MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Chloroflexus sp. Y-400-fl chromosome

Total Repeats: 20181

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9501	NC_012032	GGT	2	6	2319440	2319445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9502	NC_012032	TGG	2	6	2319468	2319473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9503	NC_012032	GAA	2	6	2319497	2319502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9504	NC_012032	ATTA	2	8	2319511	2319518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9505	NC_012032	ACATG	2	10	2319529	2319538	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
9506	NC_012032	CA	4	8	2319546	2319553	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9507	NC_012032	TGC	2	6	2319622	2319627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9508	NC_012032	GTT	2	6	2319714	2319719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9509	NC_012032	CCG	2	6	2319737	2319742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9510	NC_012032	GGC	2	6	2319817	2319822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9511	NC_012032	CGT	2	6	2319844	2319849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9512	NC_012032	TG	3	6	2319907	2319912	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9513	NC_012032	TCC	2	6	2322315	2322320	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9514	NC_012032	ATC	2	6	2323485	2323490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9515	NC_012032	GTT	2	6	2323597	2323602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9516	NC_012032	GTA	2	6	2323646	2323651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9517	NC_012032	CGG	2	6	2323653	2323658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9518	NC_012032	AGC	2	6	2323673	2323678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9519	NC_012032	TCAT	2	8	2323691	2323698	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9520	NC_012032	GAC	2	6	2323707	2323712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9521	NC_012032	CA	4	8	2323727	2323734	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9522	NC_012032	GCA	2	6	2323793	2323798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9523	NC_012032	GCAAC	2	10	2323846	2323855	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
9524	NC_012032	GTT	2	6	2323885	2323890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9525	NC_012032	CTC	2	6	2323895	2323900	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9526	NC_012032	GCT	2	6	2323901	2323906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9527	NC_012032	ACG	2	6	2323974	2323979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9528	NC_012032	GGT	2	6	2324088	2324093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9529	NC_012032	CGACC	2	10	2324111	2324120	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
9530	NC_012032	CA	3	6	2325341	2325346	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9531	NC_012032	ATGCA	2	10	2325370	2325379	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
9532	NC_012032	ATG	2	6	2327172	2327177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9533	NC_012032	TCCG	2	8	2329956	2329963	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9534	NC_012032	GTG	2	6	2329964	2329969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9535	NC_012032	TCC	2	6	2330198	2330203	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9536	NC_012032	GTG	2	6	2330212	2330217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9537	NC_012032	ACATT	2	10	2330336	2330345	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
9538	NC_012032	GAG	2	6	2330352	2330357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9539	NC_012032	GTC	2	6	2330358	2330363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9540	NC_012032	GAT	2	6	2331256	2331261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9541	NC_012032	CTT	2	6	2331354	2331359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9542	NC_012032	ATG	2	6	2331370	2331375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9543	NC_012032	ACT	2	6	2332040	2332045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9544	NC_012032	TACAA	2	10	2333526	2333535	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
9545	NC_012032	CAT	2	6	2335068	2335073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9546	NC_012032	TGT	2	6	2335076	2335081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9547	NC_012032	AAGGT	2	10	2335085	2335094	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
9548	NC_012032	TC	3	6	2335131	2335136	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9549	NC_012032	GAG	2	6	2336333	2336338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9550	NC_012032	GTGC	2	8	2336351	2336358	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9551	NC_012032	GTG	2	6	2336385	2336390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9552	NC_012032	CAG	2	6	2336401	2336406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9553	NC_012032	TGA	2	6	2336517	2336522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9554	NC_012032	ACC	2	6	2336543	2336548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9555	NC_012032	CGTG	2	8	2336589	2336596	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9556	NC_012032	GCC	2	6	2336607	2336612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9557	NC_012032	GTT	3	9	2336618	2336626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9558	NC_012032	GAT	2	6	2336679	2336684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9559	NC_012032	CTG	2	6	2336710	2336715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9560	NC_012032	CCG	3	9	2336848	2336856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9561	NC_012032	TGGCCG	2	12	2336865	2336876	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
9562	NC_012032	CAA	2	6	2336902	2336907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9563	NC_012032	CATG	2	8	2336929	2336936	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9564	NC_012032	GACG	2	8	2336940	2336947	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9565	NC_012032	GAT	2	6	2336949	2336954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9566	NC_012032	GCA	2	6	2337036	2337041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9567	NC_012032	ATG	2	6	2337075	2337080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9568	NC_012032	GAGGG	2	10	2337233	2337242	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
9569	NC_012032	TCATT	2	10	2337816	2337825	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
9570	NC_012032	AAT	2	6	2337835	2337840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9571	NC_012032	CTAA	2	8	2337868	2337875	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9572	NC_012032	GTTTCG	2	12	2338323	2338334	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
9573	NC_012032	GAAA	2	8	2338351	2338358	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9574	NC_012032	CT	3	6	2342174	2342179	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9575	NC_012032	GAT	2	6	2342245	2342250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9576	NC_012032	GTAGG	2	10	2342268	2342277	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
9577	NC_012032	AG	3	6	2342306	2342311	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9578	NC_012032	TGC	2	6	2345079	2345084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9579	NC_012032	TCC	2	6	2345249	2345254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9580	NC_012032	CTA	2	6	2345300	2345305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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9582	NC_012032	TTG	2	6	2345364	2345369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9583	NC_012032	GC	3	6	2345422	2345427	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9584	NC_012032	GC	3	6	2345433	2345438	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9585	NC_012032	GC	3	6	2345486	2345491	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9586	NC_012032	TGG	2	6	2345551	2345556	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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9591	NC_012032	TGAG	2	8	2345809	2345816	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
9592	NC_012032	TCAG	2	8	2345856	2345863	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9593	NC_012032	TTG	2	6	2345895	2345900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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9595	NC_012032	GTC	2	6	2345999	2346004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9597	NC_012032	GATTT	2	10	2346138	2346147	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
9598	NC_012032	CT	4	8	2346194	2346201	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9599	NC_012032	AGA	2	6	2347770	2347775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9600	NC_012032	GA	4	8	2347813	2347820	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9601	NC_012032	GTG	2	6	2348079	2348084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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9603	NC_012032	GCC	2	6	2348111	2348116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9604	NC_012032	AAC	2	6	2348139	2348144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9605	NC_012032	GTG	2	6	2348146	2348151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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9607	NC_012032	TTTG	2	8	2348728	2348735	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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9609	NC_012032	GCT	2	6	2350047	2350052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9612	NC_012032	CAT	2	6	2351662	2351667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9613	NC_012032	CCA	2	6	2351690	2351695	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9614	NC_012032	CCT	2	6	2351740	2351745	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9615	NC_012032	TCA	2	6	2353142	2353147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9616	NC_012032	TCT	2	6	2353265	2353270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9617	NC_012032	ATG	2	6	2353321	2353326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9618	NC_012032	GGCG	2	8	2356857	2356864	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
9619	NC_012032	GATA	2	8	2356932	2356939	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9620	NC_012032	TGG	2	6	2356967	2356972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9621	NC_012032	ATG	2	6	2357031	2357036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9622	NC_012032	TGA	2	6	2357054	2357059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9623	NC_012032	CAC	2	6	2358030	2358035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9624	NC_012032	GAT	2	6	2358246	2358251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9625	NC_012032	AC	3	6	2358262	2358267	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9626	NC_012032	ATC	2	6	2358268	2358273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9627	NC_012032	GCT	2	6	2358324	2358329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9629	NC_012032	ATG	2	6	2358372	2358377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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9631	NC_012032	GCT	2	6	2358417	2358422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9633	NC_012032	TCA	2	6	2358547	2358552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9634	NC_012032	GCT	2	6	2358663	2358668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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