MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Chloroflexus sp. Y-400-fl chromosome

Total Repeats: 20181

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_012032	TCT	2	6	4612979	4612984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18002	NC_012032	CGC	2	6	4612995	4613000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18003	NC_012032	GGA	2	6	4613018	4613023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18004	NC_012032	GCG	2	6	4614111	4614116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18005	NC_012032	ATG	2	6	4614117	4614122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18006	NC_012032	TCA	2	6	4614150	4614155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18007	NC_012032	TCG	2	6	4616553	4616558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18008	NC_012032	ACA	2	6	4622465	4622470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18009	NC_012032	GTA	2	6	4623767	4623772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18010	NC_012032	GTG	2	6	4623780	4623785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18011	NC_012032	GACA	2	8	4624053	4624060	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18012	NC_012032	AAC	2	6	4624080	4624085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18013	NC_012032	TGC	2	6	4624106	4624111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18014	NC_012032	G	6	6	4626213	4626218	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
18015	NC_012032	G	6	6	4626229	4626234	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
18016	NC_012032	GAG	2	6	4626257	4626262	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18017	NC_012032	CCA	2	6	4626433	4626438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18018	NC_012032	TGGGG	2	10	4626482	4626491	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
18019	NC_012032	TGA	2	6	4631223	4631228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18020	NC_012032	CAC	2	6	4631281	4631286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18021	NC_012032	AG	3	6	4631295	4631300	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18022	NC_012032	CTT	2	6	4631318	4631323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18023	NC_012032	ATC	2	6	4631440	4631445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18024	NC_012032	ATGA	2	8	4631459	4631466	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18025	NC_012032	CTGC	2	8	4631468	4631475	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18026	NC_012032	CGG	2	6	4631545	4631550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18027	NC_012032	TGC	2	6	4631556	4631561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18028	NC_012032	GGAT	2	8	4631584	4631591	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
18029	NC_012032	ATC	2	6	4631714	4631719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18030	NC_012032	ATGA	2	8	4631733	4631740	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18031	NC_012032	CTGC	2	8	4631742	4631749	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18032	NC_012032	CGG	2	6	4631819	4631824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18033	NC_012032	TGC	2	6	4631830	4631835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18034	NC_012032	GGAT	2	8	4631858	4631865	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
18035	NC_012032	ATC	2	6	4631988	4631993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18036	NC_012032	ATGA	2	8	4632007	4632014	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18037	NC_012032	CTGC	2	8	4632016	4632023	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18038	NC_012032	CGG	2	6	4632093	4632098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18039	NC_012032	TGC	2	6	4632104	4632109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18040	NC_012032	GGAT	2	8	4632132	4632139	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
18041	NC_012032	GCA	2	6	4632182	4632187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18042	NC_012032	TGC	2	6	4632192	4632197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18043	NC_012032	GCA	2	6	4632199	4632204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18044	NC_012032	CGT	2	6	4632232	4632237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18045	NC_012032	TGTT	2	8	4632262	4632269	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
18046	NC_012032	GAT	2	6	4632286	4632291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18047	NC_012032	TGT	2	6	4632322	4632327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18048	NC_012032	TCC	2	6	4632329	4632334	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18049	NC_012032	GTG	2	6	4632343	4632348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18050	NC_012032	TAAC	2	8	4632417	4632424	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18051	NC_012032	AT	3	6	4633461	4633466	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18052	NC_012032	GAA	2	6	4634626	4634631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18053	NC_012032	CTG	2	6	4638214	4638219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18054	NC_012032	AGCAT	2	10	4638233	4638242	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
18055	NC_012032	AAC	2	6	4638712	4638717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18056	NC_012032	CTG	2	6	4638738	4638743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18057	NC_012032	GCGT	2	8	4638799	4638806	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18058	NC_012032	CCA	2	6	4638812	4638817	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18059	NC_012032	AGCAG	2	10	4638832	4638841	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
18060	NC_012032	GAA	2	6	4638880	4638885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18061	NC_012032	TGC	2	6	4638977	4638982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18062	NC_012032	GCT	2	6	4639067	4639072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18063	NC_012032	A	7	7	4639087	4639093	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18064	NC_012032	CGC	2	6	4640440	4640445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18065	NC_012032	GCATCG	2	12	4641589	4641600	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18066	NC_012032	TGGC	2	8	4641887	4641894	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18067	NC_012032	GCA	2	6	4641898	4641903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18068	NC_012032	CG	3	6	4641923	4641928	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18069	NC_012032	TCCA	2	8	4641957	4641964	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
18070	NC_012032	GGC	2	6	4641985	4641990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18071	NC_012032	GCC	2	6	4641996	4642001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18072	NC_012032	GTC	2	6	4642022	4642027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18073	NC_012032	CATG	2	8	4642082	4642089	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18074	NC_012032	GAT	2	6	4642102	4642107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18075	NC_012032	AGG	2	6	4642139	4642144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18076	NC_012032	TGC	2	6	4642148	4642153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18077	NC_012032	ACC	2	6	4642613	4642618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18078	NC_012032	GCGAC	2	10	4642716	4642725	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
18079	NC_012032	CG	3	6	4642731	4642736	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18080	NC_012032	ACC	2	6	4642764	4642769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18081	NC_012032	GTG	2	6	4642822	4642827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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18083	NC_012032	GTG	2	6	4643235	4643240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18084	NC_012032	C	6	6	4643255	4643260	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
18085	NC_012032	GTG	2	6	4645280	4645285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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18088	NC_012032	GGA	2	6	4645725	4645730	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18089	NC_012032	ATC	2	6	4645752	4645757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18090	NC_012032	GCAT	2	8	4645769	4645776	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18091	NC_012032	TTG	2	6	4645798	4645803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18092	NC_012032	GCCAC	2	10	4645890	4645899	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
18093	NC_012032	GGGTG	2	10	4645970	4645979	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
18094	NC_012032	CGTT	2	8	4647985	4647992	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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18097	NC_012032	AGA	2	6	4648997	4649002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18098	NC_012032	AGG	2	6	4649018	4649023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18099	NC_012032	GCT	2	6	4649101	4649106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18101	NC_012032	TGA	2	6	4649176	4649181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18102	NC_012032	CAC	3	9	4649278	4649286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18103	NC_012032	GC	3	6	4649326	4649331	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18104	NC_012032	CGTGTC	2	12	4649353	4649364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18105	NC_012032	TGA	2	6	4649366	4649371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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18107	NC_012032	CTG	2	6	4649480	4649485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18108	NC_012032	GC	3	6	4649517	4649522	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18109	NC_012032	TGA	2	6	4649557	4649562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18110	NC_012032	ACCC	2	8	4649610	4649617	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
18111	NC_012032	ACC	2	6	4649663	4649668	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18112	NC_012032	TTG	2	6	4650282	4650287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18113	NC_012032	TAC	2	6	4650292	4650297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18114	NC_012032	GTA	2	6	4650300	4650305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18115	NC_012032	CAC	2	6	4650339	4650344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18116	NC_012032	TGGT	2	8	4650472	4650479	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18117	NC_012032	CAC	2	6	4651492	4651497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18118	NC_012032	CCA	2	6	4651521	4651526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18119	NC_012032	CTCATC	2	12	4651592	4651603	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
18120	NC_012032	GCCCG	2	10	4651640	4651649	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
18121	NC_012032	CG	3	6	4651774	4651779	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18122	NC_012032	T	6	6	4651799	4651804	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18123	NC_012032	CCCG	2	8	4651806	4651813	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
18124	NC_012032	GGC	2	6	4651850	4651855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18125	NC_012032	GTT	2	6	4651931	4651936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18126	NC_012032	ATTG	2	8	4651937	4651944	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18127	NC_012032	GA	3	6	4653801	4653806	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18128	NC_012032	ACG	2	6	4653896	4653901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18129	NC_012032	CCT	2	6	4654508	4654513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18130	NC_012032	CAC	2	6	4654623	4654628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18131	NC_012032	CAATA	2	10	4654709	4654718	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
18132	NC_012032	ATTTT	2	10	4654724	4654733	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18133	NC_012032	T	6	6	4654730	4654735	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18134	NC_012032	ATT	2	6	4654740	4654745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18135	NC_012032	GT	3	6	4655949	4655954	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18136	NC_012032	ACC	2	6	4656002	4656007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18137	NC_012032	GCTC	2	8	4656041	4656048	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18138	NC_012032	ATC	2	6	4656049	4656054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18139	NC_012032	GTG	2	6	4656058	4656063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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18141	NC_012032	TGC	2	6	4656087	4656092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18142	NC_012032	GCA	2	6	4656342	4656347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18143	NC_012032	CGT	2	6	4656375	4656380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18144	NC_012032	CTG	2	6	4656386	4656391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18146	NC_012032	CTT	2	6	4656483	4656488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18147	NC_012032	CTC	2	6	4659795	4659800	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18148	NC_012032	TG	3	6	4659810	4659815	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18149	NC_012032	CGGA	2	8	4659825	4659832	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18150	NC_012032	CCT	2	6	4660323	4660328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18151	NC_012032	AAC	2	6	4660345	4660350	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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18154	NC_012032	GTG	2	6	4660396	4660401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18155	NC_012032	TTG	2	6	4661251	4661256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18156	NC_012032	CTG	2	6	4661305	4661310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18158	NC_012032	CCTA	2	8	4661416	4661423	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
18159	NC_012032	CAA	2	6	4661632	4661637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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18161	NC_012032	GCA	2	6	4661686	4661691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18162	NC_012032	CGC	2	6	4661706	4661711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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18164	NC_012032	TTG	2	6	4661817	4661822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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18167	NC_012032	AG	3	6	4663164	4663169	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18168	NC_012032	GCT	2	6	4663186	4663191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18170	NC_012032	GTT	2	6	4664370	4664375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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18172	NC_012032	T	7	7	4664386	4664392	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18173	NC_012032	CTA	2	6	4664422	4664427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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18180	NC_012032	GTG	2	6	4666119	4666124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18181	NC_012032	CCG	2	6	4666296	4666301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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18185	NC_012032	CA	3	6	4671079	4671084	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18186	NC_012032	GTA	2	6	4671091	4671096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18187	NC_012032	A	6	6	4671140	4671145	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18188	NC_012032	T	7	7	4671155	4671161	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18189	NC_012032	AGT	3	9	4671196	4671204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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18191	NC_012032	TGT	2	6	4671902	4671907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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18247	NC_012032	CG	3	6	4697264	4697269	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18248	NC_012032	GTT	2	6	4697329	4697334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18249	NC_012032	TATGA	2	10	4697375	4697384	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
18250	NC_012032	TCAA	2	8	4697388	4697395	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18251	NC_012032	GT	3	6	4697404	4697409	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18252	NC_012032	GAAA	2	8	4697422	4697429	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18253	NC_012032	CTG	2	6	4697470	4697475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18254	NC_012032	GAAT	2	8	4697481	4697488	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18255	NC_012032	TCC	2	6	4697489	4697494	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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18257	NC_012032	TTTG	2	8	4697584	4697591	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
18258	NC_012032	GGAA	2	8	4697595	4697602	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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18262	NC_012032	TCC	2	6	4709750	4709755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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18265	NC_012032	AGG	2	6	4709774	4709779	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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18276	NC_012032	GA	3	6	4714296	4714301	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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18373	NC_012032	CT	3	6	4735549	4735554	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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