MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Chloroflexus sp. Y-400-fl chromosome

Total Repeats: 20181

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_012032	GTT	2	6	3660860	3660865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14002	NC_012032	TAAC	2	8	3660871	3660878	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14003	NC_012032	GCC	2	6	3661710	3661715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14004	NC_012032	CCG	3	9	3661729	3661737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14005	NC_012032	GAT	2	6	3661801	3661806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14006	NC_012032	TCGC	2	8	3661844	3661851	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14007	NC_012032	CAA	2	6	3661852	3661857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14008	NC_012032	TCGCA	2	10	3661904	3661913	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
14009	NC_012032	CTGC	2	8	3661989	3661996	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14010	NC_012032	CGGT	2	8	3662012	3662019	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14011	NC_012032	ATAA	2	8	3662089	3662096	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14012	NC_012032	TTCG	2	8	3662122	3662129	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14013	NC_012032	TCA	2	6	3662355	3662360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14014	NC_012032	CTT	2	6	3662497	3662502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14015	NC_012032	CAC	2	6	3662525	3662530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14016	NC_012032	CCA	2	6	3662620	3662625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14017	NC_012032	GAC	2	6	3662632	3662637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14018	NC_012032	TTG	2	6	3662659	3662664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14019	NC_012032	GGTCTG	2	12	3662666	3662677	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
14020	NC_012032	CAA	2	6	3662803	3662808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14021	NC_012032	GGT	2	6	3662824	3662829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14022	NC_012032	GCA	2	6	3662854	3662859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14023	NC_012032	CGAC	2	8	3662868	3662875	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14024	NC_012032	GAT	2	6	3662878	3662883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14025	NC_012032	GT	3	6	3663071	3663076	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14026	NC_012032	CTGC	2	8	3663089	3663096	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14027	NC_012032	TA	3	6	3663107	3663112	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14028	NC_012032	GTA	2	6	3663128	3663133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14029	NC_012032	GCA	2	6	3663196	3663201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14030	NC_012032	CAGTT	2	10	3663204	3663213	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
14031	NC_012032	CTG	2	6	3663230	3663235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14032	NC_012032	TTCCAG	2	12	3663243	3663254	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14033	NC_012032	AAT	2	6	3663345	3663350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14034	NC_012032	AGT	2	6	3663373	3663378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14035	NC_012032	ATC	2	6	3663456	3663461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14036	NC_012032	AAACTC	2	12	3663468	3663479	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14037	NC_012032	GAT	2	6	3663485	3663490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14038	NC_012032	TGA	2	6	3663530	3663535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14039	NC_012032	AGCC	2	8	3663582	3663589	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14040	NC_012032	AAG	2	6	3663839	3663844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14041	NC_012032	AGG	2	6	3663885	3663890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14042	NC_012032	TCT	2	6	3664125	3664130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14043	NC_012032	TTCT	2	8	3664139	3664146	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14044	NC_012032	TCG	2	6	3666463	3666468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14045	NC_012032	TAT	2	6	3668522	3668527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14046	NC_012032	AGT	2	6	3668542	3668547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14047	NC_012032	GGT	2	6	3668605	3668610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14048	NC_012032	CGT	2	6	3669111	3669116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14049	NC_012032	AGC	2	6	3669149	3669154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14050	NC_012032	TCG	2	6	3669196	3669201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14051	NC_012032	AG	3	6	3671181	3671186	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14052	NC_012032	CAT	2	6	3671256	3671261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14053	NC_012032	GCT	2	6	3671297	3671302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14054	NC_012032	CAGG	2	8	3671338	3671345	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14055	NC_012032	GTAC	2	8	3671388	3671395	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14056	NC_012032	ATG	2	6	3671438	3671443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14057	NC_012032	GCG	2	6	3671527	3671532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14058	NC_012032	CCTG	2	8	3674513	3674520	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14059	NC_012032	CTGT	2	8	3674535	3674542	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14060	NC_012032	ACG	2	6	3674592	3674597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14061	NC_012032	CCTT	2	8	3675542	3675549	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14062	NC_012032	AGC	2	6	3675604	3675609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14063	NC_012032	CAA	2	6	3675623	3675628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14064	NC_012032	ACG	2	6	3675647	3675652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14065	NC_012032	CTG	2	6	3676556	3676561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14066	NC_012032	GGT	2	6	3676617	3676622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14067	NC_012032	GGT	2	6	3676635	3676640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14068	NC_012032	GT	3	6	3676691	3676696	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14069	NC_012032	GGA	2	6	3676719	3676724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14070	NC_012032	CAA	2	6	3676745	3676750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14071	NC_012032	CGAC	2	8	3676859	3676866	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14072	NC_012032	T	7	7	3676890	3676896	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14073	NC_012032	TA	3	6	3676907	3676912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14074	NC_012032	TGA	2	6	3678975	3678980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14075	NC_012032	GCA	2	6	3679058	3679063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14076	NC_012032	CTC	2	6	3679076	3679081	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14077	NC_012032	TGAA	2	8	3679092	3679099	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14078	NC_012032	TG	3	6	3679125	3679130	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14079	NC_012032	TGC	2	6	3679134	3679139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14080	NC_012032	CCG	2	6	3679202	3679207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14081	NC_012032	CAC	2	6	3679282	3679287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14082	NC_012032	ATC	2	6	3679370	3679375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14083	NC_012032	GGC	2	6	3679489	3679494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14084	NC_012032	GAT	2	6	3679513	3679518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14085	NC_012032	GAA	2	6	3679520	3679525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14086	NC_012032	TGC	2	6	3679567	3679572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14087	NC_012032	GA	3	6	3679599	3679604	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14088	NC_012032	TTC	2	6	3679637	3679642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14089	NC_012032	GCT	2	6	3679660	3679665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14090	NC_012032	TGA	2	6	3679701	3679706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14091	NC_012032	GGA	2	6	3679711	3679716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14092	NC_012032	CCTGG	2	10	3679751	3679760	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
14093	NC_012032	TTG	2	6	3679764	3679769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14095	NC_012032	GCA	2	6	3679786	3679791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14096	NC_012032	GTCAG	2	10	3679836	3679845	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
14097	NC_012032	TG	3	6	3679880	3679885	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14098	NC_012032	GTG	2	6	3679892	3679897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14099	NC_012032	GGC	2	6	3679984	3679989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14100	NC_012032	GTC	2	6	3680111	3680116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14101	NC_012032	GCT	2	6	3680132	3680137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14102	NC_012032	GAA	2	6	3680198	3680203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14103	NC_012032	TGA	2	6	3680205	3680210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14104	NC_012032	TGG	2	6	3680220	3680225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14105	NC_012032	GCC	2	6	3680233	3680238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14106	NC_012032	TGAA	2	8	3680244	3680251	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14107	NC_012032	CAC	2	6	3680256	3680261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14108	NC_012032	TGA	2	6	3680410	3680415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14109	NC_012032	ATG	2	6	3680477	3680482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14110	NC_012032	TC	3	6	3680508	3680513	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14111	NC_012032	CAG	2	6	3680516	3680521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14112	NC_012032	AGC	2	6	3680684	3680689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14113	NC_012032	TC	3	6	3680806	3680811	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14114	NC_012032	G	6	6	3680818	3680823	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
14115	NC_012032	GC	3	6	3680838	3680843	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14116	NC_012032	TATC	2	8	3680844	3680851	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14117	NC_012032	CGG	2	6	3680870	3680875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14118	NC_012032	CT	3	6	3680887	3680892	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14119	NC_012032	TCC	2	6	3680963	3680968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14120	NC_012032	ACA	2	6	3681008	3681013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14121	NC_012032	AGGGCT	2	12	3681032	3681043	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
14122	NC_012032	GCTG	2	8	3681056	3681063	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14123	NC_012032	CAC	2	6	3681072	3681077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14124	NC_012032	GTA	2	6	3681112	3681117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14125	NC_012032	CGTTTG	2	12	3681118	3681129	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14126	NC_012032	GTC	2	6	3681237	3681242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14127	NC_012032	AT	3	6	3681250	3681255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14128	NC_012032	CCCA	2	8	3686123	3686130	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
14129	NC_012032	ACG	2	6	3686161	3686166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14130	NC_012032	A	6	6	3686262	3686267	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14131	NC_012032	GGA	2	6	3686273	3686278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14132	NC_012032	GCG	2	6	3686283	3686288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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14135	NC_012032	TGG	2	6	3686355	3686360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14136	NC_012032	CTC	3	9	3686406	3686414	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14137	NC_012032	CGCA	2	8	3689752	3689759	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14138	NC_012032	GCCA	2	8	3689790	3689797	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14139	NC_012032	TACAT	2	10	3689866	3689875	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
14140	NC_012032	AGA	2	6	3689897	3689902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14142	NC_012032	CGG	2	6	3689942	3689947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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14146	NC_012032	TGG	2	6	3690231	3690236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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14149	NC_012032	GCC	2	6	3690462	3690467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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14154	NC_012032	CCT	2	6	3700918	3700923	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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14157	NC_012032	ACG	2	6	3701152	3701157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14158	NC_012032	A	6	6	3703141	3703146	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14168	NC_012032	CCAG	2	8	3703586	3703593	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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14221	NC_012032	TCC	2	6	3705812	3705817	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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14232	NC_012032	AC	3	6	3706751	3706756	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14233	NC_012032	G	6	6	3706792	3706797	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
14234	NC_012032	AGG	2	6	3706803	3706808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14235	NC_012032	G	6	6	3706807	3706812	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
14236	NC_012032	AC	3	6	3706939	3706944	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14237	NC_012032	GCG	2	6	3707465	3707470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14238	NC_012032	CAA	2	6	3710179	3710184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14239	NC_012032	CT	3	6	3710210	3710215	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14240	NC_012032	CAC	2	6	3710229	3710234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14241	NC_012032	ACC	2	6	3710254	3710259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14242	NC_012032	GGT	2	6	3710922	3710927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14243	NC_012032	CAC	2	6	3710936	3710941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14244	NC_012032	TCC	2	6	3710986	3710991	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14245	NC_012032	CAC	2	6	3711011	3711016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14246	NC_012032	GTT	2	6	3711055	3711060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14247	NC_012032	TCA	2	6	3711105	3711110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14248	NC_012032	TGA	2	6	3711179	3711184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14249	NC_012032	CAA	2	6	3714651	3714656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14250	NC_012032	CCG	2	6	3714663	3714668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14251	NC_012032	T	7	7	3714694	3714700	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14252	NC_012032	GCA	2	6	3714730	3714735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14253	NC_012032	GT	3	6	3722023	3722028	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14254	NC_012032	GAG	2	6	3722124	3722129	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14255	NC_012032	CA	3	6	3722202	3722207	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14256	NC_012032	CAT	2	6	3722209	3722214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14257	NC_012032	TAT	2	6	3722223	3722228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14258	NC_012032	ACG	2	6	3722249	3722254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14259	NC_012032	GCA	2	6	3722314	3722319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14260	NC_012032	CTG	2	6	3722320	3722325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14261	NC_012032	GTTT	2	8	3722332	3722339	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
14262	NC_012032	CCG	2	6	3722342	3722347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14263	NC_012032	GTT	2	6	3722384	3722389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14267	NC_012032	AAG	2	6	3722973	3722978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14286	NC_012032	GCT	2	6	3728661	3728666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14287	NC_012032	AAC	2	6	3728800	3728805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14288	NC_012032	AC	3	6	3728836	3728841	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14289	NC_012032	TCT	2	6	3729863	3729868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14367	NC_012032	GGCAA	2	10	3735388	3735397	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
14368	NC_012032	GCT	2	6	3735427	3735432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14369	NC_012032	CT	3	6	3735431	3735436	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14370	NC_012032	TGT	2	6	3735463	3735468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14371	NC_012032	T	7	7	3735527	3735533	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14372	NC_012032	CT	3	6	3735549	3735554	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14373	NC_012032	GTG	2	6	3735563	3735568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14374	NC_012032	CT	3	6	3735642	3735647	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14375	NC_012032	CCG	2	6	3735652	3735657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14376	NC_012032	GGT	2	6	3735664	3735669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14377	NC_012032	AAC	2	6	3735678	3735683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14378	NC_012032	GTT	2	6	3737359	3737364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14379	NC_012032	CCG	2	6	3737367	3737372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14380	NC_012032	AAGA	2	8	3737406	3737413	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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