MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7425 chromosome

Total Repeats: 13023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_011884	TCCC	2	8	4622162	4622169	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
11002	NC_011884	AAC	2	6	4622178	4622183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11003	NC_011884	AGT	2	6	4622209	4622214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11004	NC_011884	GCA	3	9	4622236	4622244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11005	NC_011884	CAG	2	6	4622384	4622389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11006	NC_011884	ACCG	2	8	4622482	4622489	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11007	NC_011884	GAA	2	6	4622535	4622540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11008	NC_011884	AGT	2	6	4622574	4622579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11009	NC_011884	GCC	2	6	4622587	4622592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11010	NC_011884	CGG	2	6	4622647	4622652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11011	NC_011884	AGGAT	2	10	4623624	4623633	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
11012	NC_011884	CGCC	2	8	4623648	4623655	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11013	NC_011884	C	6	6	4623664	4623669	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11014	NC_011884	CAA	2	6	4623674	4623679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11015	NC_011884	GAG	2	6	4623731	4623736	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11016	NC_011884	CT	3	6	4624542	4624547	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11017	NC_011884	GAT	2	6	4624548	4624553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11018	NC_011884	CTC	2	6	4624574	4624579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11019	NC_011884	TCG	2	6	4624593	4624598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11020	NC_011884	TGT	2	6	4624599	4624604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11021	NC_011884	TAAT	2	8	4624686	4624693	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11022	NC_011884	AGC	2	6	4624700	4624705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11023	NC_011884	AGGG	2	8	4624706	4624713	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
11024	NC_011884	TGAT	2	8	4629510	4629517	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11025	NC_011884	A	6	6	4629550	4629555	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11026	NC_011884	TTA	2	6	4630421	4630426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11027	NC_011884	GA	3	6	4630937	4630942	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11028	NC_011884	CATT	2	8	4630964	4630971	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11029	NC_011884	ACT	2	6	4631230	4631235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11030	NC_011884	AGTA	2	8	4631319	4631326	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11031	NC_011884	TAGA	2	8	4631340	4631347	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11032	NC_011884	TGAT	2	8	4631370	4631377	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11033	NC_011884	TTGG	2	8	4631387	4631394	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11034	NC_011884	CTG	2	6	4632213	4632218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11035	NC_011884	GCT	2	6	4634432	4634437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11036	NC_011884	GTGC	2	8	4636702	4636709	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11037	NC_011884	TAA	2	6	4636718	4636723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11038	NC_011884	A	6	6	4636732	4636737	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11039	NC_011884	TTG	2	6	4636773	4636778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11040	NC_011884	GAA	2	6	4636818	4636823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11041	NC_011884	TGA	2	6	4638102	4638107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11042	NC_011884	CAGC	2	8	4638123	4638130	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11043	NC_011884	TCC	2	6	4638160	4638165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11044	NC_011884	GGC	2	6	4638399	4638404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11045	NC_011884	AGG	2	6	4639694	4639699	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11046	NC_011884	GTG	2	6	4640204	4640209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11047	NC_011884	CAA	2	6	4640257	4640262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11048	NC_011884	TGCC	2	8	4640266	4640273	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11049	NC_011884	TTA	2	6	4643622	4643627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11050	NC_011884	GTCT	2	8	4643864	4643871	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11051	NC_011884	G	6	6	4644189	4644194	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11052	NC_011884	GGGA	2	8	4644198	4644205	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
11053	NC_011884	GTG	2	6	4647085	4647090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11054	NC_011884	GA	3	6	4648053	4648058	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11055	NC_011884	AG	3	6	4648182	4648187	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11056	NC_011884	TCA	2	6	4652083	4652088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11057	NC_011884	AGC	2	6	4654576	4654581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11058	NC_011884	TGG	2	6	4655368	4655373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11059	NC_011884	ACCC	2	8	4657767	4657774	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
11060	NC_011884	TAC	2	6	4657797	4657802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11061	NC_011884	TGA	2	6	4657822	4657827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11062	NC_011884	A	6	6	4659145	4659150	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11063	NC_011884	AAT	2	6	4660876	4660881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11064	NC_011884	GACAA	2	10	4660909	4660918	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
11065	NC_011884	TTA	2	6	4660942	4660947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11066	NC_011884	ATC	2	6	4660955	4660960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11067	NC_011884	GAAT	2	8	4664771	4664778	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11068	NC_011884	AT	3	6	4666640	4666645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11069	NC_011884	CAG	2	6	4666692	4666697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11070	NC_011884	CCAT	2	8	4667018	4667025	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11071	NC_011884	GAAT	2	8	4669697	4669704	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11072	NC_011884	TTG	2	6	4669754	4669759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11073	NC_011884	CTT	2	6	4669774	4669779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11074	NC_011884	CTAG	2	8	4669820	4669827	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11075	NC_011884	ATT	2	6	4669829	4669834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11076	NC_011884	CCT	2	6	4669870	4669875	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11077	NC_011884	GA	3	6	4670432	4670437	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11078	NC_011884	TGC	2	6	4671325	4671330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11079	NC_011884	GT	3	6	4671346	4671351	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11080	NC_011884	CTTA	2	8	4671370	4671377	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11081	NC_011884	AGG	2	6	4671387	4671392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11082	NC_011884	TCC	2	6	4671478	4671483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11083	NC_011884	TTA	2	6	4671496	4671501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11084	NC_011884	GCTA	2	8	4671557	4671564	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11085	NC_011884	C	6	6	4671677	4671682	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11086	NC_011884	CT	3	6	4671741	4671746	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11087	NC_011884	CCT	2	6	4673681	4673686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11088	NC_011884	T	7	7	4673749	4673755	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11089	NC_011884	TTAA	2	8	4673778	4673785	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11090	NC_011884	AGCA	2	8	4673827	4673834	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11091	NC_011884	GCTGA	2	10	4673928	4673937	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
11092	NC_011884	TGGCC	2	10	4673972	4673981	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
11093	NC_011884	TC	3	6	4674000	4674005	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11094	NC_011884	GCA	2	6	4674026	4674031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11095	NC_011884	GCTT	2	8	4675801	4675808	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11096	NC_011884	TAC	2	6	4675845	4675850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11097	NC_011884	GTTCT	2	10	4678582	4678591	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
11098	NC_011884	TTTAA	2	10	4679861	4679870	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11099	NC_011884	GATT	2	8	4679872	4679879	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11100	NC_011884	TTG	2	6	4680837	4680842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11101	NC_011884	AG	3	6	4681548	4681553	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11102	NC_011884	GAA	2	6	4683171	4683176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11103	NC_011884	GCC	2	6	4683515	4683520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11104	NC_011884	CTC	2	6	4683521	4683526	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11105	NC_011884	TCCG	2	8	4683533	4683540	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11106	NC_011884	GCA	2	6	4683551	4683556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11108	NC_011884	TGC	2	6	4683680	4683685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11109	NC_011884	A	7	7	4683693	4683699	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11110	NC_011884	AGG	2	6	4684394	4684399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11111	NC_011884	AGA	2	6	4684528	4684533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11112	NC_011884	GTTT	2	8	4685536	4685543	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11113	NC_011884	TGG	2	6	4696724	4696729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11114	NC_011884	A	6	6	4697458	4697463	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11115	NC_011884	CTTA	2	8	4697499	4697506	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11116	NC_011884	CAG	2	6	4697698	4697703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11117	NC_011884	CGA	2	6	4698442	4698447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11119	NC_011884	AGGG	2	8	4698562	4698569	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
11120	NC_011884	GGT	2	6	4698660	4698665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11121	NC_011884	AAG	2	6	4698689	4698694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11122	NC_011884	TGC	2	6	4698754	4698759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11123	NC_011884	CT	3	6	4700536	4700541	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11124	NC_011884	TA	3	6	4700547	4700552	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11125	NC_011884	GTT	2	6	4700620	4700625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11126	NC_011884	GAGG	2	8	4702871	4702878	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
11127	NC_011884	CTG	2	6	4704324	4704329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11128	NC_011884	GAG	2	6	4704332	4704337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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11130	NC_011884	CAA	2	6	4704388	4704393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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