MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Chloroflexus aggregans DSM 9485 chromosome

Total Repeats: 12718

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_011831	ACG	2	6	3992699	3992704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10502	NC_011831	CGT	2	6	3992750	3992755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10503	NC_011831	TCG	2	6	3992773	3992778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10504	NC_011831	CAC	2	6	3992784	3992789	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10505	NC_011831	TGT	2	6	3992792	3992797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10506	NC_011831	CGC	2	6	3992870	3992875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10507	NC_011831	CGG	2	6	3992885	3992890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10508	NC_011831	CGG	2	6	3992905	3992910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10509	NC_011831	GCA	2	6	3992916	3992921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10510	NC_011831	GC	3	6	3992932	3992937	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10511	NC_011831	TCG	2	6	3992957	3992962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10512	NC_011831	CGGT	2	8	3992972	3992979	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10513	NC_011831	CAC	2	6	3992983	3992988	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10514	NC_011831	AGA	2	6	3993036	3993041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10515	NC_011831	GCC	2	6	3993109	3993114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10516	NC_011831	CGGT	2	8	3993158	3993165	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10517	NC_011831	CCG	2	6	3993177	3993182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10518	NC_011831	CG	3	6	3993181	3993186	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10519	NC_011831	ACC	2	6	3993197	3993202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10520	NC_011831	TGG	2	6	3993224	3993229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10521	NC_011831	TCT	2	6	3993240	3993245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10522	NC_011831	CGT	2	6	3993264	3993269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10523	NC_011831	GAG	2	6	3993301	3993306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10524	NC_011831	CAC	2	6	3993316	3993321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10525	NC_011831	CGGC	2	8	3993345	3993352	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10526	NC_011831	CCCGC	2	10	3993390	3993399	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
10527	NC_011831	CG	3	6	3993414	3993419	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10528	NC_011831	TGG	2	6	3993453	3993458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10529	NC_011831	AG	4	8	3993462	3993469	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10530	NC_011831	TGC	2	6	3993497	3993502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10531	NC_011831	GCC	2	6	3993506	3993511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10532	NC_011831	TTC	2	6	3993539	3993544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10534	NC_011831	CCG	2	6	3993595	3993600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10535	NC_011831	CCG	2	6	3993636	3993641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10536	NC_011831	GTT	2	6	3993649	3993654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10537	NC_011831	GCG	2	6	3993712	3993717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10538	NC_011831	CCA	2	6	3993738	3993743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10539	NC_011831	CCG	2	6	3993745	3993750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10540	NC_011831	TTG	2	6	3993803	3993808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10541	NC_011831	GCG	2	6	3993915	3993920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10542	NC_011831	GTTC	2	8	3993954	3993961	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10543	NC_011831	CCT	2	6	3993987	3993992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10544	NC_011831	GTT	2	6	3994034	3994039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10545	NC_011831	GAT	2	6	3994082	3994087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10546	NC_011831	TCG	2	6	3994092	3994097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10547	NC_011831	GTC	2	6	3994203	3994208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10548	NC_011831	AACG	2	8	3994274	3994281	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10549	NC_011831	ATT	2	6	3994316	3994321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10550	NC_011831	CAC	2	6	3994373	3994378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10551	NC_011831	CG	3	6	3994394	3994399	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10552	NC_011831	TGA	2	6	3994417	3994422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10553	NC_011831	AAT	2	6	3994441	3994446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10554	NC_011831	TGC	2	6	3994465	3994470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10555	NC_011831	CCCG	2	8	3994493	3994500	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10556	NC_011831	GCA	2	6	3994584	3994589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10557	NC_011831	GCG	2	6	3994604	3994609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10558	NC_011831	TTGCT	2	10	3994620	3994629	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
10559	NC_011831	GCATGG	2	12	3999071	3999082	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
10560	NC_011831	GCC	2	6	3999110	3999115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10561	NC_011831	CGG	2	6	3999127	3999132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10562	NC_011831	GCG	2	6	3999149	3999154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10563	NC_011831	GCG	2	6	3999161	3999166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10564	NC_011831	AGG	2	6	3999180	3999185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10565	NC_011831	CACC	2	8	3999252	3999259	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
10566	NC_011831	A	6	6	3999286	3999291	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10567	NC_011831	GCC	2	6	3999314	3999319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10568	NC_011831	CGG	2	6	3999323	3999328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10569	NC_011831	TGA	2	6	3999368	3999373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10572	NC_011831	GC	3	6	3999435	3999440	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10573	NC_011831	ATG	2	6	3999567	3999572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10575	NC_011831	TGC	2	6	3999590	3999595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10577	NC_011831	TTG	2	6	4000353	4000358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10579	NC_011831	C	6	6	4002169	4002174	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10580	NC_011831	A	6	6	4005576	4005581	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10581	NC_011831	TA	3	6	4005584	4005589	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10582	NC_011831	ACC	2	6	4005614	4005619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10583	NC_011831	AC	3	6	4005666	4005671	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10584	NC_011831	GGT	2	6	4005755	4005760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10585	NC_011831	CCA	2	6	4005777	4005782	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10586	NC_011831	GA	3	6	4005787	4005792	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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10589	NC_011831	TCCT	2	8	4005914	4005921	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10590	NC_011831	CTG	2	6	4005923	4005928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10592	NC_011831	TGC	2	6	4005975	4005980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10593	NC_011831	CGATG	2	10	4005991	4006000	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
10594	NC_011831	GGT	2	6	4006018	4006023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10595	NC_011831	GTT	2	6	4006035	4006040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10597	NC_011831	CCG	2	6	4006082	4006087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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10599	NC_011831	GGT	2	6	4006143	4006148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10600	NC_011831	GTG	2	6	4006149	4006154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10601	NC_011831	TACGG	2	10	4006165	4006174	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
10602	NC_011831	CCG	2	6	4006205	4006210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10603	NC_011831	CGC	2	6	4006219	4006224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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10610	NC_011831	GTATG	3	15	4006620	4006634	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
10611	NC_011831	CAC	2	6	4006721	4006726	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10612	NC_011831	GGT	2	6	4006752	4006757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10613	NC_011831	GTATG	3	15	4006768	4006782	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
10614	NC_011831	CGG	2	6	4006805	4006810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10615	NC_011831	CGG	2	6	4006836	4006841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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10618	NC_011831	ACGC	2	8	4006894	4006901	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10619	NC_011831	GTG	2	6	4006944	4006949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10620	NC_011831	GTACG	2	10	4006971	4006980	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
10621	NC_011831	CGC	2	6	4007005	4007010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10622	NC_011831	CGT	2	6	4007027	4007032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10623	NC_011831	GTG	2	6	4007054	4007059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10624	NC_011831	G	6	6	4007080	4007085	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10625	NC_011831	GAC	2	6	4007114	4007119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10626	NC_011831	CCG	2	6	4007120	4007125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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10628	NC_011831	G	6	6	4007209	4007214	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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10755	NC_011831	AGCA	2	8	4046609	4046616	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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