MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Chloroflexus sp. Y-400-fl chromosome

Total Repeats: 20181

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17501	NC_012032	CGG	3	9	4516024	4516032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17502	NC_012032	CGG	2	6	4516045	4516050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17503	NC_012032	GCCTG	2	10	4516099	4516108	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
17504	NC_012032	CAT	2	6	4516165	4516170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17505	NC_012032	CCAG	2	8	4516186	4516193	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
17506	NC_012032	GCA	2	6	4516206	4516211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17507	NC_012032	CCCCTA	2	12	4516214	4516225	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17508	NC_012032	CTG	2	6	4516248	4516253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17509	NC_012032	AATT	2	8	4516346	4516353	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17510	NC_012032	GAC	2	6	4516383	4516388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17511	NC_012032	CCCT	2	8	4516397	4516404	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
17512	NC_012032	CAT	2	6	4516498	4516503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17513	NC_012032	CCG	2	6	4516509	4516514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17514	NC_012032	CGC	2	6	4516556	4516561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17515	NC_012032	CGTGA	2	10	4516589	4516598	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
17516	NC_012032	TGC	2	6	4516657	4516662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17517	NC_012032	GAA	2	6	4516671	4516676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17518	NC_012032	GAT	2	6	4516695	4516700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17519	NC_012032	AAC	2	6	4516750	4516755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17520	NC_012032	AC	3	6	4516886	4516891	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17521	NC_012032	CTC	2	6	4517242	4517247	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17522	NC_012032	TAC	2	6	4517308	4517313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17523	NC_012032	ACG	2	6	4517366	4517371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17524	NC_012032	GGA	2	6	4517528	4517533	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17525	NC_012032	GGC	2	6	4517560	4517565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17526	NC_012032	TC	3	6	4517587	4517592	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17527	NC_012032	GTTGGG	2	12	4517603	4517614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17528	NC_012032	GT	3	6	4517676	4517681	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17529	NC_012032	TGA	2	6	4517701	4517706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17530	NC_012032	A	6	6	4517815	4517820	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17531	NC_012032	GTCT	2	8	4518196	4518203	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17532	NC_012032	CAA	2	6	4518222	4518227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17533	NC_012032	TC	4	8	4518302	4518309	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17534	NC_012032	TGC	2	6	4518328	4518333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17535	NC_012032	GAC	2	6	4518422	4518427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17536	NC_012032	CGC	2	6	4518435	4518440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17537	NC_012032	CAC	2	6	4518521	4518526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17538	NC_012032	ATA	2	6	4518530	4518535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17539	NC_012032	CTCAC	2	10	4522393	4522402	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
17540	NC_012032	C	6	6	4522408	4522413	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
17541	NC_012032	GAG	2	6	4522432	4522437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17542	NC_012032	CCTT	2	8	4522535	4522542	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17543	NC_012032	AAAAC	2	10	4522602	4522611	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
17544	NC_012032	GGC	2	6	4523156	4523161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17545	NC_012032	GAC	2	6	4523191	4523196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17546	NC_012032	GATG	2	8	4525120	4525127	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
17547	NC_012032	GCC	2	6	4525245	4525250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17548	NC_012032	CG	3	6	4525307	4525312	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17549	NC_012032	TGC	2	6	4525332	4525337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17550	NC_012032	GAAT	2	8	4525436	4525443	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17551	NC_012032	CGGCCA	2	12	4525497	4525508	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
17552	NC_012032	CGG	2	6	4525517	4525522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17553	NC_012032	GAT	2	6	4525527	4525532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17554	NC_012032	CCACG	2	10	4525554	4525563	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
17555	NC_012032	CAG	2	6	4525618	4525623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17556	NC_012032	GGTGG	2	10	4525628	4525637	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
17557	NC_012032	GGGT	2	8	4525638	4525645	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
17558	NC_012032	TTA	2	6	4525651	4525656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17559	NC_012032	CCA	2	6	4525682	4525687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17560	NC_012032	AAT	2	6	4525731	4525736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17561	NC_012032	CT	3	6	4525757	4525762	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17562	NC_012032	CGGG	2	8	4525771	4525778	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
17563	NC_012032	TA	3	6	4525847	4525852	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17564	NC_012032	GACA	2	8	4526922	4526929	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17565	NC_012032	TCC	2	6	4528259	4528264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17566	NC_012032	GTA	2	6	4528276	4528281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17567	NC_012032	TGC	2	6	4528305	4528310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17568	NC_012032	ATG	2	6	4528335	4528340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17569	NC_012032	CCT	2	6	4528362	4528367	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17570	NC_012032	T	7	7	4528367	4528373	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17571	NC_012032	TGA	2	6	4528393	4528398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17572	NC_012032	TCA	2	6	4528440	4528445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17573	NC_012032	ATC	2	6	4528476	4528481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17574	NC_012032	TCAT	3	12	4528489	4528500	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17575	NC_012032	GAA	2	6	4528615	4528620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17576	NC_012032	CGGG	2	8	4528686	4528693	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
17577	NC_012032	GCG	2	6	4528854	4528859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17578	NC_012032	AAC	2	6	4529573	4529578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17579	NC_012032	TGTAT	2	10	4533290	4533299	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
17580	NC_012032	TGA	2	6	4533303	4533308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17581	NC_012032	ACC	2	6	4533382	4533387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17582	NC_012032	TGC	2	6	4533395	4533400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17583	NC_012032	GTT	2	6	4533430	4533435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17584	NC_012032	G	6	6	4535838	4535843	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
17585	NC_012032	TGG	3	9	4537586	4537594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17586	NC_012032	CAC	2	6	4537615	4537620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17587	NC_012032	CACC	2	8	4537642	4537649	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
17588	NC_012032	GCA	2	6	4537653	4537658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17589	NC_012032	CGC	2	6	4537663	4537668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17590	NC_012032	GTTG	2	8	4537709	4537716	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17591	NC_012032	ATG	2	6	4537797	4537802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17592	NC_012032	CAA	2	6	4537832	4537837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17593	NC_012032	TTG	2	6	4537851	4537856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17594	NC_012032	TGA	2	6	4537909	4537914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17595	NC_012032	CGG	2	6	4538088	4538093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17596	NC_012032	AGG	2	6	4538111	4538116	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17597	NC_012032	G	6	6	4538115	4538120	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
17598	NC_012032	CTG	2	6	4538764	4538769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17599	NC_012032	GC	3	6	4538777	4538782	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17600	NC_012032	GCA	2	6	4538811	4538816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17601	NC_012032	TGC	2	6	4538880	4538885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17602	NC_012032	GCA	2	6	4538946	4538951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17603	NC_012032	AGG	2	6	4540310	4540315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17604	NC_012032	CAT	2	6	4543746	4543751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17605	NC_012032	GCCATT	2	12	4543766	4543777	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
17606	NC_012032	C	6	6	4543841	4543846	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
17607	NC_012032	CAG	2	6	4543861	4543866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17608	NC_012032	CGG	2	6	4543917	4543922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17609	NC_012032	CAG	2	6	4543936	4543941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17610	NC_012032	CAG	2	6	4544011	4544016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17611	NC_012032	CAG	2	6	4544085	4544090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17612	NC_012032	GT	4	8	4544124	4544131	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17613	NC_012032	GCA	2	6	4544157	4544162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17614	NC_012032	CA	4	8	4544202	4544209	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17615	NC_012032	CAG	2	6	4544233	4544238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17616	NC_012032	GCC	2	6	4544299	4544304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17617	NC_012032	CAG	2	6	4544307	4544312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17618	NC_012032	ACT	2	6	4544349	4544354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17619	NC_012032	GGC	3	9	4544362	4544370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17620	NC_012032	GCA	2	6	4544380	4544385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17621	NC_012032	CAG	2	6	4544431	4544436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17622	NC_012032	GCA	2	6	4544455	4544460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17623	NC_012032	ACT	2	6	4544498	4544503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17624	NC_012032	GGC	3	9	4544511	4544519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17625	NC_012032	GCA	2	6	4544529	4544534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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17627	NC_012032	GCA	2	6	4544604	4544609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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