MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Chloroflexus sp. Y-400-fl chromosome

Total Repeats: 20181

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_012032	GC	3	6	4323178	4323183	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17002	NC_012032	GC	3	6	4323264	4323269	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17003	NC_012032	AAG	2	6	4323351	4323356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17004	NC_012032	TTG	2	6	4323506	4323511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17005	NC_012032	GTCCAG	2	12	4323566	4323577	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17006	NC_012032	GTCACC	2	12	4323616	4323627	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
17007	NC_012032	TTG	2	6	4323718	4323723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17008	NC_012032	GTTC	2	8	4323733	4323740	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17009	NC_012032	GCG	2	6	4325469	4325474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17010	NC_012032	CGG	2	6	4325523	4325528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17011	NC_012032	TGT	2	6	4326082	4326087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17012	NC_012032	TCC	2	6	4326809	4326814	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17013	NC_012032	TGC	2	6	4326865	4326870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17014	NC_012032	CGC	2	6	4327372	4327377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17015	NC_012032	TCC	2	6	4334017	4334022	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17016	NC_012032	GTA	2	6	4334059	4334064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17017	NC_012032	GCC	2	6	4334077	4334082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17018	NC_012032	GAA	2	6	4334083	4334088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17019	NC_012032	GTG	2	6	4334191	4334196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17020	NC_012032	CAAC	2	8	4334266	4334273	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17021	NC_012032	TGT	3	9	4334298	4334306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17022	NC_012032	GTT	2	6	4334327	4334332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17023	NC_012032	CCG	2	6	4335639	4335644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17024	NC_012032	GA	3	6	4335651	4335656	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17025	NC_012032	TGA	2	6	4335675	4335680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17026	NC_012032	TC	3	6	4335695	4335700	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17027	NC_012032	GCC	2	6	4335710	4335715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17028	NC_012032	GCAACG	2	12	4335730	4335741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17029	NC_012032	TC	3	6	4335742	4335747	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17030	NC_012032	CAA	2	6	4335753	4335758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17031	NC_012032	TCC	2	6	4338196	4338201	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17032	NC_012032	TGGT	2	8	4338272	4338279	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17033	NC_012032	TTG	2	6	4338342	4338347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17034	NC_012032	ACGC	2	8	4338364	4338371	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
17035	NC_012032	TCT	2	6	4338877	4338882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17036	NC_012032	ATA	2	6	4338902	4338907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17037	NC_012032	TGT	2	6	4338913	4338918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17038	NC_012032	TGC	2	6	4338925	4338930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17039	NC_012032	AAC	2	6	4338963	4338968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17040	NC_012032	ACA	2	6	4338981	4338986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17041	NC_012032	AGC	2	6	4339019	4339024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17042	NC_012032	CTT	2	6	4339045	4339050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17043	NC_012032	CGA	2	6	4339138	4339143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17044	NC_012032	CACG	2	8	4339211	4339218	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
17045	NC_012032	TTGCC	2	10	4339224	4339233	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
17046	NC_012032	TGC	2	6	4339277	4339282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17047	NC_012032	CTG	2	6	4339328	4339333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17048	NC_012032	TG	3	6	4339349	4339354	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17049	NC_012032	GAAT	2	8	4339381	4339388	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17050	NC_012032	GTG	2	6	4339460	4339465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17051	NC_012032	TC	3	6	4341706	4341711	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17052	NC_012032	TGT	2	6	4341849	4341854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17053	NC_012032	A	6	6	4341867	4341872	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17054	NC_012032	CTA	2	6	4341876	4341881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17055	NC_012032	TTG	2	6	4341896	4341901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17056	NC_012032	GCA	2	6	4342007	4342012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17057	NC_012032	GAT	2	6	4342045	4342050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17058	NC_012032	CAC	2	6	4342085	4342090	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17059	NC_012032	GTT	2	6	4342096	4342101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17060	NC_012032	ACAGC	2	10	4342110	4342119	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
17061	NC_012032	ATA	2	6	4342130	4342135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17062	NC_012032	TCC	2	6	4342155	4342160	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17063	NC_012032	CT	3	6	4342163	4342168	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17064	NC_012032	CAG	2	6	4342259	4342264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17065	NC_012032	TTGC	2	8	4342293	4342300	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17066	NC_012032	GCT	2	6	4342420	4342425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17067	NC_012032	TG	3	6	4342476	4342481	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17068	NC_012032	TCT	2	6	4342486	4342491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17069	NC_012032	CGG	2	6	4343842	4343847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17070	NC_012032	AAG	2	6	4346143	4346148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17071	NC_012032	ACATCC	2	12	4347595	4347606	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
17072	NC_012032	ATTGCC	2	12	4347684	4347695	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
17073	NC_012032	TGG	2	6	4348619	4348624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17074	NC_012032	GGTT	2	8	4348633	4348640	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17075	NC_012032	TTTG	2	8	4348687	4348694	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
17076	NC_012032	GATC	2	8	4348705	4348712	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17077	NC_012032	AC	3	6	4348860	4348865	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17078	NC_012032	GTA	2	6	4348917	4348922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17079	NC_012032	GGCGA	2	10	4349605	4349614	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
17080	NC_012032	ACC	2	6	4349708	4349713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17081	NC_012032	TCC	2	6	4349745	4349750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17082	NC_012032	TGA	2	6	4349927	4349932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17083	NC_012032	TCG	2	6	4349944	4349949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17084	NC_012032	AGC	2	6	4349975	4349980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17085	NC_012032	TGC	2	6	4350031	4350036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17086	NC_012032	TGC	2	6	4350058	4350063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17087	NC_012032	GCC	2	6	4350074	4350079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17088	NC_012032	GTG	2	6	4350086	4350091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17089	NC_012032	GCTG	2	8	4350108	4350115	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17090	NC_012032	AGT	2	6	4350188	4350193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17091	NC_012032	GGC	2	6	4350230	4350235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17092	NC_012032	GCGCA	2	10	4350240	4350249	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
17093	NC_012032	GCC	3	9	4350341	4350349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17094	NC_012032	GGT	2	6	4350367	4350372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17095	NC_012032	GCT	2	6	4350376	4350381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17096	NC_012032	TGC	2	6	4350405	4350410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17097	NC_012032	GGT	2	6	4350421	4350426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17098	NC_012032	GAC	3	9	4350473	4350481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17099	NC_012032	GGC	2	6	4350487	4350492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17100	NC_012032	CGTTGC	2	12	4350514	4350525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17101	NC_012032	GTG	2	6	4350530	4350535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17102	NC_012032	ACT	2	6	4350590	4350595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17103	NC_012032	TTA	2	6	4350616	4350621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17104	NC_012032	TTG	2	6	4350644	4350649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17105	NC_012032	GCAG	2	8	4350773	4350780	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17106	NC_012032	GCA	2	6	4350815	4350820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17107	NC_012032	GAT	2	6	4350856	4350861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17108	NC_012032	CGG	2	6	4352056	4352061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17109	NC_012032	TCC	2	6	4352072	4352077	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17110	NC_012032	TGCC	2	8	4352118	4352125	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
17111	NC_012032	TGA	2	6	4354726	4354731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17112	NC_012032	CGA	2	6	4355543	4355548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17113	NC_012032	CAG	2	6	4355631	4355636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17114	NC_012032	ACG	2	6	4355658	4355663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17115	NC_012032	AAT	2	6	4355696	4355701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17116	NC_012032	CTC	2	6	4355769	4355774	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17117	NC_012032	TCC	2	6	4355779	4355784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17118	NC_012032	GTG	2	6	4355793	4355798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17119	NC_012032	GTT	2	6	4357737	4357742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17120	NC_012032	CCGATC	2	12	4357824	4357835	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
17121	NC_012032	GCT	2	6	4357868	4357873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17122	NC_012032	TGA	2	6	4357966	4357971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17123	NC_012032	T	6	6	4357985	4357990	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17124	NC_012032	GCT	2	6	4358024	4358029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17125	NC_012032	GAG	2	6	4358114	4358119	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17126	NC_012032	CTA	2	6	4358128	4358133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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17131	NC_012032	GTTG	2	8	4358480	4358487	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17132	NC_012032	CGG	2	6	4358494	4358499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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17135	NC_012032	CTG	2	6	4358588	4358593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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17152	NC_012032	CT	3	6	4366077	4366082	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17153	NC_012032	CT	3	6	4366084	4366089	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17154	NC_012032	CT	3	6	4366091	4366096	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17155	NC_012032	CT	3	6	4366098	4366103	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17156	NC_012032	TCT	2	6	4366136	4366141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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17245	NC_012032	AAC	2	6	4402125	4402130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17246	NC_012032	AAGA	2	8	4402145	4402152	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
17247	NC_012032	AAT	2	6	4402162	4402167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17248	NC_012032	CGATA	2	10	4402223	4402232	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
17249	NC_012032	CTG	2	6	4403494	4403499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17250	NC_012032	CAA	2	6	4403814	4403819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17251	NC_012032	CCTG	2	8	4410092	4410099	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
17252	NC_012032	AT	3	6	4410111	4410116	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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17254	NC_012032	CTG	2	6	4410158	4410163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17255	NC_012032	AGA	2	6	4413718	4413723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17256	NC_012032	GA	4	8	4413734	4413741	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17257	NC_012032	GA	3	6	4413748	4413753	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17258	NC_012032	CT	3	6	4413956	4413961	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17259	NC_012032	GATG	2	8	4414016	4414023	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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17270	NC_012032	TTC	2	6	4414855	4414860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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17276	NC_012032	GTG	2	6	4418307	4418312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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17287	NC_012032	TTA	2	6	4420778	4420783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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