517	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
19146	NC_012032	CG	3	6	4938526	4938531	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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19151	NC_012032	CGGCA	2	10	4940329	4940338	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
19152	NC_012032	TCG	2	6	4940360	4940365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19153	NC_012032	CATC	2	8	4940380	4940387	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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19158	NC_012032	TCC	2	6	4941001	4941006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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19160	NC_012032	GCG	2	6	4941077	4941082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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19162	NC_012032	TCC	2	6	4941352	4941357	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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19165	NC_012032	ACA	2	6	4941634	4941639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19166	NC_012032	GCCT	2	8	4942223	4942230	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19167	NC_012032	GGTT	2	8	4942238	4942245	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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19180	NC_012032	TCTCC	2	10	4943876	4943885	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
19181	NC_012032	CT	3	6	4943887	4943892	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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19186	NC_012032	CT	3	6	4944003	4944008	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19187	NC_012032	CCTC	2	8	4944009	4944016	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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19252	NC_012032	TC	3	6	4954926	4954931	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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19254	NC_012032	CCT	2	6	4954999	4955004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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19262	NC_012032	GATT	2	8	4955170	4955177	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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19500	NC_012032	AC	3	6	5013755	5013760	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

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