MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Chloroflexus sp. Y-400-fl chromosome

Total Repeats: 20181

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16501	NC_012032	TG	4	8	4180479	4180486	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16502	NC_012032	ATC	2	6	4183363	4183368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16503	NC_012032	CCAG	2	8	4183369	4183376	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16504	NC_012032	AGG	2	6	4183412	4183417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16505	NC_012032	GCG	2	6	4184155	4184160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16506	NC_012032	ATC	2	6	4184187	4184192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16507	NC_012032	CAG	2	6	4187424	4187429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16508	NC_012032	A	7	7	4189729	4189735	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16509	NC_012032	TGATGT	2	12	4189773	4189784	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16510	NC_012032	CATT	2	8	4191413	4191420	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16511	NC_012032	GTT	2	6	4192302	4192307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16512	NC_012032	A	6	6	4192309	4192314	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16513	NC_012032	CAA	2	6	4192358	4192363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16514	NC_012032	TCA	2	6	4192398	4192403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16515	NC_012032	GTTGC	2	10	4192419	4192428	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
16516	NC_012032	AAG	2	6	4194712	4194717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16517	NC_012032	ATG	2	6	4194869	4194874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16518	NC_012032	TGC	2	6	4194900	4194905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16519	NC_012032	TGT	2	6	4194948	4194953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16520	NC_012032	AGG	3	9	4194975	4194983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16521	NC_012032	GAA	2	6	4196897	4196902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16522	NC_012032	CTG	2	6	4196904	4196909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16523	NC_012032	CGG	2	6	4196927	4196932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16524	NC_012032	GCA	2	6	4196933	4196938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16525	NC_012032	GGT	2	6	4196947	4196952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16526	NC_012032	CTTT	2	8	4196977	4196984	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16527	NC_012032	T	6	6	4197352	4197357	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16528	NC_012032	TCT	2	6	4197360	4197365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16529	NC_012032	GGT	2	6	4197382	4197387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16530	NC_012032	TAGC	2	8	4197393	4197400	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16531	NC_012032	AAT	2	6	4197409	4197414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16532	NC_012032	CT	3	6	4197470	4197475	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16533	NC_012032	ACA	2	6	4197570	4197575	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16534	NC_012032	A	7	7	4197592	4197598	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16535	NC_012032	AGG	2	6	4197609	4197614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16536	NC_012032	CTGTT	2	10	4198111	4198120	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
16537	NC_012032	AGG	2	6	4199199	4199204	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16538	NC_012032	ACT	2	6	4200256	4200261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16539	NC_012032	CA	3	6	4200263	4200268	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16540	NC_012032	ATT	2	6	4200477	4200482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16541	NC_012032	GC	3	6	4200519	4200524	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16542	NC_012032	GC	3	6	4200532	4200537	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16543	NC_012032	ATT	2	6	4200632	4200637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16544	NC_012032	GC	4	8	4200674	4200681	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16545	NC_012032	GC	3	6	4200687	4200692	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16546	NC_012032	CAC	2	6	4200804	4200809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16547	NC_012032	GC	3	6	4200837	4200842	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16548	NC_012032	GC	3	6	4200850	4200855	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16549	NC_012032	CACGC	2	10	4200983	4200992	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
16550	NC_012032	ACC	2	6	4200993	4200998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16551	NC_012032	CGTG	2	8	4201010	4201017	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16552	NC_012032	GT	3	6	4201038	4201043	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16553	NC_012032	CGCA	2	8	4201124	4201131	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16554	NC_012032	CGT	2	6	4201176	4201181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16555	NC_012032	CAA	2	6	4202977	4202982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16556	NC_012032	ATA	3	9	4202989	4202997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16557	NC_012032	GACA	2	8	4203003	4203010	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16558	NC_012032	ATC	2	6	4203145	4203150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16559	NC_012032	GCA	2	6	4203183	4203188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16560	NC_012032	GCG	2	6	4203196	4203201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16561	NC_012032	ATA	2	6	4203239	4203244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16562	NC_012032	GACA	2	8	4203253	4203260	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16563	NC_012032	TCAG	2	8	4203264	4203271	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16564	NC_012032	GCA	2	6	4203437	4203442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16565	NC_012032	GGT	2	6	4203443	4203448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16566	NC_012032	GCG	2	6	4203450	4203455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16567	NC_012032	ACA	2	6	4203480	4203485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16568	NC_012032	ATA	3	9	4203493	4203501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16569	NC_012032	GACA	2	8	4203507	4203514	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16570	NC_012032	TGTC	2	8	4203523	4203530	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16571	NC_012032	CCT	2	6	4206151	4206156	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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16574	NC_012032	TTG	2	6	4207042	4207047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16579	NC_012032	AGTG	2	8	4208803	4208810	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16580	NC_012032	GT	3	6	4208847	4208852	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16581	NC_012032	TCT	2	6	4208922	4208927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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16599	NC_012032	GGGT	2	8	4216047	4216054	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
16600	NC_012032	GAGG	2	8	4216066	4216073	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
16601	NC_012032	GT	3	6	4217821	4217826	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16602	NC_012032	CGC	2	6	4217865	4217870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16603	NC_012032	GTTG	2	8	4217890	4217897	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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16609	NC_012032	TG	3	6	4219801	4219806	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16610	NC_012032	GGTG	2	8	4220014	4220021	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
16611	NC_012032	ATG	2	6	4220029	4220034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16615	NC_012032	ACGTC	2	10	4220116	4220125	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
16616	NC_012032	TGG	2	6	4220177	4220182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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16621	NC_012032	CCT	2	6	4226938	4226943	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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16624	NC_012032	GTA	2	6	4230102	4230107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16627	NC_012032	AAT	2	6	4232465	4232470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16629	NC_012032	TG	3	6	4232550	4232555	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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16634	NC_012032	TGG	2	6	4235636	4235641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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