MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Chloroflexus sp. Y-400-fl chromosome

Total Repeats: 20181

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_012032	TGCC	2	8	2592880	2592887	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10502	NC_012032	GCT	2	6	2592889	2592894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10503	NC_012032	TCA	2	6	2593013	2593018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10504	NC_012032	TCT	2	6	2593034	2593039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10505	NC_012032	TC	3	6	2593042	2593047	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10506	NC_012032	C	6	6	2593059	2593064	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10507	NC_012032	GAA	2	6	2593068	2593073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10508	NC_012032	AAC	2	6	2593125	2593130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10509	NC_012032	GCA	2	6	2593142	2593147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10510	NC_012032	CAA	2	6	2594218	2594223	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10511	NC_012032	TGG	2	6	2594240	2594245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10512	NC_012032	TG	3	6	2594280	2594285	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10513	NC_012032	GAG	2	6	2594314	2594319	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10514	NC_012032	TTA	2	6	2594379	2594384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10515	NC_012032	AT	3	6	2594394	2594399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10516	NC_012032	CTG	2	6	2594420	2594425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10517	NC_012032	GCG	2	6	2594442	2594447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10518	NC_012032	ACG	2	6	2594453	2594458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10519	NC_012032	TC	4	8	2596011	2596018	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10520	NC_012032	GAA	2	6	2597226	2597231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10521	NC_012032	GAA	2	6	2597311	2597316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10522	NC_012032	AGG	2	6	2597358	2597363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10523	NC_012032	TCA	2	6	2597934	2597939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10524	NC_012032	GGT	2	6	2597949	2597954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10525	NC_012032	CCG	2	6	2597980	2597985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10526	NC_012032	CCTG	2	8	2598011	2598018	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10527	NC_012032	CCG	2	6	2598058	2598063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10528	NC_012032	CCG	2	6	2598091	2598096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10529	NC_012032	CTC	2	6	2598460	2598465	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10530	NC_012032	TGGG	2	8	2598470	2598477	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
10531	NC_012032	AGA	2	6	2598478	2598483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10532	NC_012032	G	6	6	2598493	2598498	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10533	NC_012032	TGAGG	2	10	2598499	2598508	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
10534	NC_012032	ATG	2	6	2598535	2598540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10535	NC_012032	CCCT	2	8	2598549	2598556	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
10536	NC_012032	CGA	2	6	2598571	2598576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10537	NC_012032	GCT	2	6	2598628	2598633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10538	NC_012032	CTC	2	6	2601134	2601139	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10539	NC_012032	GAT	2	6	2601163	2601168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10540	NC_012032	AG	4	8	2601185	2601192	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10541	NC_012032	AG	3	6	2601220	2601225	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10542	NC_012032	CCT	2	6	2601366	2601371	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10543	NC_012032	TCG	2	6	2601401	2601406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10544	NC_012032	GTG	2	6	2602239	2602244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10545	NC_012032	TC	3	6	2604102	2604107	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10546	NC_012032	TGA	2	6	2604126	2604131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10547	NC_012032	TC	3	6	2604163	2604168	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10548	NC_012032	ACG	3	9	2604172	2604180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10549	NC_012032	AAG	2	6	2604181	2604186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10550	NC_012032	T	7	7	2604225	2604231	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10551	NC_012032	CCT	2	6	2609448	2609453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10552	NC_012032	TCAC	2	8	2609457	2609464	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10553	NC_012032	CTT	2	6	2609465	2609470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10554	NC_012032	CCA	2	6	2609507	2609512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10555	NC_012032	GCAC	2	8	2610943	2610950	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10556	NC_012032	TCT	2	6	2611023	2611028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10557	NC_012032	GCA	2	6	2611039	2611044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10558	NC_012032	GCAC	2	8	2611088	2611095	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10559	NC_012032	CTGG	2	8	2611128	2611135	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10560	NC_012032	TCT	2	6	2611168	2611173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10561	NC_012032	GCA	2	6	2611184	2611189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10562	NC_012032	GGC	2	6	2611204	2611209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10563	NC_012032	GCAC	2	8	2611233	2611240	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10564	NC_012032	CTGG	2	8	2611273	2611280	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10565	NC_012032	TCT	2	6	2611313	2611318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10566	NC_012032	GCA	2	6	2611329	2611334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10567	NC_012032	GGC	2	6	2611349	2611354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10568	NC_012032	GCAC	2	8	2611378	2611385	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10569	NC_012032	TCT	2	6	2611458	2611463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10570	NC_012032	GCA	2	6	2611474	2611479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10571	NC_012032	GC	4	8	2611502	2611509	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10572	NC_012032	CCA	2	6	2611531	2611536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10573	NC_012032	GC	3	6	2611575	2611580	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10574	NC_012032	ACT	2	6	2611633	2611638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10576	NC_012032	CCA	2	6	2611736	2611741	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10577	NC_012032	AC	3	6	2611796	2611801	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10578	NC_012032	TCA	2	6	2611907	2611912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10579	NC_012032	TCTGC	2	10	2611941	2611950	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
10580	NC_012032	GAG	2	6	2611962	2611967	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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10582	NC_012032	CT	3	6	2613439	2613444	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10583	NC_012032	ACC	2	6	2613742	2613747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10584	NC_012032	GAT	2	6	2613831	2613836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10585	NC_012032	ACG	2	6	2613844	2613849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10586	NC_012032	CAC	2	6	2613855	2613860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10587	NC_012032	TCC	2	6	2613948	2613953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10588	NC_012032	CCG	2	6	2614009	2614014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10589	NC_012032	C	6	6	2614035	2614040	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10590	NC_012032	C	7	7	2614042	2614048	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10591	NC_012032	AGGTA	2	10	2614080	2614089	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
10592	NC_012032	TTC	2	6	2614114	2614119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10594	NC_012032	GCT	2	6	2614822	2614827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10596	NC_012032	GAC	2	6	2615343	2615348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10598	NC_012032	CGA	2	6	2615378	2615383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10599	NC_012032	ACC	2	6	2615501	2615506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10600	NC_012032	TACCG	2	10	2615516	2615525	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
10601	NC_012032	TCA	2	6	2615528	2615533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10602	NC_012032	TCC	2	6	2616260	2616265	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10603	NC_012032	GTGA	2	8	2616269	2616276	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10604	NC_012032	GAACC	2	10	2616310	2616319	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
10605	NC_012032	AAATAT	2	12	2616397	2616408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10607	NC_012032	CTG	2	6	2616517	2616522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10608	NC_012032	TTG	2	6	2616566	2616571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10609	NC_012032	CAC	2	6	2616574	2616579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10610	NC_012032	CTGC	2	8	2616581	2616588	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10611	NC_012032	TGT	2	6	2616596	2616601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10612	NC_012032	AGG	2	6	2616629	2616634	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10613	NC_012032	TAT	2	6	2616707	2616712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10614	NC_012032	GAG	2	6	2616718	2616723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10615	NC_012032	GGCA	2	8	2619917	2619924	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10616	NC_012032	TGCC	2	8	2619931	2619938	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10617	NC_012032	ATG	2	6	2619973	2619978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10618	NC_012032	AAG	2	6	2620121	2620126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10619	NC_012032	GT	3	6	2624188	2624193	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10620	NC_012032	CAC	2	6	2624284	2624289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10621	NC_012032	GGAT	2	8	2624310	2624317	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10622	NC_012032	TGG	2	6	2624325	2624330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10623	NC_012032	CGT	2	6	2624397	2624402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10624	NC_012032	TGA	2	6	2624570	2624575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10625	NC_012032	GCG	2	6	2624594	2624599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10626	NC_012032	AC	3	6	2624603	2624608	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10627	NC_012032	TGA	2	6	2624627	2624632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10628	NC_012032	GT	3	6	2624676	2624681	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10629	NC_012032	AGCC	2	8	2625026	2625033	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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10758	NC_012032	CT	3	6	2650319	2650324	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10759	NC_012032	TCC	2	6	2655456	2655461	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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10990	NC_012032	GTT	2	6	2735731	2735736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10997	NC_012032	ACC	2	6	2736104	2736109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10998	NC_012032	GGGC	2	8	2736142	2736149	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10999	NC_012032	GT	3	6	2736225	2736230	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11000	NC_012032	TGT	2	6	2736255	2736260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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