MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Chloroflexus sp. Y-400-fl chromosome

Total Repeats: 20181

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_012032	AG	3	6	1828845	1828850	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7502	NC_012032	CGA	2	6	1828884	1828889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7503	NC_012032	GAT	2	6	1829636	1829641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7504	NC_012032	AGC	2	6	1829697	1829702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7505	NC_012032	TAT	2	6	1829703	1829708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7506	NC_012032	AGC	2	6	1829709	1829714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7507	NC_012032	GTTC	2	8	1829865	1829872	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7508	NC_012032	ATG	2	6	1829912	1829917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7509	NC_012032	ACG	2	6	1829923	1829928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7510	NC_012032	GAT	2	6	1829939	1829944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7511	NC_012032	GC	3	6	1829969	1829974	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7512	NC_012032	ATG	2	6	1829975	1829980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7513	NC_012032	CGAG	2	8	1829987	1829994	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7514	NC_012032	CT	3	6	1834196	1834201	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7515	NC_012032	AC	3	6	1834278	1834283	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7516	NC_012032	AAT	2	6	1834408	1834413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7517	NC_012032	TTC	2	6	1837856	1837861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7518	NC_012032	CCA	2	6	1837881	1837886	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7519	NC_012032	ATTA	2	8	1837950	1837957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7520	NC_012032	CTT	2	6	1837995	1838000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7521	NC_012032	TAA	2	6	1838024	1838029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7522	NC_012032	TCC	2	6	1838822	1838827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7523	NC_012032	TTGAT	2	10	1838832	1838841	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
7524	NC_012032	CCT	2	6	1840054	1840059	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7525	NC_012032	CGA	2	6	1844899	1844904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7526	NC_012032	CAAT	3	12	1844966	1844977	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7527	NC_012032	CA	3	6	1844996	1845001	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7528	NC_012032	CAG	2	6	1845237	1845242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7529	NC_012032	GCG	2	6	1845260	1845265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7530	NC_012032	CGGCT	2	10	1846989	1846998	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
7531	NC_012032	GA	3	6	1847000	1847005	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7532	NC_012032	ACG	2	6	1856957	1856962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7533	NC_012032	GAT	2	6	1856983	1856988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7534	NC_012032	AGT	2	6	1857279	1857284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7535	NC_012032	GTT	2	6	1857321	1857326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7536	NC_012032	CGG	2	6	1857328	1857333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7537	NC_012032	AGC	2	6	1858320	1858325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7538	NC_012032	A	6	6	1858348	1858353	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7539	NC_012032	CAA	2	6	1858368	1858373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7540	NC_012032	TTCA	2	8	1858413	1858420	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7541	NC_012032	CCA	2	6	1859054	1859059	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7542	NC_012032	ACC	2	6	1859060	1859065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7543	NC_012032	CACG	2	8	1859076	1859083	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7544	NC_012032	CAA	2	6	1859119	1859124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7545	NC_012032	TCC	2	6	1863123	1863128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7546	NC_012032	GAG	2	6	1863180	1863185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7547	NC_012032	CAA	3	9	1863199	1863207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7548	NC_012032	GCCT	2	8	1863253	1863260	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7549	NC_012032	CCCTGC	2	12	1863284	1863295	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
7550	NC_012032	CACTC	2	10	1863319	1863328	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
7551	NC_012032	TGT	2	6	1863360	1863365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7552	NC_012032	CTG	2	6	1863366	1863371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7553	NC_012032	GTG	2	6	1863462	1863467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7554	NC_012032	ACC	2	6	1863498	1863503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7555	NC_012032	GAC	2	6	1863532	1863537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7556	NC_012032	TCG	2	6	1863559	1863564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7557	NC_012032	AC	3	6	1863574	1863579	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7558	NC_012032	ATC	2	6	1863581	1863586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7559	NC_012032	GTA	2	6	1863632	1863637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7560	NC_012032	GAGGT	2	10	1864675	1864684	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
7561	NC_012032	AGG	2	6	1866292	1866297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7562	NC_012032	ACT	2	6	1867286	1867291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7563	NC_012032	CAGG	2	8	1867357	1867364	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7564	NC_012032	ATC	2	6	1870605	1870610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7565	NC_012032	CAC	2	6	1875104	1875109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7566	NC_012032	GCTC	2	8	1875136	1875143	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7567	NC_012032	CCG	2	6	1875176	1875181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7568	NC_012032	CCCT	2	8	1875197	1875204	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
7569	NC_012032	C	6	6	1875252	1875257	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7570	NC_012032	CCG	2	6	1875261	1875266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7571	NC_012032	TGT	2	6	1875335	1875340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7572	NC_012032	TGC	2	6	1875452	1875457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7573	NC_012032	GTG	2	6	1875486	1875491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7574	NC_012032	TCCCA	2	10	1875540	1875549	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
7575	NC_012032	TGC	2	6	1875609	1875614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7576	NC_012032	GTG	2	6	1875643	1875648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7577	NC_012032	CAG	2	6	1875950	1875955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7578	NC_012032	GCC	2	6	1876049	1876054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7579	NC_012032	CCCT	2	8	1876071	1876078	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
7580	NC_012032	CCCCG	2	10	1876129	1876138	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
7581	NC_012032	CCG	2	6	1876152	1876157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7582	NC_012032	GCT	2	6	1876210	1876215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7583	NC_012032	AAC	2	6	1876229	1876234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7584	NC_012032	CCA	2	6	1876292	1876297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7585	NC_012032	ACC	2	6	1876301	1876306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7586	NC_012032	TTCG	2	8	1876364	1876371	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7587	NC_012032	CTC	2	6	1877449	1877454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7588	NC_012032	CTC	2	6	1877478	1877483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7589	NC_012032	CTACT	2	10	1877487	1877496	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
7590	NC_012032	TGCC	2	8	1877524	1877531	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7591	NC_012032	TCC	2	6	1877595	1877600	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7592	NC_012032	CAC	2	6	1877695	1877700	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7593	NC_012032	GGA	2	6	1877709	1877714	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7594	NC_012032	GAT	2	6	1877722	1877727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7595	NC_012032	GCT	2	6	1877783	1877788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7596	NC_012032	AAC	2	6	1877879	1877884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7597	NC_012032	AC	3	6	1877897	1877902	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7598	NC_012032	TG	3	6	1877967	1877972	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7599	NC_012032	ATC	2	6	1878759	1878764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7600	NC_012032	AGG	2	6	1878807	1878812	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7601	NC_012032	AAGGA	2	10	1878837	1878846	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
7602	NC_012032	GAG	2	6	1880488	1880493	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7603	NC_012032	GCT	2	6	1880498	1880503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7604	NC_012032	ATG	2	6	1880550	1880555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7605	NC_012032	CCA	2	6	1880619	1880624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7606	NC_012032	GTA	2	6	1880663	1880668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7607	NC_012032	ACC	2	6	1884675	1884680	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7608	NC_012032	ACG	2	6	1886346	1886351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7609	NC_012032	AAC	2	6	1886372	1886377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7610	NC_012032	TGT	3	9	1886379	1886387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7611	NC_012032	TC	3	6	1886406	1886411	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7612	NC_012032	TCA	2	6	1886430	1886435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7613	NC_012032	TAA	2	6	1887086	1887091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7614	NC_012032	GCA	2	6	1887168	1887173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7615	NC_012032	CAT	2	6	1887175	1887180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7616	NC_012032	GGA	2	6	1887181	1887186	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7617	NC_012032	CAAA	2	8	1887210	1887217	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7618	NC_012032	GACC	2	8	1887225	1887232	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7619	NC_012032	TGT	2	6	1887280	1887285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7620	NC_012032	GAA	2	6	1887291	1887296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7621	NC_012032	AC	3	6	1887317	1887322	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7622	NC_012032	TAAA	2	8	1887351	1887358	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7623	NC_012032	TAAT	2	8	1887388	1887395	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7624	NC_012032	AAC	2	6	1887414	1887419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7625	NC_012032	ACTT	2	8	1887432	1887439	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7626	NC_012032	CTCC	2	8	1891687	1891694	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
7627	NC_012032	TCA	2	6	1891698	1891703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7628	NC_012032	AGA	2	6	1891735	1891740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7630	NC_012032	TTAC	2	8	1891798	1891805	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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