MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Chloroflexus sp. Y-400-fl chromosome

Total Repeats: 20181

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_012032	TCC	2	6	3500686	3500691	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13502	NC_012032	AAG	2	6	3500718	3500723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13503	NC_012032	CAG	2	6	3500734	3500739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13504	NC_012032	CT	3	6	3502650	3502655	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13505	NC_012032	CTC	2	6	3502695	3502700	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13506	NC_012032	TTCGT	2	10	3503799	3503808	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
13507	NC_012032	GCA	2	6	3503862	3503867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13508	NC_012032	CGTGTA	2	12	3503872	3503883	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13509	NC_012032	AGC	2	6	3504708	3504713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13510	NC_012032	CTA	2	6	3504784	3504789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13511	NC_012032	GTA	2	6	3504880	3504885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13512	NC_012032	TCGT	2	8	3504915	3504922	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13513	NC_012032	GAC	2	6	3504926	3504931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13514	NC_012032	GTT	2	6	3506530	3506535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13515	NC_012032	TGG	2	6	3506552	3506557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13516	NC_012032	ATC	2	6	3506621	3506626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13517	NC_012032	CAG	2	6	3506659	3506664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13518	NC_012032	GGAA	2	8	3506676	3506683	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13519	NC_012032	GCCC	2	8	3506689	3506696	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13520	NC_012032	AGC	2	6	3506742	3506747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13521	NC_012032	TCTGA	2	10	3508344	3508353	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
13522	NC_012032	TTG	2	6	3514865	3514870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13523	NC_012032	GCTC	2	8	3514959	3514966	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13524	NC_012032	TGT	2	6	3515051	3515056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13525	NC_012032	ATG	2	6	3515060	3515065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13526	NC_012032	TCGT	2	8	3518193	3518200	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13527	NC_012032	GCAT	3	12	3518214	3518225	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13528	NC_012032	TTC	2	6	3518268	3518273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13529	NC_012032	CTT	2	6	3519071	3519076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13530	NC_012032	CGC	2	6	3519276	3519281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13531	NC_012032	TTCC	2	8	3519333	3519340	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13532	NC_012032	TCCC	2	8	3519342	3519349	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
13533	NC_012032	AT	3	6	3519366	3519371	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13534	NC_012032	TTG	2	6	3519449	3519454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13535	NC_012032	CGC	2	6	3519511	3519516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13536	NC_012032	AGTGT	2	10	3519535	3519544	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
13537	NC_012032	CAA	2	6	3521654	3521659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13538	NC_012032	CTC	2	6	3522369	3522374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13539	NC_012032	TTG	2	6	3522382	3522387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13540	NC_012032	CGC	2	6	3523588	3523593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13541	NC_012032	TAT	2	6	3523656	3523661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13542	NC_012032	AGT	2	6	3523804	3523809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13543	NC_012032	T	6	6	3523912	3523917	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13544	NC_012032	TGA	2	6	3523960	3523965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13545	NC_012032	ATT	2	6	3523993	3523998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13546	NC_012032	TCG	2	6	3524845	3524850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13547	NC_012032	GTT	2	6	3524868	3524873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13548	NC_012032	CGCA	2	8	3525589	3525596	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13549	NC_012032	AAC	2	6	3525672	3525677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13550	NC_012032	CTG	2	6	3525685	3525690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13551	NC_012032	GTC	2	6	3525735	3525740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13552	NC_012032	CA	3	6	3526512	3526517	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13553	NC_012032	TGT	2	6	3526650	3526655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13554	NC_012032	CTT	2	6	3526660	3526665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13555	NC_012032	TCT	2	6	3526688	3526693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13556	NC_012032	AGC	2	6	3526781	3526786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13557	NC_012032	TTGCG	2	10	3526847	3526856	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
13558	NC_012032	ATG	3	9	3526864	3526872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13559	NC_012032	T	6	6	3526897	3526902	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13560	NC_012032	AT	3	6	3526927	3526932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13561	NC_012032	TTC	2	6	3526992	3526997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13562	NC_012032	CAA	2	6	3527063	3527068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13563	NC_012032	AG	3	6	3527121	3527126	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13564	NC_012032	GCT	2	6	3527132	3527137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13565	NC_012032	GAG	2	6	3531649	3531654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13566	NC_012032	ATGC	2	8	3532653	3532660	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13567	NC_012032	AGT	2	6	3532663	3532668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13568	NC_012032	CAG	2	6	3532691	3532696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13569	NC_012032	GGC	2	6	3542137	3542142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13570	NC_012032	TGG	2	6	3542150	3542155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13571	NC_012032	GCT	2	6	3542174	3542179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13572	NC_012032	CCCGT	2	10	3542214	3542223	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
13573	NC_012032	TGA	2	6	3542277	3542282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13574	NC_012032	CGA	2	6	3542286	3542291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13575	NC_012032	GGCG	2	8	3542293	3542300	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
13576	NC_012032	TGC	2	6	3542331	3542336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13577	NC_012032	CTT	2	6	3542434	3542439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13578	NC_012032	CAA	2	6	3545241	3545246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13579	NC_012032	ATA	2	6	3545266	3545271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13580	NC_012032	TACA	2	8	3546111	3546118	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13581	NC_012032	GAT	2	6	3546132	3546137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13582	NC_012032	TG	3	6	3546167	3546172	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13583	NC_012032	ATTG	2	8	3546427	3546434	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13584	NC_012032	GGT	2	6	3546851	3546856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13585	NC_012032	CAC	2	6	3546860	3546865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13586	NC_012032	TTAC	2	8	3546889	3546896	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13587	NC_012032	GCC	3	9	3546950	3546958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13588	NC_012032	GCG	2	6	3546962	3546967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13589	NC_012032	TGA	2	6	3546969	3546974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13590	NC_012032	GAT	2	6	3546979	3546984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13591	NC_012032	CCT	2	6	3547167	3547172	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13592	NC_012032	AGT	2	6	3547252	3547257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13593	NC_012032	CGA	2	6	3549022	3549027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13594	NC_012032	CT	3	6	3549097	3549102	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13595	NC_012032	CAC	2	6	3549110	3549115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13596	NC_012032	ATG	2	6	3549166	3549171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13597	NC_012032	AC	3	6	3549230	3549235	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13598	NC_012032	CTC	3	9	3553365	3553373	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13599	NC_012032	GCA	2	6	3553485	3553490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13601	NC_012032	CATT	2	8	3557700	3557707	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13602	NC_012032	CGG	2	6	3557793	3557798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13603	NC_012032	TA	3	6	3557831	3557836	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13604	NC_012032	CGG	2	6	3559717	3559722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13605	NC_012032	CTGGC	2	10	3559760	3559769	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
13606	NC_012032	GACTT	2	10	3559806	3559815	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
13607	NC_012032	GGTG	2	8	3559839	3559846	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
13608	NC_012032	CGC	2	6	3559906	3559911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13609	NC_012032	CGTG	2	8	3559949	3559956	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13610	NC_012032	CCG	2	6	3559970	3559975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13611	NC_012032	CGT	2	6	3559985	3559990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13612	NC_012032	CGC	2	6	3560008	3560013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13613	NC_012032	CG	3	6	3560051	3560056	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13614	NC_012032	CCG	2	6	3560072	3560077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13615	NC_012032	TGTTA	2	10	3560758	3560767	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
13616	NC_012032	TCTCT	2	10	3560773	3560782	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
13617	NC_012032	ATG	2	6	3560803	3560808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13618	NC_012032	TTG	2	6	3560886	3560891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13619	NC_012032	GCT	2	6	3561650	3561655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13620	NC_012032	TGGG	2	8	3563732	3563739	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
13621	NC_012032	AGC	2	6	3565077	3565082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13622	NC_012032	CTCG	2	8	3565087	3565094	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13623	NC_012032	TACA	2	8	3565151	3565158	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13624	NC_012032	ATG	2	6	3565170	3565175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13625	NC_012032	AGG	2	6	3565369	3565374	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13626	NC_012032	CTG	2	6	3566677	3566682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13628	NC_012032	CCT	3	9	3566939	3566947	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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13885	NC_012032	AG	3	6	3641998	3642003	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13886	NC_012032	TGC	2	6	3642090	3642095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13887	NC_012032	GCA	2	6	3642097	3642102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13890	NC_012032	AG	3	6	3642192	3642197	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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13994	NC_012032	AATG	2	8	3660505	3660512	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13995	NC_012032	T	6	6	3660532	3660537	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13996	NC_012032	ATAGCG	2	12	3660565	3660576	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13997	NC_012032	CAG	2	6	3660577	3660582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13998	NC_012032	T	7	7	3660598	3660604	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13999	NC_012032	TCC	2	6	3660802	3660807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14000	NC_012032	GTG	2	6	3660816	3660821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

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