MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Chloroflexus sp. Y-400-fl chromosome

Total Repeats: 20181

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_012032	TCA	2	6	1669385	1669390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7002	NC_012032	CAG	2	6	1669391	1669396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7003	NC_012032	TCC	2	6	1669987	1669992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7004	NC_012032	GTT	2	6	1670723	1670728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7005	NC_012032	ATGA	2	8	1670769	1670776	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7006	NC_012032	TGAC	2	8	1670797	1670804	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7007	NC_012032	TGG	2	6	1670871	1670876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7008	NC_012032	GCG	2	6	1670884	1670889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7009	NC_012032	ATG	2	6	1670931	1670936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7010	NC_012032	GTG	3	9	1670952	1670960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7011	NC_012032	AT	3	6	1671028	1671033	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7012	NC_012032	GGT	2	6	1671076	1671081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7013	NC_012032	ATC	2	6	1671112	1671117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7014	NC_012032	CAGG	2	8	1671129	1671136	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7015	NC_012032	CAT	2	6	1671163	1671168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7016	NC_012032	ACT	2	6	1671179	1671184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7017	NC_012032	CA	3	6	1671219	1671224	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7018	NC_012032	TGA	2	6	1671276	1671281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7019	NC_012032	AAC	2	6	1671363	1671368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7020	NC_012032	CAC	2	6	1671402	1671407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7021	NC_012032	CAC	2	6	1671492	1671497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7022	NC_012032	GCG	2	6	1671577	1671582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7023	NC_012032	ACG	2	6	1673560	1673565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7024	NC_012032	ATCC	2	8	1673620	1673627	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7025	NC_012032	CCCG	2	8	1673646	1673653	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7026	NC_012032	ACG	2	6	1673778	1673783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7027	NC_012032	TGA	2	6	1673824	1673829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7028	NC_012032	CAC	2	6	1673881	1673886	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7029	NC_012032	CTT	2	6	1676147	1676152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7030	NC_012032	TCC	2	6	1676745	1676750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7031	NC_012032	TCCG	2	8	1676783	1676790	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7032	NC_012032	GCT	2	6	1676805	1676810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7033	NC_012032	CCCT	2	8	1676980	1676987	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
7034	NC_012032	CTCGTC	2	12	1677006	1677017	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
7035	NC_012032	TCC	2	6	1679611	1679616	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7036	NC_012032	TTC	2	6	1681536	1681541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7037	NC_012032	C	6	6	1681575	1681580	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7038	NC_012032	ATGC	2	8	1681616	1681623	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7039	NC_012032	TCG	2	6	1681696	1681701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7040	NC_012032	CA	3	6	1683055	1683060	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7041	NC_012032	ATT	2	6	1683065	1683070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7042	NC_012032	TCA	2	6	1683078	1683083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7043	NC_012032	TA	3	6	1683548	1683553	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7044	NC_012032	ATTCA	2	10	1683587	1683596	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
7045	NC_012032	GTC	2	6	1684710	1684715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7046	NC_012032	ATAA	2	8	1684773	1684780	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7047	NC_012032	T	6	6	1684782	1684787	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7048	NC_012032	CAAT	2	8	1684802	1684809	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7049	NC_012032	AATAA	2	10	1684824	1684833	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
7050	NC_012032	CTG	2	6	1684866	1684871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7051	NC_012032	AG	3	6	1684896	1684901	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7052	NC_012032	TC	3	6	1691347	1691352	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7053	NC_012032	CAT	2	6	1691414	1691419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7054	NC_012032	ATCA	2	8	1691483	1691490	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7055	NC_012032	ATC	2	6	1691523	1691528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7056	NC_012032	AG	3	6	1691546	1691551	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7057	NC_012032	CCA	2	6	1691557	1691562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7058	NC_012032	C	6	6	1691583	1691588	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7059	NC_012032	ACC	2	6	1691589	1691594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7060	NC_012032	CTC	2	6	1691630	1691635	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7061	NC_012032	ATTC	2	8	1691649	1691656	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7062	NC_012032	ATT	2	6	1691672	1691677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7063	NC_012032	TGT	2	6	1691717	1691722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7064	NC_012032	TCT	2	6	1691785	1691790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7065	NC_012032	TAT	2	6	1691816	1691821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7066	NC_012032	CGCA	2	8	1691866	1691873	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7067	NC_012032	GCA	2	6	1691957	1691962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7068	NC_012032	GAT	2	6	1692013	1692018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7069	NC_012032	AAC	2	6	1692129	1692134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7070	NC_012032	CAT	2	6	1692147	1692152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7071	NC_012032	GCTC	2	8	1692172	1692179	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7072	NC_012032	TGC	2	6	1692218	1692223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7073	NC_012032	CATG	2	8	1692307	1692314	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7074	NC_012032	AATG	2	8	1692327	1692334	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7075	NC_012032	TAG	2	6	1692346	1692351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7076	NC_012032	T	6	6	1692355	1692360	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7077	NC_012032	ATG	2	6	1692375	1692380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7078	NC_012032	ACC	2	6	1692458	1692463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7079	NC_012032	GCA	2	6	1692539	1692544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7080	NC_012032	CCTC	2	8	1695753	1695760	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
7081	NC_012032	GCT	2	6	1695785	1695790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7082	NC_012032	TGA	2	6	1695849	1695854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7083	NC_012032	ATC	2	6	1695880	1695885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7084	NC_012032	TGAA	2	8	1695890	1695897	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7085	NC_012032	TTG	2	6	1696004	1696009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7086	NC_012032	GTTG	2	8	1696014	1696021	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7087	NC_012032	TCAT	2	8	1696045	1696052	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7088	NC_012032	CATGCC	2	12	1696075	1696086	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
7089	NC_012032	GCC	2	6	1696100	1696105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7090	NC_012032	GA	4	8	1696111	1696118	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7091	NC_012032	GGCG	2	8	1696123	1696130	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
7092	NC_012032	ACA	2	6	1696201	1696206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7093	NC_012032	AGCTG	2	10	1696229	1696238	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
7094	NC_012032	CAA	4	12	1696283	1696294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7095	NC_012032	ATTG	2	8	1696353	1696360	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7096	NC_012032	AGC	2	6	1696421	1696426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7098	NC_012032	TGT	2	6	1696574	1696579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7099	NC_012032	CAA	4	12	1696620	1696631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7100	NC_012032	CTC	2	6	1697541	1697546	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7101	NC_012032	AT	3	6	1697652	1697657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7102	NC_012032	TAT	2	6	1697674	1697679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7103	NC_012032	CA	3	6	1697695	1697700	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7104	NC_012032	GTC	2	6	1702908	1702913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7107	NC_012032	GAT	2	6	1706396	1706401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7108	NC_012032	TGA	2	6	1706454	1706459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7109	NC_012032	AAAGAT	2	12	1708665	1708676	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7110	NC_012032	AGG	2	6	1708806	1708811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7111	NC_012032	TC	3	6	1709029	1709034	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7112	NC_012032	CTGCT	2	10	1709132	1709141	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
7113	NC_012032	AC	3	6	1709146	1709151	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7114	NC_012032	TCAT	2	8	1709209	1709216	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7115	NC_012032	CAC	2	6	1709217	1709222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7116	NC_012032	CAT	2	6	1709305	1709310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7117	NC_012032	TCACT	2	10	1709357	1709366	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
7118	NC_012032	CAG	2	6	1710069	1710074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7119	NC_012032	AG	3	6	1710103	1710108	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7120	NC_012032	GGTGG	2	10	1710130	1710139	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
7121	NC_012032	TCA	2	6	1710159	1710164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7122	NC_012032	CGTCT	2	10	1710219	1710228	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
7123	NC_012032	GAG	2	6	1710232	1710237	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7124	NC_012032	GGCC	2	8	1710267	1710274	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7125	NC_012032	ACCT	2	8	1710279	1710286	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7126	NC_012032	CCT	2	6	1710383	1710388	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7127	NC_012032	CAT	2	6	1711776	1711781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7128	NC_012032	GA	4	8	1711817	1711824	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7129	NC_012032	CGC	2	6	1711886	1711891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7130	NC_012032	TGA	2	6	1712018	1712023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7131	NC_012032	GGT	2	6	1712054	1712059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7132	NC_012032	ACC	2	6	1712060	1712065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7133	NC_012032	CAG	2	6	1712096	1712101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7134	NC_012032	GGCA	2	8	1712125	1712132	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7135	NC_012032	CTC	2	6	1715157	1715162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7136	NC_012032	A	6	6	1716743	1716748	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7137	NC_012032	ACA	2	6	1716785	1716790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7138	NC_012032	GTT	2	6	1716823	1716828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7139	NC_012032	GGT	2	6	1716838	1716843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7140	NC_012032	TC	3	6	1717423	1717428	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7141	NC_012032	CAGG	2	8	1717438	1717445	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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7145	NC_012032	CTGTC	2	10	1717616	1717625	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
7146	NC_012032	ATA	2	6	1717916	1717921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7147	NC_012032	AT	3	6	1717981	1717986	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7148	NC_012032	AT	3	6	1717991	1717996	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7149	NC_012032	CCT	2	6	1720751	1720756	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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7151	NC_012032	TGG	2	6	1721302	1721307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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7153	NC_012032	TTG	2	6	1721542	1721547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7156	NC_012032	CT	3	6	1725116	1725121	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7157	NC_012032	CTG	2	6	1725152	1725157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7167	NC_012032	TGG	2	6	1730442	1730447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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7172	NC_012032	CACAA	2	10	1730783	1730792	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
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7174	NC_012032	CTAT	2	8	1732115	1732122	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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7178	NC_012032	TA	3	6	1732299	1732304	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7180	NC_012032	CATT	2	8	1732317	1732324	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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7244	NC_012032	CAA	2	6	1754538	1754543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7246	NC_012032	CA	3	6	1756043	1756048	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7247	NC_012032	CAT	2	6	1756105	1756110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7249	NC_012032	GC	3	6	1756229	1756234	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7250	NC_012032	T	6	6	1756305	1756310	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7251	NC_012032	ACT	2	6	1756383	1756388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7252	NC_012032	GAA	2	6	1756397	1756402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7253	NC_012032	TCG	2	6	1756480	1756485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7254	NC_012032	CATC	2	8	1756561	1756568	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7255	NC_012032	CCA	2	6	1756658	1756663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7256	NC_012032	TTC	2	6	1756715	1756720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7257	NC_012032	TTC	2	6	1756736	1756741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7258	NC_012032	CTG	2	6	1756745	1756750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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