MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Chloroflexus sp. Y-400-fl chromosome

Total Repeats: 20181

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_012032	CCA	2	6	3903192	3903197	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15002	NC_012032	TGC	2	6	3903264	3903269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15003	NC_012032	TCG	2	6	3903290	3903295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15004	NC_012032	CTGG	2	8	3903296	3903303	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15005	NC_012032	GCA	2	6	3903328	3903333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15006	NC_012032	CGG	2	6	3903341	3903346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15007	NC_012032	CCA	2	6	3903407	3903412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15008	NC_012032	GGC	2	6	3903524	3903529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15009	NC_012032	TGA	2	6	3903539	3903544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15010	NC_012032	C	6	6	3903592	3903597	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15011	NC_012032	CCA	2	6	3903662	3903667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15012	NC_012032	TGC	2	6	3903734	3903739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15013	NC_012032	TCG	2	6	3903760	3903765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15014	NC_012032	CTGG	2	8	3903766	3903773	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15015	NC_012032	GCA	2	6	3903798	3903803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15016	NC_012032	CGG	2	6	3903811	3903816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15017	NC_012032	CCA	2	6	3903877	3903882	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15018	NC_012032	TCCA	2	8	3903888	3903895	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
15019	NC_012032	ACG	2	6	3903952	3903957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15020	NC_012032	GGC	2	6	3903994	3903999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15021	NC_012032	TGA	2	6	3904009	3904014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15022	NC_012032	G	6	6	3904061	3904066	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
15023	NC_012032	G	7	7	3904091	3904097	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
15024	NC_012032	G	6	6	3904132	3904137	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
15025	NC_012032	TC	3	6	3904142	3904147	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15026	NC_012032	AAT	2	6	3904176	3904181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15027	NC_012032	CT	3	6	3904363	3904368	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15028	NC_012032	CT	3	6	3904377	3904382	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15029	NC_012032	CT	3	6	3904391	3904396	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15030	NC_012032	CT	3	6	3904405	3904410	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15031	NC_012032	TCT	2	6	3904506	3904511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15032	NC_012032	TCT	2	6	3904520	3904525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15033	NC_012032	CTTTA	2	10	3907669	3907678	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
15034	NC_012032	ACAT	2	8	3907679	3907686	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15035	NC_012032	GGT	2	6	3907689	3907694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15036	NC_012032	GGT	2	6	3907719	3907724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15037	NC_012032	CAG	2	6	3907757	3907762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15038	NC_012032	GAT	2	6	3907812	3907817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15039	NC_012032	AGA	2	6	3907882	3907887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15040	NC_012032	TGAT	2	8	3907899	3907906	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15041	NC_012032	CTG	2	6	3907933	3907938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15042	NC_012032	GCA	2	6	3908045	3908050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15043	NC_012032	CTA	2	6	3908103	3908108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15044	NC_012032	TCT	2	6	3908192	3908197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15045	NC_012032	GTGATA	2	12	3908207	3908218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15046	NC_012032	AT	3	6	3908332	3908337	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15047	NC_012032	TG	3	6	3908391	3908396	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15048	NC_012032	AGC	2	6	3908425	3908430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15049	NC_012032	CTAT	2	8	3908443	3908450	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15050	NC_012032	G	6	6	3910885	3910890	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
15051	NC_012032	A	6	6	3910898	3910903	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15052	NC_012032	GTG	2	6	3910929	3910934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15053	NC_012032	GCTT	2	8	3910998	3911005	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15054	NC_012032	TGC	2	6	3911054	3911059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15055	NC_012032	GAT	2	6	3911186	3911191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15056	NC_012032	TTCT	2	8	3917645	3917652	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15057	NC_012032	GCAC	2	8	3917695	3917702	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15058	NC_012032	ACA	2	6	3917909	3917914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15059	NC_012032	CAG	2	6	3919618	3919623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15060	NC_012032	CGA	2	6	3923870	3923875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15061	NC_012032	CATT	2	8	3923968	3923975	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15062	NC_012032	AGG	2	6	3924913	3924918	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15063	NC_012032	TAGA	2	8	3925658	3925665	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15064	NC_012032	GGT	2	6	3925670	3925675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15065	NC_012032	TAA	2	6	3926550	3926555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15066	NC_012032	GTG	2	6	3929498	3929503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15067	NC_012032	GGGA	2	8	3929577	3929584	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
15068	NC_012032	C	6	6	3930268	3930273	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15069	NC_012032	CATC	2	8	3930282	3930289	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
15070	NC_012032	TC	3	6	3930335	3930340	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15071	NC_012032	GCA	2	6	3930373	3930378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15072	NC_012032	AC	3	6	3930398	3930403	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15073	NC_012032	CTG	2	6	3930431	3930436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15074	NC_012032	ATG	2	6	3930446	3930451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15075	NC_012032	ATGA	2	8	3930485	3930492	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15076	NC_012032	CTT	2	6	3930498	3930503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15077	NC_012032	GTT	2	6	3931019	3931024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15078	NC_012032	GATG	2	8	3931039	3931046	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15079	NC_012032	GTT	2	6	3931071	3931076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15080	NC_012032	TTG	2	6	3931091	3931096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15081	NC_012032	AGTA	2	8	3931122	3931129	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15082	NC_012032	AG	3	6	3931145	3931150	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15083	NC_012032	CGT	2	6	3931187	3931192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15084	NC_012032	CCT	2	6	3931206	3931211	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15085	NC_012032	CAT	2	6	3931290	3931295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15086	NC_012032	ATT	2	6	3931319	3931324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15088	NC_012032	AGT	2	6	3931379	3931384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15090	NC_012032	TGCG	2	8	3931492	3931499	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15091	NC_012032	TGC	2	6	3931576	3931581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15092	NC_012032	CAT	2	6	3931635	3931640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15093	NC_012032	CCG	2	6	3931646	3931651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15094	NC_012032	CAA	2	6	3931697	3931702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15097	NC_012032	GCA	2	6	3931883	3931888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15098	NC_012032	GCA	2	6	3932071	3932076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15099	NC_012032	GTCG	2	8	3932113	3932120	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15100	NC_012032	TGC	2	6	3932222	3932227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15101	NC_012032	GTGG	3	12	3932442	3932453	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
15102	NC_012032	CG	3	6	3932471	3932476	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15103	NC_012032	GTG	2	6	3932505	3932510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15104	NC_012032	TTC	2	6	3932559	3932564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15105	NC_012032	ACTAC	2	10	3932596	3932605	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
15106	NC_012032	GAG	2	6	3932622	3932627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15107	NC_012032	TTG	2	6	3932881	3932886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15108	NC_012032	CTG	3	9	3932949	3932957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15109	NC_012032	AG	3	6	3933010	3933015	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15110	NC_012032	TGT	2	6	3933038	3933043	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15111	NC_012032	AGG	2	6	3933067	3933072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15112	NC_012032	CCTT	2	8	3933533	3933540	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15113	NC_012032	ATT	2	6	3934117	3934122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15116	NC_012032	CAT	2	6	3935063	3935068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15117	NC_012032	AAT	2	6	3935122	3935127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15118	NC_012032	TGT	3	9	3935159	3935167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15119	NC_012032	TCC	2	6	3935446	3935451	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15120	NC_012032	ACG	2	6	3935485	3935490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15121	NC_012032	TTG	2	6	3935505	3935510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15122	NC_012032	TCT	2	6	3935526	3935531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15123	NC_012032	TTC	2	6	3935549	3935554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15124	NC_012032	TGA	2	6	3935599	3935604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15125	NC_012032	GAG	2	6	3936307	3936312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15126	NC_012032	TGA	2	6	3936413	3936418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15127	NC_012032	AG	4	8	3936563	3936570	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15128	NC_012032	AC	3	6	3936584	3936589	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15129	NC_012032	GTA	2	6	3937925	3937930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15130	NC_012032	ATC	3	9	3937944	3937952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15131	NC_012032	GCG	2	6	3938005	3938010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15132	NC_012032	CAA	2	6	3938017	3938022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15133	NC_012032	CGGG	2	8	3940226	3940233	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
15134	NC_012032	CCCG	2	8	3940241	3940248	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
15135	NC_012032	TGTC	2	8	3940253	3940260	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15136	NC_012032	AAC	2	6	3940664	3940669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15138	NC_012032	CGG	2	6	3943293	3943298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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15147	NC_012032	GTCT	2	8	3944062	3944069	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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15159	NC_012032	TAC	2	6	3945276	3945281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15257	NC_012032	CAA	2	6	3960389	3960394	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15258	NC_012032	CAA	2	6	3960464	3960469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15259	NC_012032	CGGC	2	8	3960501	3960508	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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15271	NC_012032	CTG	2	6	3960896	3960901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15361	NC_012032	CAA	2	6	3964378	3964383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15378	NC_012032	TGC	2	6	3964952	3964957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15382	NC_012032	CAA	2	6	3965113	3965118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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