MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Chloroflexus sp. Y-400-fl chromosome

Total Repeats: 20181

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18502	NC_012032	GCTGT	2	10	4777163	4777172	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
18503	NC_012032	AGC	2	6	4777255	4777260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18504	NC_012032	GAC	2	6	4777271	4777276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18505	NC_012032	GCA	2	6	4777353	4777358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18506	NC_012032	GCA	2	6	4777367	4777372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18507	NC_012032	CTG	2	6	4777411	4777416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18508	NC_012032	GAT	2	6	4777420	4777425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18509	NC_012032	CTT	2	6	4777463	4777468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18510	NC_012032	TC	4	8	4777492	4777499	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18511	NC_012032	ACC	2	6	4777507	4777512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18512	NC_012032	CCA	2	6	4781433	4781438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18513	NC_012032	GCA	2	6	4781449	4781454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18514	NC_012032	GAAG	2	8	4781523	4781530	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18515	NC_012032	CCA	2	6	4781545	4781550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18516	NC_012032	GCA	2	6	4781561	4781566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18517	NC_012032	CCA	2	6	4781657	4781662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18518	NC_012032	GCA	2	6	4781673	4781678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18519	NC_012032	CCA	2	6	4781769	4781774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18520	NC_012032	GCA	2	6	4781785	4781790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18521	NC_012032	CCA	2	6	4781881	4781886	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18522	NC_012032	GCA	2	6	4781897	4781902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18523	NC_012032	GAAG	2	8	4781971	4781978	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18524	NC_012032	CCA	2	6	4781993	4781998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18525	NC_012032	GCA	2	6	4782009	4782014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18529	NC_012032	CTCG	2	8	4783673	4783680	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18530	NC_012032	GC	3	6	4783692	4783697	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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18534	NC_012032	GCACC	2	10	4783794	4783803	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
18535	NC_012032	TC	3	6	4783933	4783938	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18536	NC_012032	TGTGT	2	10	4786521	4786530	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
18537	NC_012032	ACC	2	6	4786531	4786536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18538	NC_012032	CAA	2	6	4787196	4787201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18539	NC_012032	GCT	2	6	4787213	4787218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18540	NC_012032	ATC	2	6	4787237	4787242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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18542	NC_012032	CG	3	6	4787282	4787287	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18543	NC_012032	CG	3	6	4787305	4787310	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18544	NC_012032	ACC	2	6	4787334	4787339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18545	NC_012032	CAAC	2	8	4787353	4787360	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18546	NC_012032	GT	3	6	4787390	4787395	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18547	NC_012032	AGA	2	6	4789518	4789523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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18549	NC_012032	AGA	2	6	4789546	4789551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18550	NC_012032	AGA	2	6	4789560	4789565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18551	NC_012032	AGA	2	6	4789581	4789586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18552	NC_012032	AGGCG	2	10	4789712	4789721	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
18553	NC_012032	TCG	2	6	4789733	4789738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18554	NC_012032	CAGG	2	8	4789789	4789796	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18555	NC_012032	GAC	2	6	4789820	4789825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18556	NC_012032	ATC	2	6	4789857	4789862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18557	NC_012032	GT	3	6	4789871	4789876	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18558	NC_012032	AGCAG	2	10	4789919	4789928	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
18559	NC_012032	TAT	2	6	4789984	4789989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18560	NC_012032	TAT	2	6	4789992	4789997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18561	NC_012032	GGC	2	6	4791306	4791311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18562	NC_012032	GT	3	6	4791340	4791345	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18563	NC_012032	AAC	2	6	4791428	4791433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18564	NC_012032	CAA	2	6	4791437	4791442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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18572	NC_012032	G	7	7	4793073	4793079	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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18581	NC_012032	TA	4	8	4804091	4804098	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18592	NC_012032	CT	3	6	4805785	4805790	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18593	NC_012032	TGA	2	6	4805799	4805804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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18598	NC_012032	GTTT	2	8	4807227	4807234	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
18599	NC_012032	AT	3	6	4807240	4807245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18602	NC_012032	GCC	2	6	4807319	4807324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18603	NC_012032	AT	3	6	4807423	4807428	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18604	NC_012032	ATA	2	6	4807443	4807448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18614	NC_012032	GCG	2	6	4811387	4811392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18615	NC_012032	GCG	2	6	4811505	4811510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18616	NC_012032	GGTC	2	8	4811623	4811630	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18617	NC_012032	CG	3	6	4811652	4811657	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18618	NC_012032	CCG	2	6	4811673	4811678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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18621	NC_012032	ATC	2	6	4815659	4815664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18622	NC_012032	A	7	7	4815679	4815685	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18623	NC_012032	GTA	2	6	4816121	4816126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18624	NC_012032	GTG	2	6	4816161	4816166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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18626	NC_012032	ACA	2	6	4816268	4816273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18627	NC_012032	CGGT	2	8	4819459	4819466	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18628	NC_012032	GACC	2	8	4819479	4819486	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18629	NC_012032	CGA	2	6	4819488	4819493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18630	NC_012032	AAC	2	6	4819571	4819576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18631	NC_012032	ACG	2	6	4819641	4819646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18632	NC_012032	GCTGT	2	10	4819673	4819682	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
18633	NC_012032	GAG	2	6	4819771	4819776	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18634	NC_012032	TAA	2	6	4819780	4819785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18635	NC_012032	TTGCC	2	10	4819822	4819831	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
18636	NC_012032	TGC	2	6	4819875	4819880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18637	NC_012032	GCA	2	6	4819882	4819887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18638	NC_012032	GTC	2	6	4819967	4819972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18639	NC_012032	AAT	2	6	4819977	4819982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18641	NC_012032	T	7	7	4821063	4821069	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18642	NC_012032	CGTAT	2	10	4821635	4821644	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
18643	NC_012032	CGC	2	6	4821950	4821955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18644	NC_012032	G	7	7	4823133	4823139	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
18645	NC_012032	TGC	2	6	4823697	4823702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18646	NC_012032	TAACG	2	10	4823755	4823764	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
18647	NC_012032	ATG	2	6	4823765	4823770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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18650	NC_012032	GCAG	2	8	4823975	4823982	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18651	NC_012032	CCG	2	6	4824046	4824051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18652	NC_012032	GCCA	2	8	4824090	4824097	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18653	NC_012032	GCA	2	6	4824117	4824122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18654	NC_012032	CG	3	6	4824145	4824150	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18655	NC_012032	ACC	2	6	4824207	4824212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18656	NC_012032	GGGC	2	8	4824230	4824237	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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18658	NC_012032	CAGGT	2	10	4827538	4827547	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
18659	NC_012032	TAT	2	6	4827549	4827554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18660	NC_012032	TGA	2	6	4827623	4827628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18661	NC_012032	A	7	7	4827816	4827822	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18662	NC_012032	GGT	2	6	4827928	4827933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18663	NC_012032	ACA	2	6	4827974	4827979	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18664	NC_012032	AC	3	6	4827987	4827992	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18665	NC_012032	TCC	2	6	4828002	4828007	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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18668	NC_012032	T	6	6	4829771	4829776	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18669	NC_012032	T	7	7	4829807	4829813	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18670	NC_012032	CTCAC	2	10	4829896	4829905	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
18671	NC_012032	C	6	6	4829905	4829910	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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18676	NC_012032	C	6	6	4830011	4830016	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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18680	NC_012032	G	7	7	4830063	4830069	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
18681	NC_012032	C	6	6	4830138	4830143	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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18747	NC_012032	GT	3	6	4844140	4844145	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18748	NC_012032	TAT	2	6	4844146	4844151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18749	NC_012032	CAA	2	6	4844153	4844158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18750	NC_012032	TC	3	6	4845100	4845105	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18751	NC_012032	CGA	2	6	4845123	4845128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18752	NC_012032	GCA	2	6	4845203	4845208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18754	NC_012032	AGGCA	2	10	4845251	4845260	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
18755	NC_012032	TGC	2	6	4845294	4845299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18757	NC_012032	AGAT	2	8	4845444	4845451	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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18862	NC_012032	GGTG	2	8	4886349	4886356	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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