MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7425 chromosome

Total Repeats: 13023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_011884	GCA	2	6	3369866	3369871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8002	NC_011884	GA	3	6	3369874	3369879	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8003	NC_011884	CG	3	6	3370593	3370598	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8004	NC_011884	TCT	2	6	3370637	3370642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8005	NC_011884	GCA	2	6	3371744	3371749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8006	NC_011884	AGG	2	6	3371873	3371878	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8007	NC_011884	ATC	2	6	3371896	3371901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8008	NC_011884	AAAGC	2	10	3371936	3371945	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
8009	NC_011884	ACCC	2	8	3371963	3371970	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
8010	NC_011884	T	6	6	3371987	3371992	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8011	NC_011884	GAT	2	6	3372871	3372876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8012	NC_011884	CCTT	2	8	3374350	3374357	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8013	NC_011884	TAA	2	6	3374367	3374372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8014	NC_011884	TAA	2	6	3374381	3374386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8015	NC_011884	CA	3	6	3374439	3374444	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8016	NC_011884	CAA	2	6	3374446	3374451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8017	NC_011884	TAC	2	6	3374505	3374510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8018	NC_011884	ATTAGC	2	12	3374515	3374526	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8019	NC_011884	TTC	2	6	3374551	3374556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8020	NC_011884	TA	3	6	3374576	3374581	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8021	NC_011884	AAT	2	6	3374595	3374600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8022	NC_011884	T	7	7	3374604	3374610	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8023	NC_011884	TA	3	6	3374671	3374676	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8024	NC_011884	TTG	2	6	3374690	3374695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8025	NC_011884	AAC	2	6	3374706	3374711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8026	NC_011884	AGT	2	6	3374774	3374779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8027	NC_011884	TAA	2	6	3374963	3374968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8028	NC_011884	CTTA	2	8	3374970	3374977	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8029	NC_011884	ATT	3	9	3374979	3374987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8030	NC_011884	TG	3	6	3377154	3377159	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8031	NC_011884	GCACT	2	10	3377200	3377209	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
8032	NC_011884	CCAG	2	8	3377272	3377279	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8033	NC_011884	GTG	2	6	3377366	3377371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8034	NC_011884	CCA	2	6	3377383	3377388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8035	NC_011884	GCA	2	6	3379716	3379721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8036	NC_011884	GGGT	2	8	3381330	3381337	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
8037	NC_011884	AAG	2	6	3381340	3381345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8038	NC_011884	AAGG	2	8	3382573	3382580	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8039	NC_011884	TTAG	2	8	3383644	3383651	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8040	NC_011884	AGA	2	6	3383660	3383665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8041	NC_011884	CTG	2	6	3383754	3383759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8042	NC_011884	AG	3	6	3383774	3383779	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8043	NC_011884	ATGA	2	8	3383780	3383787	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8044	NC_011884	TAA	2	6	3383789	3383794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8045	NC_011884	GTT	2	6	3383837	3383842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8046	NC_011884	TAC	2	6	3383843	3383848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8047	NC_011884	AGG	2	6	3383888	3383893	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8048	NC_011884	CACCC	2	10	3383922	3383931	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
8049	NC_011884	CAA	2	6	3383986	3383991	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8050	NC_011884	ACA	2	6	3384000	3384005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8051	NC_011884	GATC	2	8	3384019	3384026	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8052	NC_011884	AAG	2	6	3384149	3384154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8053	NC_011884	GAT	2	6	3384159	3384164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8054	NC_011884	A	6	6	3384190	3384195	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8055	NC_011884	AGG	2	6	3384259	3384264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8056	NC_011884	TAG	2	6	3384267	3384272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8057	NC_011884	CTA	2	6	3384515	3384520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8058	NC_011884	TGGA	2	8	3384538	3384545	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8059	NC_011884	GTT	2	6	3384560	3384565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8060	NC_011884	TTG	2	6	3384579	3384584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8061	NC_011884	ACCG	2	8	3385369	3385376	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8062	NC_011884	CGG	2	6	3385412	3385417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8063	NC_011884	GAG	2	6	3385448	3385453	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8064	NC_011884	GTG	2	6	3385500	3385505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8065	NC_011884	GCC	2	6	3385592	3385597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8066	NC_011884	TTC	2	6	3385654	3385659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8067	NC_011884	AAC	2	6	3386293	3386298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8068	NC_011884	GCTGCC	2	12	3386447	3386458	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
8069	NC_011884	GA	3	6	3386461	3386466	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8070	NC_011884	ACG	2	6	3386506	3386511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8071	NC_011884	CAG	2	6	3386589	3386594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8072	NC_011884	AAC	2	6	3386601	3386606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8073	NC_011884	TCG	2	6	3386789	3386794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8074	NC_011884	CCA	2	6	3386820	3386825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8075	NC_011884	GAT	2	6	3386829	3386834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8076	NC_011884	A	6	6	3386889	3386894	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8077	NC_011884	C	6	6	3387140	3387145	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8078	NC_011884	CCA	2	6	3388552	3388557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8079	NC_011884	CAG	2	6	3388962	3388967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8080	NC_011884	AAACT	2	10	3389038	3389047	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
8081	NC_011884	T	6	6	3389100	3389105	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8082	NC_011884	GCG	2	6	3390789	3390794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8083	NC_011884	TC	3	6	3390815	3390820	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8084	NC_011884	GGAA	2	8	3390862	3390869	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8085	NC_011884	GATT	2	8	3390877	3390884	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8086	NC_011884	AATG	2	8	3390923	3390930	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8087	NC_011884	GTT	2	6	3390936	3390941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8088	NC_011884	GAC	2	6	3393381	3393386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8089	NC_011884	TGGAGT	2	12	3393410	3393421	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
8090	NC_011884	CTG	2	6	3393447	3393452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8091	NC_011884	TTCA	2	8	3393511	3393518	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8092	NC_011884	GAG	2	6	3393601	3393606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8093	NC_011884	TCAA	2	8	3397750	3397757	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8094	NC_011884	TGG	2	6	3399995	3400000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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8096	NC_011884	TTCTC	2	10	3402549	3402558	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
8097	NC_011884	GT	3	6	3402578	3402583	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8098	NC_011884	AAC	2	6	3402592	3402597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8099	NC_011884	TAA	2	6	3403773	3403778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8100	NC_011884	AGG	2	6	3403797	3403802	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8101	NC_011884	TCT	2	6	3403812	3403817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8102	NC_011884	ATAA	2	8	3403822	3403829	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8103	NC_011884	A	6	6	3403854	3403859	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8104	NC_011884	T	6	6	3403875	3403880	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8105	NC_011884	AC	3	6	3403927	3403932	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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8108	NC_011884	ATAA	2	8	3404041	3404048	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8109	NC_011884	AAAGT	2	10	3404805	3404814	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
8110	NC_011884	CTAT	2	8	3404825	3404832	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8111	NC_011884	AGA	2	6	3405462	3405467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8112	NC_011884	TGC	2	6	3405477	3405482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8113	NC_011884	CTT	2	6	3407088	3407093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8114	NC_011884	ATTC	2	8	3407143	3407150	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8115	NC_011884	A	7	7	3407158	3407164	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8116	NC_011884	ACA	2	6	3407171	3407176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8117	NC_011884	GTATAG	2	12	3407355	3407366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8119	NC_011884	CTTG	2	8	3408524	3408531	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8120	NC_011884	GTTC	2	8	3408612	3408619	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8121	NC_011884	ATTT	2	8	3409305	3409312	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8122	NC_011884	TCTG	2	8	3409320	3409327	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8123	NC_011884	ACCCT	2	10	3409350	3409359	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
8124	NC_011884	ATTA	2	8	3409374	3409381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8125	NC_011884	TA	3	6	3409584	3409589	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8126	NC_011884	AGT	3	9	3409591	3409599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8127	NC_011884	ATC	2	6	3410540	3410545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8128	NC_011884	GT	3	6	3412863	3412868	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8129	NC_011884	AGT	2	6	3412918	3412923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8130	NC_011884	T	7	7	3412937	3412943	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8132	NC_011884	CGAT	2	8	3413927	3413934	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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8395	NC_011884	CGGGTA	2	12	3512136	3512147	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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