MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Chloroflexus sp. Y-400-fl chromosome

Total Repeats: 20181

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_012032	TGGCCG	2	12	2926503	2926514	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
11502	NC_012032	CAA	2	6	2926540	2926545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11503	NC_012032	GACT	2	8	2926578	2926585	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11504	NC_012032	CCGT	2	8	2926941	2926948	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11505	NC_012032	GCC	2	6	2926953	2926958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11506	NC_012032	CTC	2	6	2926981	2926986	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11507	NC_012032	GC	3	6	2927012	2927017	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11508	NC_012032	GC	3	6	2927056	2927061	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11509	NC_012032	GCCC	2	8	2928892	2928899	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11510	NC_012032	TGCCGG	2	12	2928917	2928928	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
11511	NC_012032	GCAG	2	8	2929011	2929018	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11512	NC_012032	GAT	2	6	2929028	2929033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11513	NC_012032	GCA	2	6	2929128	2929133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11514	NC_012032	ATG	2	6	2929167	2929172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11515	NC_012032	GACAA	2	10	2929177	2929186	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
11516	NC_012032	CAGA	2	8	2929242	2929249	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11517	NC_012032	TGG	2	6	2929271	2929276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11518	NC_012032	GCA	2	6	2929319	2929324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11519	NC_012032	ATG	2	6	2929385	2929390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11520	NC_012032	GCA	3	9	2929423	2929431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11521	NC_012032	GCA	2	6	2929437	2929442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11522	NC_012032	GGT	2	6	2929487	2929492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11523	NC_012032	CAC	2	6	2929514	2929519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11524	NC_012032	GCG	2	6	2933605	2933610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11525	NC_012032	G	6	6	2933685	2933690	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11526	NC_012032	GT	3	6	2933781	2933786	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11527	NC_012032	TGC	2	6	2933806	2933811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11528	NC_012032	G	6	6	2933866	2933871	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11529	NC_012032	GCA	2	6	2933888	2933893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11530	NC_012032	T	6	6	2933900	2933905	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11531	NC_012032	CAC	2	6	2933925	2933930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11532	NC_012032	ATG	2	6	2933983	2933988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11533	NC_012032	ACA	2	6	2934095	2934100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11534	NC_012032	AG	3	6	2934181	2934186	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11535	NC_012032	GTC	2	6	2935061	2935066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11536	NC_012032	ACC	2	6	2935161	2935166	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11537	NC_012032	ATC	2	6	2935242	2935247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11538	NC_012032	TGC	2	6	2935267	2935272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11539	NC_012032	GGGT	2	8	2935324	2935331	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
11540	NC_012032	GC	3	6	2935380	2935385	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11541	NC_012032	GC	3	6	2935391	2935396	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11542	NC_012032	GC	3	6	2935419	2935424	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11543	NC_012032	GC	4	8	2935430	2935437	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11544	NC_012032	TGCT	2	8	2935451	2935458	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11545	NC_012032	ATA	2	6	2935490	2935495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11546	NC_012032	ATC	2	6	2935516	2935521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11547	NC_012032	GAC	2	6	2935599	2935604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11548	NC_012032	CTC	2	6	2935627	2935632	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11549	NC_012032	ATG	2	6	2935633	2935638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11550	NC_012032	TGA	2	6	2935647	2935652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11551	NC_012032	CAG	2	6	2935658	2935663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11552	NC_012032	CAGCG	2	10	2935680	2935689	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
11553	NC_012032	TGG	2	6	2935690	2935695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11554	NC_012032	ATT	2	6	2936811	2936816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11555	NC_012032	CA	3	6	2936838	2936843	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11556	NC_012032	CAAC	2	8	2936869	2936876	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11557	NC_012032	GTG	2	6	2936884	2936889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11558	NC_012032	ACCA	2	8	2936922	2936929	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11559	NC_012032	GT	3	6	2936961	2936966	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11560	NC_012032	GTT	2	6	2937031	2937036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11561	NC_012032	CCGGTG	2	12	2937058	2937069	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
11562	NC_012032	CT	3	6	2937086	2937091	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11563	NC_012032	TGG	2	6	2937106	2937111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11564	NC_012032	GGTG	2	8	2937138	2937145	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
11565	NC_012032	GACA	2	8	2937147	2937154	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11566	NC_012032	G	6	6	2937210	2937215	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11567	NC_012032	CAA	2	6	2937223	2937228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11568	NC_012032	A	6	6	2938010	2938015	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11569	NC_012032	TGGA	2	8	2938029	2938036	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11570	NC_012032	TTG	2	6	2938068	2938073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11571	NC_012032	G	6	6	2938158	2938163	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11572	NC_012032	GATG	2	8	2938177	2938184	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11573	NC_012032	TGAA	2	8	2938227	2938234	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11574	NC_012032	TCA	2	6	2938352	2938357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11575	NC_012032	CGT	2	6	2938390	2938395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11576	NC_012032	TCA	2	6	2938429	2938434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11577	NC_012032	GCTGT	2	10	2938436	2938445	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
11578	NC_012032	TGA	2	6	2938471	2938476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11579	NC_012032	CCTAC	2	10	2938505	2938514	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
11580	NC_012032	GGT	2	6	2938529	2938534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11581	NC_012032	GGGT	2	8	2938541	2938548	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
11582	NC_012032	CGA	2	6	2938794	2938799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11584	NC_012032	T	6	6	2938838	2938843	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11585	NC_012032	T	6	6	2938859	2938864	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11586	NC_012032	TGA	2	6	2938908	2938913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11587	NC_012032	GAG	2	6	2939780	2939785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11588	NC_012032	GTT	2	6	2939786	2939791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11589	NC_012032	AT	5	10	2939913	2939922	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11590	NC_012032	CTT	2	6	2939933	2939938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11592	NC_012032	TGTT	2	8	2940008	2940015	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11593	NC_012032	GC	3	6	2940032	2940037	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11594	NC_012032	CTG	3	9	2940040	2940048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11595	NC_012032	TCAT	2	8	2940122	2940129	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11596	NC_012032	TCAT	2	8	2940319	2940326	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11597	NC_012032	TGAC	2	8	2940438	2940445	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11598	NC_012032	GT	3	6	2940518	2940523	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11599	NC_012032	GTA	2	6	2940541	2940546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11600	NC_012032	TGA	2	6	2940571	2940576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11601	NC_012032	GGTC	2	8	2940611	2940618	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11602	NC_012032	CT	3	6	2942224	2942229	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11603	NC_012032	ATG	2	6	2942824	2942829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11605	NC_012032	CTTC	2	8	2944501	2944508	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11606	NC_012032	CACCGG	2	12	2944685	2944696	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
11607	NC_012032	GTGGG	2	10	2944700	2944709	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
11608	NC_012032	GAC	2	6	2944719	2944724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11609	NC_012032	TGG	2	6	2944736	2944741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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11611	NC_012032	GGT	2	6	2944869	2944874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11612	NC_012032	GCA	2	6	2945007	2945012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11613	NC_012032	TCCT	2	8	2945018	2945025	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11614	NC_012032	TGG	2	6	2945036	2945041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11615	NC_012032	GCG	2	6	2945060	2945065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11616	NC_012032	GTG	2	6	2945098	2945103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11617	NC_012032	C	6	6	2945206	2945211	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11618	NC_012032	CGC	2	6	2945328	2945333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11619	NC_012032	ACA	2	6	2945344	2945349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11621	NC_012032	CGTTTG	2	12	2945406	2945417	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11622	NC_012032	CGG	2	6	2945433	2945438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11623	NC_012032	GCC	2	6	2945443	2945448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11624	NC_012032	ACG	2	6	2945477	2945482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11625	NC_012032	CGG	2	6	2945493	2945498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11626	NC_012032	GTG	2	6	2945553	2945558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11627	NC_012032	GAG	2	6	2947561	2947566	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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11629	NC_012032	TCT	2	6	2963498	2963503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11758	NC_012032	TGA	2	6	2986361	2986366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11759	NC_012032	ATC	2	6	2988134	2988139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11760	NC_012032	GC	3	6	2988161	2988166	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11761	NC_012032	CAA	2	6	2988173	2988178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11765	NC_012032	CAG	2	6	2989280	2989285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11885	NC_012032	TCAC	2	8	3000707	3000714	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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