MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Chloroflexus sp. Y-400-fl chromosome

Total Repeats: 20181

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_012032	ATT	2	6	3792365	3792370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14502	NC_012032	TAA	2	6	3793668	3793673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14503	NC_012032	AATCG	2	10	3793696	3793705	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
14504	NC_012032	TGT	2	6	3794741	3794746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14505	NC_012032	AGATG	2	10	3794788	3794797	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
14506	NC_012032	ACGTT	2	10	3796248	3796257	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
14507	NC_012032	T	6	6	3796290	3796295	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14508	NC_012032	T	6	6	3796348	3796353	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14509	NC_012032	ATC	2	6	3796906	3796911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14510	NC_012032	TC	3	6	3796910	3796915	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14511	NC_012032	CTGAC	2	10	3796954	3796963	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
14512	NC_012032	TTG	2	6	3798784	3798789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14513	NC_012032	GCC	2	6	3798842	3798847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14514	NC_012032	CGG	2	6	3798853	3798858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14515	NC_012032	GCT	2	6	3798916	3798921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14516	NC_012032	AC	3	6	3799059	3799064	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14517	NC_012032	ACAA	2	8	3799067	3799074	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
14518	NC_012032	CGA	2	6	3799140	3799145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14519	NC_012032	TCT	2	6	3799404	3799409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14520	NC_012032	AAC	2	6	3799423	3799428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14521	NC_012032	TAG	2	6	3799491	3799496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14522	NC_012032	CAAA	2	8	3799522	3799529	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
14523	NC_012032	A	6	6	3799527	3799532	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14524	NC_012032	TA	3	6	3799613	3799618	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14525	NC_012032	TTG	2	6	3799620	3799625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14526	NC_012032	CAT	2	6	3801583	3801588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14527	NC_012032	TGG	2	6	3801598	3801603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14528	NC_012032	AGC	2	6	3801663	3801668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14529	NC_012032	GAT	2	6	3801755	3801760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14530	NC_012032	GAG	3	9	3803260	3803268	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14531	NC_012032	AG	3	6	3803267	3803272	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14532	NC_012032	GCA	2	6	3803326	3803331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14533	NC_012032	TGC	2	6	3803431	3803436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14534	NC_012032	TGC	2	6	3803590	3803595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14535	NC_012032	TGC	2	6	3803749	3803754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14536	NC_012032	TGC	2	6	3803908	3803913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14537	NC_012032	TCA	4	12	3804028	3804039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14538	NC_012032	ACG	2	6	3804111	3804116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14539	NC_012032	CGG	2	6	3804146	3804151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14540	NC_012032	CAAAT	2	10	3804254	3804263	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
14541	NC_012032	GAG	2	6	3804270	3804275	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14542	NC_012032	ACTTG	2	10	3805489	3805498	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
14543	NC_012032	AGG	2	6	3805574	3805579	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14544	NC_012032	TCA	2	6	3806579	3806584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14545	NC_012032	ATT	2	6	3806596	3806601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14546	NC_012032	CAT	2	6	3806632	3806637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14547	NC_012032	CCT	2	6	3808059	3808064	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14548	NC_012032	T	6	6	3808079	3808084	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14549	NC_012032	ATA	2	6	3808105	3808110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14550	NC_012032	GCA	2	6	3808135	3808140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14551	NC_012032	TG	3	6	3808188	3808193	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14552	NC_012032	AGG	2	6	3808194	3808199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14553	NC_012032	CT	3	6	3809919	3809924	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14554	NC_012032	GATT	2	8	3811612	3811619	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14555	NC_012032	ATC	2	6	3811656	3811661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14556	NC_012032	CA	3	6	3811663	3811668	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14557	NC_012032	AGC	2	6	3811714	3811719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14558	NC_012032	GGA	2	6	3811734	3811739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14559	NC_012032	GAA	2	6	3811806	3811811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14560	NC_012032	TGT	2	6	3811904	3811909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14561	NC_012032	TGT	2	6	3811911	3811916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14562	NC_012032	TCA	2	6	3812372	3812377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14563	NC_012032	AC	3	6	3812399	3812404	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14564	NC_012032	CA	3	6	3812506	3812511	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14565	NC_012032	ACC	3	9	3812544	3812552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14566	NC_012032	AC	3	6	3812574	3812579	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14567	NC_012032	TCT	2	6	3812606	3812611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14568	NC_012032	AT	3	6	3812642	3812647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14569	NC_012032	TCT	2	6	3812680	3812685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14571	NC_012032	TCT	2	6	3812694	3812699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14572	NC_012032	TCT	2	6	3812701	3812706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14573	NC_012032	TCT	2	6	3812715	3812720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14574	NC_012032	TCT	2	6	3812729	3812734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14576	NC_012032	TCT	2	6	3812757	3812762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14577	NC_012032	TCT	2	6	3812771	3812776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14578	NC_012032	TCT	2	6	3812785	3812790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14579	NC_012032	TCT	2	6	3812799	3812804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14580	NC_012032	TCT	2	6	3812813	3812818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14581	NC_012032	TCT	2	6	3812827	3812832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14582	NC_012032	TCT	2	6	3812841	3812846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14583	NC_012032	TCT	2	6	3812855	3812860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14584	NC_012032	TCT	2	6	3812869	3812874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14585	NC_012032	TCT	2	6	3812883	3812888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14586	NC_012032	TCT	2	6	3812897	3812902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14587	NC_012032	AGGA	2	8	3815835	3815842	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14588	NC_012032	TG	3	6	3816200	3816205	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14589	NC_012032	TG	3	6	3816209	3816214	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14590	NC_012032	TGA	2	6	3816307	3816312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14591	NC_012032	GCG	2	6	3816318	3816323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14592	NC_012032	GTG	2	6	3816331	3816336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14593	NC_012032	TG	3	6	3816364	3816369	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14594	NC_012032	TG	3	6	3816373	3816378	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14595	NC_012032	ATA	2	6	3816419	3816424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14596	NC_012032	TA	3	6	3816581	3816586	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14597	NC_012032	GGAGA	2	10	3816624	3816633	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
14598	NC_012032	CGT	2	6	3820618	3820623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14599	NC_012032	ATC	3	9	3824272	3824280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14600	NC_012032	AC	3	6	3824306	3824311	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14601	NC_012032	CTG	2	6	3824841	3824846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14602	NC_012032	CCG	2	6	3824960	3824965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14603	NC_012032	GCG	2	6	3824974	3824979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14604	NC_012032	TG	3	6	3824987	3824992	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14605	NC_012032	GTT	2	6	3827017	3827022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14606	NC_012032	GC	3	6	3827112	3827117	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14607	NC_012032	GT	3	6	3827261	3827266	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14608	NC_012032	GCT	2	6	3827311	3827316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14609	NC_012032	TGAT	2	8	3827337	3827344	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14610	NC_012032	GCCC	2	8	3827351	3827358	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
14611	NC_012032	GCA	2	6	3827390	3827395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14612	NC_012032	ATC	2	6	3827484	3827489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14613	NC_012032	CGTC	2	8	3827491	3827498	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14614	NC_012032	GCAT	2	8	3827501	3827508	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14615	NC_012032	CGG	2	6	3827582	3827587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14616	NC_012032	GT	3	6	3827634	3827639	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14617	NC_012032	GCT	2	6	3827684	3827689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14618	NC_012032	GATT	2	8	3827712	3827719	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14619	NC_012032	GCCC	2	8	3827725	3827732	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
14620	NC_012032	CG	3	6	3827746	3827751	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14621	NC_012032	GCA	2	6	3827764	3827769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14622	NC_012032	CGTC	2	8	3827865	3827872	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14623	NC_012032	GCAT	2	8	3827875	3827882	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14624	NC_012032	CGGCCA	2	12	3827937	3827948	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
14625	NC_012032	CGG	2	6	3827956	3827961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14626	NC_012032	GT	3	6	3828008	3828013	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14627	NC_012032	GCT	2	6	3828058	3828063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14628	NC_012032	GATT	2	8	3828086	3828093	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14629	NC_012032	GCCC	2	8	3828099	3828106	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
14630	NC_012032	TGC	2	6	3828145	3828150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14631	NC_012032	ATC	2	6	3828232	3828237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14632	NC_012032	CGTC	2	8	3828239	3828246	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14633	NC_012032	GCAT	2	8	3828249	3828256	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14634	NC_012032	CGGCCA	2	12	3828311	3828322	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
14635	NC_012032	CGG	2	6	3828330	3828335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14636	NC_012032	GT	3	6	3828382	3828387	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14637	NC_012032	GCT	2	6	3828432	3828437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14638	NC_012032	GATT	2	8	3828460	3828467	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14639	NC_012032	GCCC	2	8	3828473	3828480	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
14640	NC_012032	TGC	2	6	3828519	3828524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14641	NC_012032	ATC	2	6	3828606	3828611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14642	NC_012032	CGTC	2	8	3828613	3828620	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14643	NC_012032	GCAT	2	8	3828623	3828630	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14644	NC_012032	CGGCCA	2	12	3828685	3828696	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
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14647	NC_012032	GCT	2	6	3828806	3828811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14650	NC_012032	CG	3	6	3828867	3828872	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14651	NC_012032	TGC	2	6	3828892	3828897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14653	NC_012032	CGTC	2	8	3828986	3828993	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14654	NC_012032	GCAT	2	8	3828996	3829003	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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14661	NC_012032	CG	3	6	3829241	3829246	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14662	NC_012032	TGC	2	6	3829266	3829271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14665	NC_012032	CGG	2	6	3829452	3829457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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14669	NC_012032	GCCC	2	8	3829594	3829601	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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14672	NC_012032	GCAT	2	8	3829744	3829751	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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14681	NC_012032	CGTC	2	8	3830108	3830115	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14682	NC_012032	GCAT	2	8	3830118	3830125	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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14688	NC_012032	GCA	2	6	3830347	3830352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14754	NC_012032	GA	4	8	3850348	3850355	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14755	NC_012032	GCTGT	2	10	3850395	3850404	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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14886	NC_012032	AATG	2	8	3894510	3894517	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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14979	NC_012032	TGA	2	6	3902370	3902375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14981	NC_012032	GC	3	6	3902418	3902423	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14982	NC_012032	GGAG	2	8	3902444	3902451	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
14983	NC_012032	GGC	2	6	3902477	3902482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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14985	NC_012032	GCT	2	6	3902657	3902662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14986	NC_012032	GATT	2	8	3902685	3902692	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14987	NC_012032	TGC	2	6	3902744	3902749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14988	NC_012032	CTG	2	6	3902795	3902800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14989	NC_012032	TGG	2	6	3902811	3902816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14990	NC_012032	GCAT	2	8	3902848	3902855	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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14995	NC_012032	C	6	6	3903064	3903069	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14996	NC_012032	TC	3	6	3903086	3903091	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14997	NC_012032	C	6	6	3903094	3903099	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14998	NC_012032	TC	3	6	3903116	3903121	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14999	NC_012032	C	6	6	3903124	3903129	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15000	NC_012032	TAG	2	6	3903158	3903163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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