MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Chloroflexus sp. Y-400-fl chromosome

Total Repeats: 20181

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_012032	CA	3	6	2004974	2004979	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8002	NC_012032	TGAT	2	8	2005018	2005025	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8003	NC_012032	TCA	2	6	2005042	2005047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8004	NC_012032	AG	3	6	2005051	2005056	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8005	NC_012032	TC	3	6	2006689	2006694	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8006	NC_012032	TGAT	2	8	2006714	2006721	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8007	NC_012032	TTG	2	6	2006743	2006748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8008	NC_012032	CCG	2	6	2007310	2007315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8009	NC_012032	GCAT	2	8	2007361	2007368	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8010	NC_012032	AAT	2	6	2008071	2008076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8011	NC_012032	CAGG	2	8	2008124	2008131	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8012	NC_012032	TTG	2	6	2008225	2008230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8013	NC_012032	GTG	3	9	2008252	2008260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8014	NC_012032	GTG	2	6	2008327	2008332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8015	NC_012032	ATT	2	6	2008357	2008362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8016	NC_012032	GGT	2	6	2008402	2008407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8017	NC_012032	CCT	2	6	2009248	2009253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8018	NC_012032	TAC	2	6	2010058	2010063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8019	NC_012032	TCA	2	6	2012204	2012209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8020	NC_012032	CGA	2	6	2012213	2012218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8021	NC_012032	TTC	2	6	2012233	2012238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8022	NC_012032	CGC	2	6	2012257	2012262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8023	NC_012032	TGC	2	6	2012286	2012291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8024	NC_012032	CCG	2	6	2012319	2012324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8025	NC_012032	TGG	2	6	2012388	2012393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8026	NC_012032	GTT	2	6	2012414	2012419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8027	NC_012032	TGC	2	6	2013311	2013316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8028	NC_012032	CCT	2	6	2013885	2013890	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8029	NC_012032	TGA	2	6	2013898	2013903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8030	NC_012032	TGT	2	6	2013911	2013916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8031	NC_012032	GT	3	6	2013922	2013927	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8032	NC_012032	CGAAAT	2	12	2013968	2013979	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8033	NC_012032	TCT	2	6	2014016	2014021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8034	NC_012032	TTG	2	6	2014033	2014038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8035	NC_012032	AGG	2	6	2014114	2014119	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8036	NC_012032	AGC	2	6	2016183	2016188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8037	NC_012032	AT	3	6	2016620	2016625	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8038	NC_012032	GAAGA	2	10	2019900	2019909	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
8039	NC_012032	ATG	2	6	2019939	2019944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8040	NC_012032	TGA	2	6	2020354	2020359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8041	NC_012032	CGC	2	6	2020371	2020376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8042	NC_012032	ATA	3	9	2021481	2021489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8043	NC_012032	ACG	2	6	2021547	2021552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8044	NC_012032	TCC	2	6	2021666	2021671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8045	NC_012032	GTG	2	6	2021680	2021685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8046	NC_012032	TAA	3	9	2021706	2021714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8047	NC_012032	CT	3	6	2021781	2021786	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8048	NC_012032	TGC	2	6	2024312	2024317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8049	NC_012032	CCG	2	6	2024331	2024336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8050	NC_012032	GCA	2	6	2024343	2024348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8051	NC_012032	TCC	2	6	2027174	2027179	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8052	NC_012032	TTC	2	6	2030453	2030458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8053	NC_012032	CGAA	2	8	2031253	2031260	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8054	NC_012032	GAA	2	6	2031291	2031296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8055	NC_012032	AAC	2	6	2031529	2031534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8056	NC_012032	CGT	2	6	2031566	2031571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8057	NC_012032	TCG	2	6	2031585	2031590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8058	NC_012032	TC	3	6	2031628	2031633	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8059	NC_012032	TCC	2	6	2031673	2031678	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8060	NC_012032	CCA	2	6	2031694	2031699	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8061	NC_012032	TTC	2	6	2031733	2031738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8062	NC_012032	ATT	2	6	2031763	2031768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8063	NC_012032	TGT	2	6	2031773	2031778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8064	NC_012032	TA	3	6	2031805	2031810	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8065	NC_012032	TA	4	8	2031856	2031863	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8066	NC_012032	TAT	2	6	2031871	2031876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8067	NC_012032	TTC	2	6	2031919	2031924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8068	NC_012032	AGG	2	6	2033533	2033538	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8069	NC_012032	CAA	2	6	2034834	2034839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8070	NC_012032	GGT	2	6	2034892	2034897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8071	NC_012032	AGC	2	6	2035523	2035528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8072	NC_012032	GAA	2	6	2035591	2035596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8073	NC_012032	TGAA	2	8	2035710	2035717	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8074	NC_012032	CA	3	6	2035737	2035742	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8075	NC_012032	GAT	2	6	2035749	2035754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8076	NC_012032	ATG	2	6	2035762	2035767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8077	NC_012032	GCA	2	6	2035771	2035776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8078	NC_012032	CTG	2	6	2036862	2036867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8079	NC_012032	GAT	2	6	2036870	2036875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8080	NC_012032	CAT	2	6	2036893	2036898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8081	NC_012032	AT	3	6	2036903	2036908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8082	NC_012032	GCA	2	6	2039502	2039507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8083	NC_012032	TGA	2	6	2040377	2040382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8084	NC_012032	TGC	2	6	2040422	2040427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8085	NC_012032	AT	3	6	2040478	2040483	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8086	NC_012032	CT	3	6	2040559	2040564	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8087	NC_012032	TCG	2	6	2040619	2040624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8088	NC_012032	C	6	6	2040643	2040648	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8089	NC_012032	CT	3	6	2040656	2040661	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8090	NC_012032	ATT	2	6	2040755	2040760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8091	NC_012032	CCCT	2	8	2040778	2040785	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
8092	NC_012032	CTT	2	6	2040826	2040831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8093	NC_012032	GTG	2	6	2040965	2040970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8094	NC_012032	GTTGC	2	10	2041025	2041034	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
8095	NC_012032	TCA	2	6	2041085	2041090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8096	NC_012032	GGTG	2	8	2041117	2041124	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
8097	NC_012032	GGC	2	6	2041155	2041160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8098	NC_012032	TG	3	6	2041181	2041186	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8099	NC_012032	AGC	2	6	2041235	2041240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8100	NC_012032	CGG	2	6	2041252	2041257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8101	NC_012032	GCG	2	6	2041267	2041272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8102	NC_012032	ATGC	2	8	2041291	2041298	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8103	NC_012032	CGG	3	9	2041319	2041327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8104	NC_012032	GA	3	6	2041329	2041334	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8105	NC_012032	GGA	2	6	2041347	2041352	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8106	NC_012032	GAC	2	6	2041401	2041406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8107	NC_012032	TGTA	2	8	2041474	2041481	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8108	NC_012032	ACT	2	6	2041510	2041515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8109	NC_012032	TTC	2	6	2041557	2041562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8110	NC_012032	GGGTG	2	10	2041674	2041683	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
8111	NC_012032	GCACT	2	10	2041693	2041702	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
8112	NC_012032	CAG	2	6	2041713	2041718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8113	NC_012032	TCG	2	6	2041754	2041759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8114	NC_012032	GCC	2	6	2041765	2041770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8115	NC_012032	GGT	2	6	2041807	2041812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8116	NC_012032	AGG	2	6	2041879	2041884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8117	NC_012032	TCG	2	6	2041889	2041894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8118	NC_012032	CCT	2	6	2041895	2041900	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8119	NC_012032	CTGATA	2	12	2041941	2041952	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8120	NC_012032	AGG	2	6	2041960	2041965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8121	NC_012032	GAT	2	6	2042053	2042058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8122	NC_012032	CGA	2	6	2042117	2042122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8123	NC_012032	GCGG	2	8	2042198	2042205	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
8124	NC_012032	CGA	2	6	2042278	2042283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8125	NC_012032	GGT	2	6	2042289	2042294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8126	NC_012032	GTG	2	6	2042349	2042354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8127	NC_012032	G	6	6	2042359	2042364	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8128	NC_012032	GAT	2	6	2042394	2042399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8129	NC_012032	A	6	6	2042443	2042448	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8130	NC_012032	TTGG	2	8	2042460	2042467	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8131	NC_012032	TGG	2	6	2042472	2042477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8132	NC_012032	GCG	2	6	2042558	2042563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8133	NC_012032	CGG	2	6	2042992	2042997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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8135	NC_012032	CGG	2	6	2043070	2043075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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8138	NC_012032	CATT	2	8	2043306	2043313	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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8143	NC_012032	C	9	9	2044990	2044998	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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8252	NC_012032	GGTTG	2	10	2053972	2053981	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
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8256	NC_012032	GTAG	2	8	2054135	2054142	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8257	NC_012032	GCC	2	6	2054172	2054177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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8261	NC_012032	GC	3	6	2054317	2054322	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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8391	NC_012032	CGT	2	6	2086533	2086538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8392	NC_012032	CAT	2	6	2086545	2086550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8393	NC_012032	TAC	2	6	2086625	2086630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8394	NC_012032	ATC	2	6	2086661	2086666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8395	NC_012032	ATG	2	6	2086697	2086702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8396	NC_012032	AAC	2	6	2086760	2086765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8397	NC_012032	CAAT	2	8	2086786	2086793	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8398	NC_012032	AAC	3	9	2086797	2086805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8399	NC_012032	TGA	2	6	2086845	2086850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8400	NC_012032	CA	3	6	2086885	2086890	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8401	NC_012032	CGC	2	6	2088626	2088631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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8403	NC_012032	AGCA	2	8	2088705	2088712	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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8406	NC_012032	AAT	2	6	2093093	2093098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8407	NC_012032	GA	3	6	2093817	2093822	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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8423	NC_012032	CGA	2	6	2101954	2101959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8424	NC_012032	TTC	2	6	2102063	2102068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8425	NC_012032	CGT	2	6	2102075	2102080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8431	NC_012032	CTG	2	6	2102336	2102341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8432	NC_012032	CTT	2	6	2102350	2102355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8433	NC_012032	GAT	2	6	2102615	2102620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8450	NC_012032	CAA	2	6	2103814	2103819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8473	NC_012032	GC	3	6	2107588	2107593	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8474	NC_012032	GC	4	8	2107599	2107606	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8475	NC_012032	CACC	2	8	2107657	2107664	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
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8481	NC_012032	GCA	2	6	2107904	2107909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8482	NC_012032	ATCC	2	8	2107962	2107969	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8483	NC_012032	ATC	2	6	2108039	2108044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8484	NC_012032	GCA	2	6	2108143	2108148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8485	NC_012032	ATG	2	6	2108182	2108187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8486	NC_012032	ATCC	2	8	2108201	2108208	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8487	NC_012032	ATC	2	6	2108278	2108283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8499	NC_012032	ATCC	2	8	2108918	2108925	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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