MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Chloroflexus aggregans DSM 9485 chromosome

Total Repeats: 12718

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_011831	TGA	2	6	4215016	4215021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11502	NC_011831	AGCA	2	8	4215082	4215089	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11503	NC_011831	CCGA	2	8	4215168	4215175	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11504	NC_011831	GTTGC	2	10	4215183	4215192	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
11505	NC_011831	GCAG	2	8	4215241	4215248	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11506	NC_011831	CCGG	2	8	4215348	4215355	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11507	NC_011831	CTC	2	6	4215376	4215381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11508	NC_011831	GGT	2	6	4215472	4215477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11509	NC_011831	GTC	2	6	4215521	4215526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11510	NC_011831	CGG	3	9	4215629	4215637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11511	NC_011831	GC	3	6	4215728	4215733	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11512	NC_011831	GC	3	6	4215780	4215785	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11513	NC_011831	AGC	2	6	4215823	4215828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11514	NC_011831	GAT	2	6	4215836	4215841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11515	NC_011831	GCT	2	6	4215966	4215971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11516	NC_011831	ACA	2	6	4216015	4216020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11517	NC_011831	AAC	2	6	4216094	4216099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11518	NC_011831	TGGT	2	8	4216178	4216185	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11519	NC_011831	TC	3	6	4216235	4216240	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11520	NC_011831	TAGA	2	8	4216247	4216254	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11521	NC_011831	AGT	2	6	4216293	4216298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11522	NC_011831	GAG	2	6	4216301	4216306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11523	NC_011831	CGG	2	6	4216311	4216316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11524	NC_011831	ACGC	2	8	4216341	4216348	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11525	NC_011831	TTC	2	6	4216361	4216366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11526	NC_011831	GTA	2	6	4216380	4216385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11527	NC_011831	ATC	2	6	4216392	4216397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11528	NC_011831	ACG	2	6	4216414	4216419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11529	NC_011831	ATAGTT	2	12	4216436	4216447	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11530	NC_011831	ATC	2	6	4217498	4217503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11531	NC_011831	GTCC	2	8	4217559	4217566	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11532	NC_011831	GC	3	6	4217667	4217672	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11533	NC_011831	CCT	2	6	4217701	4217706	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11534	NC_011831	GGT	2	6	4217725	4217730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11535	NC_011831	GC	3	6	4217769	4217774	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11536	NC_011831	CCT	2	6	4217802	4217807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11537	NC_011831	GGT	2	6	4217826	4217831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11538	NC_011831	TGCG	2	8	4217952	4217959	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11539	NC_011831	CCT	2	6	4218010	4218015	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11540	NC_011831	AGC	2	6	4218032	4218037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11541	NC_011831	CCAC	2	8	4218060	4218067	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
11542	NC_011831	G	6	6	4218073	4218078	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11543	NC_011831	ATC	2	6	4218133	4218138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11544	NC_011831	AGA	2	6	4218149	4218154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11545	NC_011831	GCG	2	6	4218210	4218215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11546	NC_011831	GCAA	2	8	4218241	4218248	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11547	NC_011831	GCAT	2	8	4218264	4218271	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11548	NC_011831	AGG	2	6	4218305	4218310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11549	NC_011831	GA	3	6	4218619	4218624	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11550	NC_011831	GGAA	2	8	4220817	4220824	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11551	NC_011831	GAGC	2	8	4220850	4220857	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11552	NC_011831	GAT	2	6	4220912	4220917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11553	NC_011831	AG	3	6	4220985	4220990	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11554	NC_011831	TGCTC	2	10	4221023	4221032	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
11555	NC_011831	GTT	2	6	4221042	4221047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11556	NC_011831	GCA	2	6	4222386	4222391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11557	NC_011831	TGA	2	6	4222427	4222432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11558	NC_011831	GGT	2	6	4222446	4222451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11559	NC_011831	GC	3	6	4222776	4222781	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11560	NC_011831	ACG	2	6	4222786	4222791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11561	NC_011831	TAA	2	6	4222806	4222811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11562	NC_011831	AGG	2	6	4222815	4222820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11563	NC_011831	CTG	2	6	4222826	4222831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11564	NC_011831	TCC	2	6	4223511	4223516	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11565	NC_011831	AAGA	2	8	4223613	4223620	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11566	NC_011831	GC	3	6	4224263	4224268	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11567	NC_011831	TGG	2	6	4224424	4224429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11568	NC_011831	GCAA	2	8	4224509	4224516	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11569	NC_011831	AGG	2	6	4224575	4224580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11570	NC_011831	TCTG	2	8	4225347	4225354	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11571	NC_011831	AAC	2	6	4225412	4225417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11572	NC_011831	CGTGA	2	10	4226694	4226703	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
11573	NC_011831	ACC	2	6	4226736	4226741	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11574	NC_011831	ACG	2	6	4228267	4228272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11575	NC_011831	AC	3	6	4228285	4228290	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11576	NC_011831	GTAA	2	8	4231572	4231579	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11577	NC_011831	TCG	2	6	4231581	4231586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11578	NC_011831	CTGGAA	2	12	4231594	4231605	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11579	NC_011831	CAC	2	6	4231802	4231807	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11580	NC_011831	TCGC	2	8	4236043	4236050	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11581	NC_011831	CGG	2	6	4240497	4240502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11582	NC_011831	AGGG	2	8	4240527	4240534	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
11583	NC_011831	CTC	2	6	4241329	4241334	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11584	NC_011831	GGCC	2	8	4242186	4242193	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11585	NC_011831	GGC	2	6	4242241	4242246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11586	NC_011831	CTC	2	6	4245202	4245207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11587	NC_011831	GACAG	2	10	4245220	4245229	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
11588	NC_011831	CTT	2	6	4245230	4245235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11589	NC_011831	CCT	2	6	4246530	4246535	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11590	NC_011831	TAA	2	6	4246571	4246576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11591	NC_011831	AAG	2	6	4246595	4246600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11592	NC_011831	GCTG	2	8	4246690	4246697	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11593	NC_011831	AC	3	6	4246779	4246784	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11594	NC_011831	TCGT	2	8	4246827	4246834	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11595	NC_011831	GC	3	6	4246898	4246903	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11596	NC_011831	TACAG	2	10	4246904	4246913	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
11597	NC_011831	CCG	2	6	4246975	4246980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11598	NC_011831	TTG	2	6	4247575	4247580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11599	NC_011831	CCT	2	6	4249460	4249465	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11600	NC_011831	CGAC	2	8	4249480	4249487	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11601	NC_011831	CAG	2	6	4249524	4249529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11602	NC_011831	ATC	2	6	4249552	4249557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11603	NC_011831	ATC	2	6	4249606	4249611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11604	NC_011831	GCA	2	6	4251060	4251065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11605	NC_011831	ATGG	2	8	4251097	4251104	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11606	NC_011831	GGC	2	6	4251114	4251119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11607	NC_011831	GGA	2	6	4251195	4251200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11608	NC_011831	GCG	2	6	4251222	4251227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11609	NC_011831	TGC	2	6	4251236	4251241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11610	NC_011831	GTTG	2	8	4252677	4252684	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11611	NC_011831	GCA	2	6	4252720	4252725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11612	NC_011831	CCG	2	6	4252753	4252758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11613	NC_011831	GGC	2	6	4252790	4252795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11614	NC_011831	AAG	2	6	4253870	4253875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11615	NC_011831	GGA	2	6	4253904	4253909	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11616	NC_011831	TAA	2	6	4253947	4253952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11617	NC_011831	CTT	2	6	4253986	4253991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11618	NC_011831	ACG	2	6	4254022	4254027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11619	NC_011831	GAC	2	6	4254056	4254061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11620	NC_011831	GAT	2	6	4254082	4254087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11621	NC_011831	TGC	2	6	4254139	4254144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11622	NC_011831	TGTGT	2	10	4254203	4254212	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
11623	NC_011831	GGC	2	6	4254233	4254238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11624	NC_011831	ATC	2	6	4254242	4254247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11625	NC_011831	TGA	2	6	4254262	4254267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11626	NC_011831	CGG	2	6	4254434	4254439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11627	NC_011831	GAT	2	6	4254478	4254483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11628	NC_011831	GGT	2	6	4254530	4254535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11629	NC_011831	TGC	2	6	4254583	4254588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11631	NC_011831	TGTCT	2	10	4254701	4254710	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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