MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7425 plasmid pP742502

Total Repeats: 793

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011885	TAA	2	6	106593	106598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_011885	CGGT	2	8	106826	106833	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
503	NC_011885	GA	3	6	107110	107115	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
504	NC_011885	TCC	2	6	107120	107125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
505	NC_011885	TTAA	2	8	107154	107161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_011885	TGT	2	6	107185	107190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
507	NC_011885	GCA	2	6	107372	107377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_011885	CCG	2	6	107393	107398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
509	NC_011885	CTTA	2	8	107628	107635	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
510	NC_011885	GGT	2	6	107651	107656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
511	NC_011885	TAG	2	6	108061	108066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
512	NC_011885	C	7	7	108100	108106	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
513	NC_011885	CTG	2	6	108146	108151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_011885	AC	3	6	108185	108190	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
515	NC_011885	TCA	2	6	108215	108220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_011885	T	6	6	108287	108292	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_011885	CCAT	2	8	108334	108341	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
518	NC_011885	TAG	2	6	108399	108404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
519	NC_011885	GAG	2	6	108521	108526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
520	NC_011885	TGGA	2	8	108534	108541	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
521	NC_011885	A	8	8	108602	108609	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_011885	TGG	2	6	108722	108727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
523	NC_011885	TGAGG	2	10	108741	108750	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
524	NC_011885	ACA	2	6	108780	108785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_011885	AAC	2	6	108842	108847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_011885	GCC	2	6	108872	108877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
527	NC_011885	TGA	2	6	108963	108968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
528	NC_011885	GA	3	6	109029	109034	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
529	NC_011885	CAA	2	6	109070	109075	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_011885	TAT	2	6	109079	109084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_011885	AAT	2	6	109107	109112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_011885	ATT	2	6	109118	109123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_011885	GAGT	2	8	112258	112265	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
534	NC_011885	A	6	6	112301	112306	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_011885	TCC	2	6	112315	112320	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
536	NC_011885	ACTGG	2	10	112321	112330	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
537	NC_011885	CTG	2	6	112337	112342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_011885	CCCA	2	8	112405	112412	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
539	NC_011885	GAG	2	6	112467	112472	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
540	NC_011885	T	6	6	112545	112550	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_011885	AG	3	6	114199	114204	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
542	NC_011885	CTG	2	6	114252	114257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_011885	TTC	3	9	115454	115462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_011885	GA	3	6	115502	115507	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
545	NC_011885	GAAT	2	8	115569	115576	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
546	NC_011885	GCT	2	6	116470	116475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_011885	GGC	2	6	116491	116496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_011885	GAG	2	6	116562	116567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
549	NC_011885	GCT	2	6	116586	116591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_011885	TGA	2	6	116656	116661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
551	NC_011885	CCAG	2	8	116667	116674	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
552	NC_011885	ACA	2	6	118931	118936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_011885	CCG	2	6	119020	119025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
554	NC_011885	ATT	2	6	119548	119553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_011885	GAA	2	6	119575	119580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
556	NC_011885	AGA	2	6	119590	119595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
557	NC_011885	CCA	2	6	120572	120577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
558	NC_011885	ATG	2	6	120587	120592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
559	NC_011885	TTGAC	2	10	120621	120630	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
560	NC_011885	G	6	6	120726	120731	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
561	NC_011885	GTT	2	6	120752	120757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
562	NC_011885	TGT	2	6	120790	120795	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
563	NC_011885	TTACTT	2	12	121308	121319	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
564	NC_011885	AGA	2	6	122203	122208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
565	NC_011885	AGA	2	6	122266	122271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
566	NC_011885	TCCA	2	8	122276	122283	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
567	NC_011885	AT	3	6	122308	122313	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_011885	ATTT	2	8	122330	122337	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_011885	GTT	2	6	123180	123185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
570	NC_011885	CCT	2	6	123204	123209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
571	NC_011885	AAGATA	2	12	123210	123221	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
572	NC_011885	GCT	2	6	123227	123232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_011885	CT	3	6	123231	123236	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
574	NC_011885	GCT	2	6	123238	123243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_011885	GA	3	6	128277	128282	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
576	NC_011885	TTGA	2	8	128291	128298	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
577	NC_011885	ACC	2	6	128311	128316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
578	NC_011885	ACT	2	6	128323	128328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_011885	T	6	6	128341	128346	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_011885	TGCT	2	8	128375	128382	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
581	NC_011885	TAGA	2	8	128409	128416	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
582	NC_011885	A	7	7	128441	128447	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_011885	CAA	2	6	128465	128470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_011885	TTAC	2	8	128540	128547	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
585	NC_011885	GTC	3	9	128641	128649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_011885	ACA	2	6	128726	128731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_011885	TGA	2	6	128800	128805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
588	NC_011885	TGG	2	6	128878	128883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
589	NC_011885	CAA	2	6	128886	128891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_011885	GA	3	6	128987	128992	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
591	NC_011885	GGC	2	6	129155	129160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_011885	GCA	2	6	129192	129197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_011885	GAC	2	6	129224	129229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_011885	CAA	2	6	129337	129342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_011885	GAA	3	9	129370	129378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
596	NC_011885	CAG	2	6	130689	130694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_011885	GTTTT	2	10	130747	130756	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
598	NC_011885	GTT	2	6	130973	130978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
599	NC_011885	CTT	2	6	131021	131026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_011885	ATC	2	6	131115	131120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_011885	ATC	2	6	131123	131128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_011885	GAA	2	6	131871	131876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
603	NC_011885	GAG	2	6	131914	131919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
604	NC_011885	CTCAT	2	10	132118	132127	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
605	NC_011885	CTA	2	6	132132	132137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_011885	TA	3	6	132161	132166	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_011885	TCA	2	6	132205	132210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_011885	AT	4	8	132225	132232	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_011885	TTC	2	6	132233	132238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_011885	TA	3	6	132245	132250	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_011885	CTAATC	2	12	132431	132442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_011885	A	6	6	132450	132455	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_011885	TAG	2	6	132461	132466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
614	NC_011885	ACAA	2	8	132473	132480	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
615	NC_011885	ACTC	2	8	132527	132534	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
616	NC_011885	TCGA	2	8	132855	132862	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
617	NC_011885	ATG	2	6	132867	132872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
618	NC_011885	TAA	2	6	132925	132930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_011885	TGA	2	6	132936	132941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
620	NC_011885	TCAAC	2	10	132948	132957	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
621	NC_011885	ATT	2	6	132999	133004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_011885	A	6	6	133034	133039	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_011885	TGA	2	6	133059	133064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
624	NC_011885	GATC	2	8	133268	133275	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
625	NC_011885	GCT	2	6	133290	133295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_011885	GCCT	2	8	133310	133317	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
627	NC_011885	T	7	7	133498	133504	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_011885	GA	3	6	133505	133510	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
629	NC_011885	TGC	2	6	133820	133825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_011885	CGAT	2	8	133841	133848	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
631	NC_011885	A	6	6	133992	133997	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_011885	CGAAA	2	10	134006	134015	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
633	NC_011885	AATT	2	8	134124	134131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_011885	GA	3	6	134159	134164	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
635	NC_011885	G	6	6	134275	134280	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
636	NC_011885	CTTATA	2	12	134399	134410	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
637	NC_011885	AAT	2	6	134417	134422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_011885	CTGG	2	8	134846	134853	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
639	NC_011885	GCT	2	6	134873	134878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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777	NC_011885	AAT	2	6	174383	174388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
778	NC_011885	GCT	2	6	174585	174590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
779	NC_011885	T	6	6	174725	174730	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
780	NC_011885	TAG	3	9	174759	174767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
781	NC_011885	GCA	2	6	174802	174807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
782	NC_011885	CTC	2	6	175911	175916	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
783	NC_011885	T	6	6	175934	175939	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
784	NC_011885	CAA	2	6	176029	176034	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
785	NC_011885	CAT	2	6	176692	176697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
786	NC_011885	AGCAG	2	10	176897	176906	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
787	NC_011885	TTTG	2	8	177898	177905	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
788	NC_011885	CAT	2	6	177948	177953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
789	NC_011885	TGC	2	6	177974	177979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
790	NC_011885	GAG	2	6	177981	177986	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
791	NC_011885	TGC	2	6	178006	178011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
792	NC_011885	TCA	2	6	178929	178934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
793	NC_011885	TTA	2	6	178986	178991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

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