MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Chloroflexus sp. Y-400-fl chromosome

Total Repeats: 20181

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_012032	ACA	2	6	1490954	1490959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6502	NC_012032	AAT	2	6	1494284	1494289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6503	NC_012032	ACC	2	6	1494316	1494321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6504	NC_012032	AAC	2	6	1498288	1498293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6505	NC_012032	TCC	2	6	1499862	1499867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6506	NC_012032	ACT	2	6	1499874	1499879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6507	NC_012032	CCA	2	6	1500970	1500975	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6508	NC_012032	A	6	6	1501011	1501016	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6509	NC_012032	CAT	2	6	1501324	1501329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6510	NC_012032	TGC	2	6	1501363	1501368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6511	NC_012032	GCAT	2	8	1501467	1501474	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6512	NC_012032	CGGC	2	8	1501534	1501541	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6513	NC_012032	CGG	2	6	1501548	1501553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6514	NC_012032	CGGGG	2	10	1501666	1501675	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
6515	NC_012032	CGG	2	6	1501724	1501729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6516	NC_012032	CGG	2	6	1501816	1501821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6517	NC_012032	CGG	2	6	1501846	1501851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6518	NC_012032	CCA	2	6	1501936	1501941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6519	NC_012032	CGT	2	6	1501951	1501956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6520	NC_012032	CAC	2	6	1501984	1501989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6521	NC_012032	ATGA	2	8	1504094	1504101	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6522	NC_012032	GT	3	6	1504105	1504110	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6523	NC_012032	ACA	2	6	1504120	1504125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6524	NC_012032	TCC	2	6	1505356	1505361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6525	NC_012032	AC	3	6	1505367	1505372	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6526	NC_012032	CTGT	2	8	1506441	1506448	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6527	NC_012032	CCG	2	6	1509345	1509350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6528	NC_012032	AAC	2	6	1510199	1510204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6529	NC_012032	CAA	2	6	1510232	1510237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6530	NC_012032	TGA	2	6	1510253	1510258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6531	NC_012032	ATTA	2	8	1510262	1510269	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6532	NC_012032	ATT	2	6	1510299	1510304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6533	NC_012032	TCC	2	6	1511723	1511728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6534	NC_012032	ACA	2	6	1511757	1511762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6535	NC_012032	GTCAA	2	10	1511766	1511775	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6536	NC_012032	TGATA	2	10	1511776	1511785	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6537	NC_012032	GCA	2	6	1513079	1513084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6538	NC_012032	GCTGGT	2	12	1513108	1513119	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
6539	NC_012032	GCA	2	6	1513121	1513126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6540	NC_012032	CCCCA	2	10	1513159	1513168	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
6541	NC_012032	GCAG	2	8	1513201	1513208	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6542	NC_012032	GGT	2	6	1513209	1513214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6543	NC_012032	GAT	2	6	1513257	1513262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6544	NC_012032	CA	3	6	1513338	1513343	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6545	NC_012032	CT	3	6	1513424	1513429	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6546	NC_012032	CTT	2	6	1513470	1513475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6547	NC_012032	GT	3	6	1521606	1521611	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6548	NC_012032	AACG	2	8	1521643	1521650	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6549	NC_012032	TAT	2	6	1521716	1521721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6550	NC_012032	TGTT	2	8	1521753	1521760	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6551	NC_012032	TTGT	2	8	1521764	1521771	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6552	NC_012032	AT	3	6	1521799	1521804	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6553	NC_012032	TAC	2	6	1521876	1521881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6554	NC_012032	CGG	2	6	1522676	1522681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6555	NC_012032	AAT	2	6	1526013	1526018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6556	NC_012032	TG	3	6	1526023	1526028	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6557	NC_012032	ATG	2	6	1526040	1526045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6558	NC_012032	TG	3	6	1526082	1526087	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6559	NC_012032	ATT	2	6	1526123	1526128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6560	NC_012032	AAT	2	6	1526142	1526147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6561	NC_012032	CT	3	6	1526202	1526207	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6562	NC_012032	ACG	2	6	1526227	1526232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6563	NC_012032	ACCC	2	8	1526690	1526697	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
6564	NC_012032	CGG	2	6	1526707	1526712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6565	NC_012032	GCT	2	6	1526851	1526856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6566	NC_012032	GCC	2	6	1526949	1526954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6567	NC_012032	GCT	2	6	1526958	1526963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6568	NC_012032	CGG	2	6	1526975	1526980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6569	NC_012032	GT	4	8	1527092	1527099	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6570	NC_012032	TACC	2	8	1527106	1527113	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6571	NC_012032	CGTG	2	8	1527130	1527137	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6572	NC_012032	AGG	2	6	1527161	1527166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6573	NC_012032	GT	3	6	1528300	1528305	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6574	NC_012032	GTT	2	6	1528324	1528329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6575	NC_012032	ACA	2	6	1530158	1530163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6576	NC_012032	GGT	2	6	1532347	1532352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6577	NC_012032	AGC	2	6	1536844	1536849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6578	NC_012032	AG	3	6	1536881	1536886	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6579	NC_012032	CTG	2	6	1536914	1536919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6580	NC_012032	CTC	2	6	1537456	1537461	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6581	NC_012032	T	6	6	1537487	1537492	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6582	NC_012032	TGG	2	6	1537581	1537586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6583	NC_012032	GTG	2	6	1537613	1537618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6584	NC_012032	GTT	2	6	1537622	1537627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6585	NC_012032	GGA	2	6	1537642	1537647	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6586	NC_012032	CTG	2	6	1539398	1539403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6587	NC_012032	GTA	2	6	1539446	1539451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6588	NC_012032	CAGT	2	8	1539488	1539495	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6589	NC_012032	TGCC	2	8	1539632	1539639	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6590	NC_012032	CTC	2	6	1539652	1539657	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6591	NC_012032	GGAA	2	8	1539753	1539760	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6592	NC_012032	TCC	2	6	1539769	1539774	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6593	NC_012032	CGA	2	6	1539815	1539820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6594	NC_012032	CATA	2	8	1539829	1539836	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6595	NC_012032	CTA	2	6	1539915	1539920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6596	NC_012032	TAA	2	6	1543889	1543894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6597	NC_012032	AATAGC	2	12	1547197	1547208	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6598	NC_012032	ATC	2	6	1547233	1547238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6599	NC_012032	ATG	2	6	1552543	1552548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6600	NC_012032	CCTG	2	8	1552563	1552570	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6601	NC_012032	ATG	2	6	1552596	1552601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6602	NC_012032	GCA	2	6	1552635	1552640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6603	NC_012032	TGC	2	6	1552653	1552658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6604	NC_012032	AACA	2	8	1553555	1553562	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6605	NC_012032	TGTA	2	8	1557499	1557506	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6606	NC_012032	ACT	2	6	1557507	1557512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6607	NC_012032	GC	3	6	1557520	1557525	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6608	NC_012032	GAC	2	6	1557550	1557555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6609	NC_012032	TGC	2	6	1559661	1559666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6610	NC_012032	GAT	2	6	1559667	1559672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6611	NC_012032	GAT	2	6	1559752	1559757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6612	NC_012032	GCA	2	6	1559827	1559832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6613	NC_012032	GCT	2	6	1559888	1559893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6614	NC_012032	TAG	2	6	1559898	1559903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6615	NC_012032	GAG	2	6	1559907	1559912	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6616	NC_012032	GCG	2	6	1559982	1559987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6617	NC_012032	AG	3	6	1560026	1560031	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6618	NC_012032	TGA	2	6	1560120	1560125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6619	NC_012032	A	7	7	1560129	1560135	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6620	NC_012032	GCG	2	6	1560160	1560165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6621	NC_012032	AGC	2	6	1561386	1561391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6622	NC_012032	CTA	2	6	1561437	1561442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6623	NC_012032	AGA	2	6	1563118	1563123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6624	NC_012032	GTT	2	6	1563251	1563256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6625	NC_012032	AC	3	6	1563632	1563637	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6626	NC_012032	CTGT	2	8	1563688	1563695	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6627	NC_012032	GGTC	2	8	1565377	1565384	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6628	NC_012032	TGA	2	6	1565467	1565472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6629	NC_012032	CAAA	2	8	1565537	1565544	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6630	NC_012032	TCAC	2	8	1566258	1566265	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6631	NC_012032	CTCG	2	8	1566407	1566414	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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