MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Chloroflexus aggregans DSM 9485 chromosome

Total Repeats: 12718

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_011831	AC	4	8	4138020	4138027	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11002	NC_011831	CGC	2	6	4138057	4138062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11003	NC_011831	GGC	2	6	4138065	4138070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11004	NC_011831	AC	3	6	4138189	4138194	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11005	NC_011831	CGTCA	2	10	4138199	4138208	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
11006	NC_011831	C	6	6	4138243	4138248	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11007	NC_011831	CCT	2	6	4138334	4138339	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11008	NC_011831	GCT	2	6	4138382	4138387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11009	NC_011831	ACG	2	6	4138511	4138516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11010	NC_011831	ATG	2	6	4138527	4138532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11011	NC_011831	GATG	2	8	4138540	4138547	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11012	NC_011831	GGCAC	2	10	4138577	4138586	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
11013	NC_011831	TGG	2	6	4138657	4138662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11014	NC_011831	GGA	2	6	4138712	4138717	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11015	NC_011831	AGCG	2	8	4138720	4138727	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11016	NC_011831	GTA	2	6	4138734	4138739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11017	NC_011831	GCG	2	6	4138740	4138745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11018	NC_011831	GCC	2	6	4138783	4138788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11019	NC_011831	GGA	2	6	4138810	4138815	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11020	NC_011831	CAGG	2	8	4138821	4138828	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11021	NC_011831	CAC	2	6	4138843	4138848	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11022	NC_011831	G	6	6	4138922	4138927	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11023	NC_011831	GAA	2	6	4138956	4138961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11024	NC_011831	AG	3	6	4139071	4139076	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11025	NC_011831	AGCCGG	2	12	4139185	4139196	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
11026	NC_011831	ACGCG	2	10	4139415	4139424	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
11027	NC_011831	TGT	3	9	4139439	4139447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11028	NC_011831	CG	3	6	4139492	4139497	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11029	NC_011831	CGG	2	6	4139516	4139521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11030	NC_011831	CGT	2	6	4139533	4139538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11031	NC_011831	AAC	2	6	4139548	4139553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11032	NC_011831	CCG	2	6	4139559	4139564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11033	NC_011831	AGG	2	6	4139622	4139627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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11035	NC_011831	AGC	2	6	4139679	4139684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11036	NC_011831	CGT	2	6	4139758	4139763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11037	NC_011831	GCG	2	6	4139768	4139773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11038	NC_011831	AGC	2	6	4139834	4139839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11039	NC_011831	ATC	2	6	4139849	4139854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11040	NC_011831	ACA	2	6	4139943	4139948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11041	NC_011831	GGA	2	6	4139969	4139974	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11042	NC_011831	CGC	2	6	4140010	4140015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11043	NC_011831	CGG	2	6	4140070	4140075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11044	NC_011831	GAG	2	6	4140204	4140209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11045	NC_011831	GAA	2	6	4140269	4140274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11046	NC_011831	TGC	2	6	4140279	4140284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11047	NC_011831	CTG	2	6	4140370	4140375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11048	NC_011831	TGCC	2	8	4140404	4140411	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11049	NC_011831	AGGGG	2	10	4140428	4140437	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
11050	NC_011831	CCGAA	2	10	4140446	4140455	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
11051	NC_011831	CGG	2	6	4140467	4140472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11052	NC_011831	TAC	2	6	4140641	4140646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11053	NC_011831	GGA	2	6	4140677	4140682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11054	NC_011831	GCCG	2	8	4140714	4140721	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11055	NC_011831	CGG	2	6	4140766	4140771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11056	NC_011831	TGGC	2	8	4140785	4140792	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11057	NC_011831	CCT	2	6	4140816	4140821	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11058	NC_011831	GC	3	6	4140836	4140841	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11059	NC_011831	CCG	2	6	4140869	4140874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11060	NC_011831	CGG	2	6	4141039	4141044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11061	NC_011831	TCG	2	6	4141067	4141072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11062	NC_011831	CGT	2	6	4141147	4141152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11063	NC_011831	GGAC	2	8	4141230	4141237	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11064	NC_011831	TGG	2	6	4141241	4141246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11065	NC_011831	GGC	2	6	4141258	4141263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11066	NC_011831	CGC	2	6	4141325	4141330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11067	NC_011831	C	6	6	4141365	4141370	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11068	NC_011831	CGT	2	6	4141455	4141460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11069	NC_011831	GAC	2	6	4141508	4141513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11070	NC_011831	TTCA	2	8	4141522	4141529	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11071	NC_011831	GT	4	8	4141538	4141545	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11072	NC_011831	GCG	2	6	4141551	4141556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11073	NC_011831	ACCC	2	8	4141558	4141565	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
11074	NC_011831	CACC	2	8	4141645	4141652	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
11075	NC_011831	G	6	6	4141702	4141707	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11076	NC_011831	GGT	2	6	4141744	4141749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11077	NC_011831	TTG	2	6	4141767	4141772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11078	NC_011831	TGGT	2	8	4141869	4141876	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11079	NC_011831	GT	4	8	4142085	4142092	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11080	NC_011831	GT	3	6	4142134	4142139	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11081	NC_011831	GCA	2	6	4142262	4142267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11082	NC_011831	GTG	2	6	4142275	4142280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11083	NC_011831	GA	3	6	4142288	4142293	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11084	NC_011831	CTG	3	9	4142330	4142338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11085	NC_011831	CGA	2	6	4142485	4142490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11086	NC_011831	ATA	2	6	4142492	4142497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11087	NC_011831	C	6	6	4142498	4142503	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11088	NC_011831	GGA	2	6	4142526	4142531	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11089	NC_011831	GTA	2	6	4142573	4142578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11090	NC_011831	GT	3	6	4142872	4142877	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11091	NC_011831	TTC	2	6	4142897	4142902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11092	NC_011831	TCA	2	6	4142910	4142915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11093	NC_011831	GTT	2	6	4142959	4142964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11094	NC_011831	CAT	2	6	4146733	4146738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11095	NC_011831	CAT	2	6	4146746	4146751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11096	NC_011831	GT	3	6	4146752	4146757	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11097	NC_011831	GAA	2	6	4146765	4146770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11098	NC_011831	TAA	2	6	4146807	4146812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11099	NC_011831	ACAG	2	8	4148438	4148445	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11100	NC_011831	A	6	6	4149286	4149291	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11101	NC_011831	CCT	2	6	4149342	4149347	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11102	NC_011831	TAG	2	6	4149417	4149422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11103	NC_011831	TGCC	2	8	4149490	4149497	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11104	NC_011831	CCG	2	6	4149498	4149503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11105	NC_011831	GGT	2	6	4149512	4149517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11106	NC_011831	CAT	2	6	4149557	4149562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11107	NC_011831	ACA	2	6	4149589	4149594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11108	NC_011831	GAGG	2	8	4149885	4149892	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
11109	NC_011831	CGG	2	6	4150154	4150159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11110	NC_011831	AATG	2	8	4150174	4150181	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11111	NC_011831	GCTA	2	8	4152863	4152870	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11112	NC_011831	GCCC	2	8	4152898	4152905	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11113	NC_011831	GCTA	2	8	4152984	4152991	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11114	NC_011831	GCCC	2	8	4153019	4153026	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11115	NC_011831	GCTA	2	8	4153162	4153169	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11116	NC_011831	GCC	2	6	4153212	4153217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11117	NC_011831	GCC	2	6	4153254	4153259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11118	NC_011831	GCTA	2	8	4153325	4153332	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11119	NC_011831	GCCC	2	8	4153375	4153382	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11120	NC_011831	GCTA	2	8	4153447	4153454	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11121	NC_011831	GCCC	2	8	4153482	4153489	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11122	NC_011831	GCTA	2	8	4153611	4153618	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11123	NC_011831	GCCC	2	8	4153646	4153653	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11124	NC_011831	TGT	2	6	4156622	4156627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11125	NC_011831	GGC	2	6	4156659	4156664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11126	NC_011831	CGG	2	6	4156731	4156736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11127	NC_011831	TGG	2	6	4156756	4156761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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11129	NC_011831	TCCG	2	8	4156867	4156874	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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