MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7425 chromosome

Total Repeats: 13023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_011884	ACA	2	6	3527236	3527241	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8502	NC_011884	TGAA	2	8	3529492	3529499	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8503	NC_011884	GCT	2	6	3530374	3530379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8504	NC_011884	CTC	2	6	3530387	3530392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8505	NC_011884	TTC	2	6	3530412	3530417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8506	NC_011884	TTC	2	6	3530463	3530468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8507	NC_011884	TTC	2	6	3534861	3534866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8508	NC_011884	GCA	2	6	3534936	3534941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8509	NC_011884	AAG	2	6	3534964	3534969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8510	NC_011884	CA	4	8	3535657	3535664	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8511	NC_011884	GGA	2	6	3535684	3535689	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8512	NC_011884	CCT	2	6	3535778	3535783	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8513	NC_011884	GCA	2	6	3535896	3535901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8514	NC_011884	GCAAG	2	10	3540236	3540245	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
8515	NC_011884	AG	3	6	3540380	3540385	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8516	NC_011884	TTG	2	6	3540425	3540430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8517	NC_011884	CAATT	2	10	3540435	3540444	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
8518	NC_011884	CAG	2	6	3540471	3540476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8519	NC_011884	TGT	2	6	3540518	3540523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8520	NC_011884	T	6	6	3544899	3544904	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8521	NC_011884	AAT	2	6	3544936	3544941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8522	NC_011884	GATA	2	8	3544972	3544979	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8523	NC_011884	GCA	2	6	3544986	3544991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8524	NC_011884	TGT	2	6	3545067	3545072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8525	NC_011884	AGCA	2	8	3545160	3545167	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8526	NC_011884	GCC	2	6	3545203	3545208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8527	NC_011884	TAG	2	6	3545240	3545245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8528	NC_011884	TTG	2	6	3545348	3545353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8529	NC_011884	AAG	2	6	3546396	3546401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8530	NC_011884	CTTTCA	2	12	3546588	3546599	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8531	NC_011884	GCA	2	6	3546647	3546652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8532	NC_011884	GA	4	8	3549405	3549412	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8533	NC_011884	CCAT	2	8	3554543	3554550	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8534	NC_011884	GAA	2	6	3556174	3556179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8535	NC_011884	GCT	2	6	3556188	3556193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8536	NC_011884	ATCG	2	8	3556258	3556265	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8537	NC_011884	CAG	2	6	3556276	3556281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8538	NC_011884	AGA	2	6	3556441	3556446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8539	NC_011884	TCCT	2	8	3558351	3558358	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8540	NC_011884	CAG	2	6	3558376	3558381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8541	NC_011884	CTGGA	2	10	3558417	3558426	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
8542	NC_011884	ACT	2	6	3558428	3558433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8543	NC_011884	TCG	2	6	3558455	3558460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8544	NC_011884	G	6	6	3558469	3558474	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8545	NC_011884	TGA	2	6	3562548	3562553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8546	NC_011884	TTTG	2	8	3562585	3562592	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8547	NC_011884	G	6	6	3562616	3562621	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8548	NC_011884	G	6	6	3562625	3562630	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8549	NC_011884	GCTAG	2	10	3562635	3562644	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
8550	NC_011884	CCT	2	6	3563168	3563173	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8551	NC_011884	CGA	2	6	3563224	3563229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8552	NC_011884	GA	3	6	3563228	3563233	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8553	NC_011884	TTG	2	6	3563380	3563385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8554	NC_011884	TCT	2	6	3563491	3563496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8555	NC_011884	ATT	2	6	3563507	3563512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8556	NC_011884	AAC	2	6	3564321	3564326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8557	NC_011884	ATGA	2	8	3564373	3564380	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8558	NC_011884	GGT	2	6	3565399	3565404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8559	NC_011884	T	6	6	3565500	3565505	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8560	NC_011884	CAA	2	6	3565544	3565549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8561	NC_011884	ATT	2	6	3565590	3565595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8562	NC_011884	TTCT	2	8	3566857	3566864	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8563	NC_011884	TCC	2	6	3566943	3566948	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8564	NC_011884	GAA	2	6	3566961	3566966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8565	NC_011884	CGC	2	6	3567013	3567018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8566	NC_011884	AAT	2	6	3567091	3567096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8567	NC_011884	CAGA	2	8	3567130	3567137	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8568	NC_011884	AAT	2	6	3567138	3567143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8569	NC_011884	AAT	2	6	3567189	3567194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8570	NC_011884	AGA	2	6	3567259	3567264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8571	NC_011884	GTTT	2	8	3567304	3567311	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8572	NC_011884	CACAA	2	10	3570385	3570394	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
8573	NC_011884	ATC	2	6	3570397	3570402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8574	NC_011884	GAT	2	6	3570973	3570978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8575	NC_011884	TGT	2	6	3571491	3571496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8576	NC_011884	TAG	2	6	3571513	3571518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8577	NC_011884	CTA	2	6	3571520	3571525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8578	NC_011884	AAC	2	6	3572741	3572746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8579	NC_011884	CAA	2	6	3572749	3572754	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8580	NC_011884	TTC	2	6	3572782	3572787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8581	NC_011884	AAT	2	6	3572799	3572804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8582	NC_011884	AAACC	2	10	3573939	3573948	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
8583	NC_011884	GCT	2	6	3573962	3573967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8584	NC_011884	AAC	2	6	3573999	3574004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8585	NC_011884	TGC	2	6	3574188	3574193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8586	NC_011884	TCTA	2	8	3574252	3574259	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8587	NC_011884	CTATC	2	10	3574355	3574364	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
8588	NC_011884	GAT	2	6	3574373	3574378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8589	NC_011884	GCA	2	6	3574455	3574460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8590	NC_011884	GCA	2	6	3574474	3574479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8591	NC_011884	CGC	2	6	3574519	3574524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8592	NC_011884	AGC	2	6	3574554	3574559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8593	NC_011884	GAT	2	6	3574586	3574591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8594	NC_011884	TCA	2	6	3574698	3574703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8595	NC_011884	CT	3	6	3575433	3575438	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8596	NC_011884	A	7	7	3575449	3575455	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8597	NC_011884	AACA	2	8	3575530	3575537	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8598	NC_011884	CT	3	6	3576504	3576509	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8599	NC_011884	TGC	2	6	3576510	3576515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8600	NC_011884	AT	3	6	3579303	3579308	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8601	NC_011884	TTAA	2	8	3579332	3579339	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8602	NC_011884	ATA	2	6	3579357	3579362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8603	NC_011884	CAG	2	6	3579371	3579376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8604	NC_011884	CT	3	6	3580549	3580554	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8605	NC_011884	AAC	2	6	3580557	3580562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8606	NC_011884	ACC	2	6	3581223	3581228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8607	NC_011884	CCTT	2	8	3581283	3581290	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8608	NC_011884	A	6	6	3588279	3588284	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8609	NC_011884	GGC	2	6	3588295	3588300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8610	NC_011884	CAT	2	6	3588341	3588346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8611	NC_011884	CAC	2	6	3588423	3588428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8612	NC_011884	CCA	2	6	3589186	3589191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8613	NC_011884	GCT	2	6	3589208	3589213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8614	NC_011884	GAT	2	6	3589218	3589223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8615	NC_011884	TACC	2	8	3590225	3590232	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8616	NC_011884	G	6	6	3590234	3590239	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8617	NC_011884	GAGGAA	2	12	3590351	3590362	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8618	NC_011884	AGTTG	2	10	3591189	3591198	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
8619	NC_011884	CTA	2	6	3595973	3595978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8620	NC_011884	CAA	2	6	3595982	3595987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8621	NC_011884	GAA	2	6	3595990	3595995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8622	NC_011884	C	6	6	3596023	3596028	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8623	NC_011884	TCC	2	6	3596069	3596074	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8624	NC_011884	TTA	2	6	3596096	3596101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8625	NC_011884	A	6	6	3596261	3596266	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8626	NC_011884	CA	3	6	3596277	3596282	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8627	NC_011884	TGC	2	6	3596313	3596318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8628	NC_011884	ATT	2	6	3596620	3596625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8629	NC_011884	T	6	6	3596624	3596629	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8630	NC_011884	ATC	2	6	3596635	3596640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8631	NC_011884	TGG	2	6	3596653	3596658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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