MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Chloroflexus sp. Y-400-fl chromosome

Total Repeats: 20181

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_012032	CGGT	2	8	4020735	4020742	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16002	NC_012032	GGT	2	6	4020756	4020761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16003	NC_012032	GCA	2	6	4020843	4020848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16004	NC_012032	ATG	2	6	4020866	4020871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16005	NC_012032	GCA	2	6	4020894	4020899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16006	NC_012032	GCA	2	6	4020982	4020987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16007	NC_012032	GAT	2	6	4021052	4021057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16008	NC_012032	GATG	2	8	4021067	4021074	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16009	NC_012032	TGC	2	6	4021079	4021084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16010	NC_012032	CA	3	6	4021133	4021138	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16011	NC_012032	AGCAGG	2	12	4024615	4024626	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
16012	NC_012032	CTA	2	6	4025109	4025114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16013	NC_012032	TAT	2	6	4025117	4025122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16014	NC_012032	TGCAG	2	10	4025140	4025149	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
16015	NC_012032	GAT	2	6	4025205	4025210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16016	NC_012032	TCA	2	6	4025286	4025291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16017	NC_012032	CTC	2	6	4030612	4030617	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16018	NC_012032	TTATG	2	10	4035256	4035265	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
16019	NC_012032	AT	3	6	4035278	4035283	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16020	NC_012032	TAA	2	6	4035292	4035297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16021	NC_012032	CTC	2	6	4036839	4036844	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16022	NC_012032	CT	3	6	4036859	4036864	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16023	NC_012032	CAT	2	6	4036874	4036879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16024	NC_012032	GAAG	2	8	4036906	4036913	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16025	NC_012032	ATA	2	6	4037712	4037717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16026	NC_012032	CAG	2	6	4039093	4039098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16027	NC_012032	AACAA	2	10	4039146	4039155	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
16028	NC_012032	GTATC	2	10	4040611	4040620	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
16029	NC_012032	TGGA	2	8	4040724	4040731	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16030	NC_012032	GAG	2	6	4041455	4041460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16031	NC_012032	CTT	2	6	4042308	4042313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16032	NC_012032	TTCGC	2	10	4042478	4042487	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
16033	NC_012032	GGA	2	6	4042510	4042515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16034	NC_012032	GTG	2	6	4042547	4042552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16035	NC_012032	CATT	2	8	4042654	4042661	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16036	NC_012032	GC	4	8	4042675	4042682	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16037	NC_012032	GC	3	6	4042688	4042693	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16038	NC_012032	ACC	2	6	4042736	4042741	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16039	NC_012032	G	6	6	4042779	4042784	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16040	NC_012032	GC	3	6	4042807	4042812	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16041	NC_012032	CAC	2	6	4042869	4042874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16042	NC_012032	CTCC	2	8	4042878	4042885	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
16043	NC_012032	TGGGG	2	10	4042902	4042911	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
16044	NC_012032	ATGCT	2	10	4042947	4042956	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
16045	NC_012032	CAC	2	6	4042957	4042962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16046	NC_012032	CCA	2	6	4043012	4043017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16047	NC_012032	CCA	2	6	4043020	4043025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16048	NC_012032	CTT	2	6	4043057	4043062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16049	NC_012032	ATA	2	6	4043135	4043140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16050	NC_012032	ACG	2	6	4043163	4043168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16051	NC_012032	ACA	2	6	4045065	4045070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16052	NC_012032	CA	3	6	4045844	4045849	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16053	NC_012032	TGA	2	6	4045920	4045925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16054	NC_012032	ACA	2	6	4045945	4045950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16055	NC_012032	ACGA	2	8	4046989	4046996	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16056	NC_012032	CAC	2	6	4047013	4047018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16057	NC_012032	AAC	2	6	4047039	4047044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16058	NC_012032	AG	3	6	4047064	4047069	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16059	NC_012032	GCCA	2	8	4047080	4047087	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16060	NC_012032	TGC	2	6	4047126	4047131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16061	NC_012032	GCCA	2	8	4047135	4047142	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16062	NC_012032	GC	4	8	4047222	4047229	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16063	NC_012032	CCAG	2	8	4047259	4047266	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16064	NC_012032	CCAG	2	8	4047287	4047294	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16065	NC_012032	TGC	2	6	4047332	4047337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16067	NC_012032	CCAG	2	8	4047465	4047472	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16068	NC_012032	CCAG	2	8	4047493	4047500	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16069	NC_012032	TGC	2	6	4047538	4047543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16071	NC_012032	CCAG	2	8	4047699	4047706	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16072	NC_012032	TGC	2	6	4047744	4047749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16073	NC_012032	CCAG	2	8	4047877	4047884	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16074	NC_012032	GCCA	2	8	4047905	4047912	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16075	NC_012032	TGC	2	6	4047951	4047956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16077	NC_012032	CCAG	2	8	4048084	4048091	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16078	NC_012032	CCAG	2	8	4048112	4048119	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16079	NC_012032	TGC	2	6	4048157	4048162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16081	NC_012032	GC	4	8	4048253	4048260	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16082	NC_012032	CCAG	2	8	4048290	4048297	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16083	NC_012032	CCAG	2	8	4048318	4048325	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16084	NC_012032	TGC	2	6	4048363	4048368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16086	NC_012032	GCCA	2	8	4048524	4048531	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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16091	NC_012032	GC	3	6	4048764	4048769	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16092	NC_012032	GCG	2	6	4048815	4048820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16093	NC_012032	AT	3	6	4048908	4048913	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16098	NC_012032	CTGC	2	8	4049782	4049789	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16099	NC_012032	ATG	2	6	4050588	4050593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16103	NC_012032	GA	3	6	4052190	4052195	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16104	NC_012032	CA	3	6	4052793	4052798	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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16113	NC_012032	TTC	2	6	4055507	4055512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16114	NC_012032	CCT	2	6	4057312	4057317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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16124	NC_012032	TAT	2	6	4060444	4060449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16127	NC_012032	TCAA	2	8	4060534	4060541	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16128	NC_012032	A	6	6	4060573	4060578	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16129	NC_012032	ACCG	2	8	4060606	4060613	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16130	NC_012032	CAG	2	6	4060654	4060659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16131	NC_012032	ACG	2	6	4060664	4060669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16132	NC_012032	GT	3	6	4060686	4060691	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16133	NC_012032	GCA	2	6	4060704	4060709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16134	NC_012032	ACG	2	6	4060727	4060732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16135	NC_012032	GAT	2	6	4060742	4060747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16136	NC_012032	A	6	6	4060856	4060861	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16137	NC_012032	CTA	2	6	4060865	4060870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16138	NC_012032	ACG	2	6	4060902	4060907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16139	NC_012032	GCA	2	6	4060942	4060947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16140	NC_012032	CGA	2	6	4061077	4061082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16141	NC_012032	A	6	6	4061094	4061099	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16142	NC_012032	CTA	2	6	4061103	4061108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16143	NC_012032	ACG	2	6	4061140	4061145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16144	NC_012032	GT	3	6	4061162	4061167	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16145	NC_012032	GCA	2	6	4061180	4061185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16146	NC_012032	GAT	2	6	4061218	4061223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16147	NC_012032	CGA	2	6	4061315	4061320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16148	NC_012032	A	6	6	4061332	4061337	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16149	NC_012032	CTA	2	6	4061341	4061346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16150	NC_012032	ACG	2	6	4061378	4061383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16151	NC_012032	GT	3	6	4061400	4061405	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16152	NC_012032	GCA	2	6	4061418	4061423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16155	NC_012032	TTG	2	6	4061554	4061559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16158	NC_012032	TTG	2	6	4062583	4062588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16159	NC_012032	CGT	2	6	4062632	4062637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16161	NC_012032	GCA	2	6	4062765	4062770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16163	NC_012032	TTA	2	6	4062813	4062818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16182	NC_012032	TCAC	2	8	4079596	4079603	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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16200	NC_012032	GGTTG	2	10	4084850	4084859	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
16201	NC_012032	ATGC	2	8	4085001	4085008	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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16226	NC_012032	TAT	2	6	4095209	4095214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16233	NC_012032	GCG	2	6	4095432	4095437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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16235	NC_012032	CCGT	2	8	4095475	4095482	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16236	NC_012032	AGCA	2	8	4095489	4095496	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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16240	NC_012032	GC	3	6	4095669	4095674	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16241	NC_012032	GC	4	8	4095680	4095687	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16242	NC_012032	CCGT	2	8	4095720	4095727	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16243	NC_012032	AGCA	2	8	4095734	4095741	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16244	NC_012032	CAG	2	6	4095761	4095766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16245	NC_012032	GGT	2	6	4095899	4095904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16246	NC_012032	GAGC	2	8	4095905	4095912	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16247	NC_012032	GC	3	6	4095914	4095919	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16248	NC_012032	GC	4	8	4095925	4095932	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16249	NC_012032	GC	3	6	4095943	4095948	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16250	NC_012032	GCG	2	6	4095973	4095978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16251	NC_012032	CG	3	6	4095977	4095982	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16252	NC_012032	ACA	2	6	4096150	4096155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16253	NC_012032	CTGC	2	8	4096649	4096656	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16254	NC_012032	ACA	2	6	4096675	4096680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16255	NC_012032	CTC	3	9	4098125	4098133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16256	NC_012032	CCT	2	6	4101721	4101726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16257	NC_012032	CCT	2	6	4101983	4101988	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16258	NC_012032	CGA	2	6	4102004	4102009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16259	NC_012032	CCT	2	6	4102998	4103003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16260	NC_012032	CT	3	6	4103042	4103047	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16261	NC_012032	GCT	2	6	4103052	4103057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16262	NC_012032	AAC	3	9	4103070	4103078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16263	NC_012032	TGCC	2	8	4103134	4103141	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16264	NC_012032	GTG	2	6	4103235	4103240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16265	NC_012032	TG	3	6	4103256	4103261	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16266	NC_012032	CGGG	2	8	4103285	4103292	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
16267	NC_012032	GT	3	6	4103296	4103301	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16268	NC_012032	GGT	2	6	4103303	4103308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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16270	NC_012032	CTGC	2	8	4103433	4103440	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16271	NC_012032	CCGT	2	8	4103506	4103513	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16272	NC_012032	CAC	2	6	4103557	4103562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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16281	NC_012032	GGT	2	6	4104921	4104926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16282	NC_012032	G	8	8	4104961	4104968	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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16290	NC_012032	TGG	2	6	4108908	4108913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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16368	NC_012032	CCACA	2	10	4134991	4135000	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
16369	NC_012032	CGGGC	2	10	4135070	4135079	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
16370	NC_012032	GCGG	3	12	4135085	4135096	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
16371	NC_012032	GTT	2	6	4135114	4135119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16372	NC_012032	GGT	2	6	4135200	4135205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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16374	NC_012032	GCA	2	6	4135255	4135260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16376	NC_012032	GTAGC	2	10	4137035	4137044	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
16377	NC_012032	TGC	2	6	4137154	4137159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16378	NC_012032	CAG	2	6	4137238	4137243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16380	NC_012032	TCAT	2	8	4137318	4137325	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16381	NC_012032	CA	3	6	4137354	4137359	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16382	NC_012032	ACG	2	6	4137384	4137389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16383	NC_012032	GT	3	6	4137406	4137411	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16384	NC_012032	GCA	2	6	4137424	4137429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16386	NC_012032	CAG	2	6	4137515	4137520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16387	NC_012032	CTA	2	6	4137530	4137535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16388	NC_012032	AC	3	6	4137559	4137564	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16389	NC_012032	TCT	2	6	4137565	4137570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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16500	NC_012032	T	6	6	4180429	4180434	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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