MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7425 chromosome

Total Repeats: 13023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_011884	TCAA	2	8	4413247	4413254	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10502	NC_011884	ACT	2	6	4413272	4413277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10503	NC_011884	GGT	2	6	4414443	4414448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10504	NC_011884	CAG	2	6	4414571	4414576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10505	NC_011884	TTAA	2	8	4414654	4414661	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10506	NC_011884	G	6	6	4414695	4414700	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10507	NC_011884	TCGA	2	8	4414748	4414755	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10508	NC_011884	CAA	3	9	4414759	4414767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10509	NC_011884	T	6	6	4414781	4414786	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10510	NC_011884	GT	3	6	4414795	4414800	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10511	NC_011884	A	6	6	4414827	4414832	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10512	NC_011884	T	6	6	4414898	4414903	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10513	NC_011884	CTT	2	6	4414906	4414911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10514	NC_011884	AGG	2	6	4414919	4414924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10515	NC_011884	T	6	6	4414928	4414933	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10516	NC_011884	AAAT	2	8	4415779	4415786	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10517	NC_011884	CTA	2	6	4415829	4415834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10518	NC_011884	GA	3	6	4415873	4415878	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10519	NC_011884	AGTTC	2	10	4415901	4415910	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
10520	NC_011884	ATCC	2	8	4415926	4415933	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10521	NC_011884	AGG	3	9	4416679	4416687	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10522	NC_011884	CTTA	2	8	4417936	4417943	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10523	NC_011884	AGA	2	6	4418057	4418062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10524	NC_011884	GAC	2	6	4418127	4418132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10525	NC_011884	CGAT	2	8	4419464	4419471	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10526	NC_011884	AG	3	6	4419515	4419520	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10527	NC_011884	GCA	2	6	4419581	4419586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10528	NC_011884	TC	3	6	4419618	4419623	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10529	NC_011884	GTATC	2	10	4421986	4421995	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
10530	NC_011884	CTT	2	6	4424089	4424094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10531	NC_011884	AAG	2	6	4424115	4424120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10532	NC_011884	AG	3	6	4424119	4424124	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10533	NC_011884	CA	3	6	4424133	4424138	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10534	NC_011884	A	6	6	4424138	4424143	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10535	NC_011884	C	6	6	4424598	4424603	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10536	NC_011884	G	6	6	4425187	4425192	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10537	NC_011884	GGT	2	6	4426815	4426820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10538	NC_011884	CAGGAA	2	12	4427339	4427350	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10539	NC_011884	ACACC	2	10	4427373	4427382	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
10540	NC_011884	ATAGA	2	10	4427434	4427443	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
10541	NC_011884	AAC	2	6	4427538	4427543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10542	NC_011884	T	6	6	4427624	4427629	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10543	NC_011884	TGC	2	6	4427706	4427711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10544	NC_011884	GATTT	2	10	4431632	4431641	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
10545	NC_011884	AGATA	2	10	4431650	4431659	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
10546	NC_011884	CTC	2	6	4432622	4432627	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10547	NC_011884	CCT	2	6	4433748	4433753	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10548	NC_011884	AT	3	6	4433771	4433776	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10549	NC_011884	AAT	2	6	4433795	4433800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10550	NC_011884	GACTG	2	10	4433852	4433861	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
10551	NC_011884	TGTT	2	8	4433870	4433877	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10552	NC_011884	AG	3	6	4433970	4433975	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10553	NC_011884	GAA	2	6	4434021	4434026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10554	NC_011884	CCGGA	2	10	4434116	4434125	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
10555	NC_011884	CAA	2	6	4434133	4434138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10556	NC_011884	ATA	2	6	4434179	4434184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10557	NC_011884	CAT	2	6	4435762	4435767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10558	NC_011884	GGTT	2	8	4438449	4438456	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10559	NC_011884	AAC	2	6	4439768	4439773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10560	NC_011884	T	6	6	4440341	4440346	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10561	NC_011884	TTAAT	2	10	4440374	4440383	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10562	NC_011884	GCTA	2	8	4440427	4440434	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10563	NC_011884	A	7	7	4440442	4440448	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10564	NC_011884	TAA	2	6	4440451	4440456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10565	NC_011884	GAT	2	6	4440483	4440488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10566	NC_011884	TCC	2	6	4440496	4440501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10567	NC_011884	AGTTA	2	10	4440571	4440580	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10568	NC_011884	GGA	2	6	4440605	4440610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10569	NC_011884	T	6	6	4444364	4444369	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10570	NC_011884	AAAT	2	8	4445614	4445621	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10571	NC_011884	GCA	2	6	4445623	4445628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10572	NC_011884	GTCC	2	8	4445639	4445646	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10573	NC_011884	A	7	7	4445738	4445744	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10574	NC_011884	CTG	2	6	4445784	4445789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10575	NC_011884	AGT	2	6	4445802	4445807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10576	NC_011884	AAGA	2	8	4446456	4446463	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10577	NC_011884	TTG	2	6	4446482	4446487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10578	NC_011884	AG	3	6	4446572	4446577	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10579	NC_011884	AGGA	2	8	4447764	4447771	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10580	NC_011884	CATT	2	8	4449558	4449565	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10581	NC_011884	TTC	2	6	4449892	4449897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10582	NC_011884	ATCCC	2	10	4449965	4449974	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
10583	NC_011884	TTG	2	6	4449987	4449992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10584	NC_011884	CCT	2	6	4453208	4453213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10585	NC_011884	TGA	2	6	4453226	4453231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10586	NC_011884	GAAG	2	8	4453273	4453280	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10587	NC_011884	GCT	2	6	4453299	4453304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10588	NC_011884	CT	3	6	4453303	4453308	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10589	NC_011884	GTC	2	6	4453382	4453387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10590	NC_011884	TTTGGG	2	12	4454668	4454679	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10591	NC_011884	CAA	2	6	4455087	4455092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10592	NC_011884	TAC	2	6	4455199	4455204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10593	NC_011884	C	6	6	4455740	4455745	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10594	NC_011884	AAC	2	6	4455770	4455775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10595	NC_011884	TCT	2	6	4455949	4455954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10596	NC_011884	TCA	2	6	4458360	4458365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10597	NC_011884	GGTCAG	2	12	4458372	4458383	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
10598	NC_011884	AAC	2	6	4458405	4458410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10599	NC_011884	TAAGGG	2	12	4458419	4458430	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
10600	NC_011884	TGA	2	6	4458442	4458447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10601	NC_011884	CTT	2	6	4458549	4458554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10602	NC_011884	ACA	2	6	4460566	4460571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10603	NC_011884	ATG	2	6	4460613	4460618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10604	NC_011884	TAA	2	6	4460628	4460633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10605	NC_011884	CTC	2	6	4461860	4461865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10606	NC_011884	TCCT	2	8	4462646	4462653	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10607	NC_011884	TTC	2	6	4462749	4462754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10608	NC_011884	GTT	2	6	4462756	4462761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10609	NC_011884	CGT	2	6	4463426	4463431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10610	NC_011884	ATC	2	6	4463500	4463505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10611	NC_011884	CTCC	2	8	4463516	4463523	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
10612	NC_011884	CTTAA	2	10	4464355	4464364	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10613	NC_011884	GCA	2	6	4464386	4464391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10614	NC_011884	ACTC	2	8	4464425	4464432	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10615	NC_011884	CAT	2	6	4465736	4465741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10616	NC_011884	ATTC	2	8	4465762	4465769	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10617	NC_011884	T	6	6	4467940	4467945	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10618	NC_011884	AATTGG	2	12	4467998	4468009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10619	NC_011884	ACT	2	6	4468026	4468031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10620	NC_011884	CAT	2	6	4468037	4468042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10621	NC_011884	CAAA	2	8	4468048	4468055	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10622	NC_011884	TTC	2	6	4468193	4468198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10623	NC_011884	AATA	2	8	4468206	4468213	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10624	NC_011884	CTT	2	6	4468223	4468228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10625	NC_011884	ATCA	2	8	4468243	4468250	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10626	NC_011884	ATT	2	6	4468810	4468815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10627	NC_011884	TC	3	6	4470137	4470142	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10628	NC_011884	TGAAT	2	10	4470160	4470169	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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10630	NC_011884	TTC	2	6	4470247	4470252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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