MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Chloroflexus aggregans DSM 9485 chromosome

Total Repeats: 12718

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_011831	CGGGT	2	10	3767993	3768002	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
10002	NC_011831	ATC	2	6	3768006	3768011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10003	NC_011831	GAG	2	6	3768103	3768108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10004	NC_011831	GT	3	6	3768112	3768117	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10005	NC_011831	CCGA	2	8	3768229	3768236	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10006	NC_011831	GAG	2	6	3768237	3768242	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10007	NC_011831	GT	3	6	3768246	3768251	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10008	NC_011831	CCGA	2	8	3768363	3768370	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10009	NC_011831	GAG	2	6	3768371	3768376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10010	NC_011831	GT	3	6	3768380	3768385	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10011	NC_011831	CGGGT	2	10	3768395	3768404	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
10012	NC_011831	ACG	2	6	3771011	3771016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10013	NC_011831	AGG	2	6	3771918	3771923	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10014	NC_011831	ATT	2	6	3773843	3773848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10015	NC_011831	TCCT	2	8	3774333	3774340	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10016	NC_011831	GAT	2	6	3774435	3774440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10017	NC_011831	TCT	2	6	3774446	3774451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10018	NC_011831	TAA	2	6	3775284	3775289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10019	NC_011831	GGC	2	6	3775359	3775364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10020	NC_011831	CCA	2	6	3775365	3775370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10021	NC_011831	CTTC	2	8	3775424	3775431	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10022	NC_011831	TAT	2	6	3775432	3775437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10023	NC_011831	T	6	6	3775599	3775604	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10024	NC_011831	GTT	2	6	3775605	3775610	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10025	NC_011831	GAT	2	6	3775612	3775617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10026	NC_011831	AGG	2	6	3775627	3775632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10027	NC_011831	CAT	2	6	3777791	3777796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10028	NC_011831	GAT	2	6	3778593	3778598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10029	NC_011831	GAT	2	6	3778613	3778618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10030	NC_011831	GTA	2	6	3778659	3778664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10031	NC_011831	CAG	2	6	3778748	3778753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10032	NC_011831	TCA	2	6	3779038	3779043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10033	NC_011831	TTG	2	6	3781777	3781782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10034	NC_011831	TGT	2	6	3781832	3781837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10035	NC_011831	TAC	2	6	3781891	3781896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10036	NC_011831	TGC	2	6	3781943	3781948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10037	NC_011831	TCG	3	9	3781956	3781964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10038	NC_011831	GT	3	6	3781975	3781980	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10039	NC_011831	AG	3	6	3782003	3782008	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10040	NC_011831	CTC	2	6	3782064	3782069	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10041	NC_011831	CTC	2	6	3782077	3782082	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10042	NC_011831	CCGG	2	8	3782093	3782100	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10043	NC_011831	ATC	2	6	3782129	3782134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10044	NC_011831	GTT	2	6	3782144	3782149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10045	NC_011831	TGC	2	6	3782171	3782176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10046	NC_011831	GTT	2	6	3784118	3784123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10047	NC_011831	GCA	2	6	3784181	3784186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10048	NC_011831	TGCC	2	8	3784190	3784197	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10049	NC_011831	GCCC	2	8	3785400	3785407	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10050	NC_011831	GACA	2	8	3785433	3785440	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10051	NC_011831	CAT	2	6	3786618	3786623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10052	NC_011831	CGT	2	6	3787910	3787915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10053	NC_011831	CGCTC	2	10	3787916	3787925	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
10054	NC_011831	TCA	2	6	3787955	3787960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10055	NC_011831	TCC	2	6	3789527	3789532	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10056	NC_011831	GGCGA	2	10	3791783	3791792	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
10057	NC_011831	ACT	2	6	3791817	3791822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10058	NC_011831	T	7	7	3791822	3791828	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10059	NC_011831	AGC	2	6	3791860	3791865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10060	NC_011831	AT	3	6	3791924	3791929	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10061	NC_011831	GTG	2	6	3791934	3791939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10062	NC_011831	TTG	2	6	3791983	3791988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10063	NC_011831	TC	3	6	3792037	3792042	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10064	NC_011831	TAAA	2	8	3792043	3792050	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10065	NC_011831	TGT	2	6	3792098	3792103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10066	NC_011831	A	7	7	3792166	3792172	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10067	NC_011831	GTT	2	6	3792173	3792178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10068	NC_011831	TA	3	6	3792404	3792409	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10069	NC_011831	TTC	2	6	3792459	3792464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10070	NC_011831	GGT	2	6	3809103	3809108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10071	NC_011831	GATA	2	8	3809173	3809180	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10072	NC_011831	CTCGT	2	10	3809186	3809195	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
10073	NC_011831	CGT	2	6	3809199	3809204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10074	NC_011831	T	6	6	3809239	3809244	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10075	NC_011831	ACA	2	6	3809393	3809398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10076	NC_011831	CAA	2	6	3809908	3809913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10077	NC_011831	GAA	2	6	3811503	3811508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10078	NC_011831	GTA	2	6	3815874	3815879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10079	NC_011831	T	6	6	3815888	3815893	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10080	NC_011831	ATAAG	2	10	3820016	3820025	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
10081	NC_011831	CCA	2	6	3820749	3820754	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10082	NC_011831	CGG	2	6	3821943	3821948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10083	NC_011831	GAC	2	6	3821999	3822004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10084	NC_011831	CGG	2	6	3822009	3822014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10085	NC_011831	AGA	2	6	3822032	3822037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10086	NC_011831	CG	3	6	3822048	3822053	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10087	NC_011831	TCG	2	6	3823524	3823529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10088	NC_011831	CTG	2	6	3823539	3823544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10089	NC_011831	AGCGT	2	10	3823745	3823754	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
10090	NC_011831	TC	3	6	3823768	3823773	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10091	NC_011831	CGG	2	6	3825237	3825242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10092	NC_011831	TCG	2	6	3825268	3825273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10093	NC_011831	GTGTT	2	10	3825298	3825307	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
10094	NC_011831	GGT	2	6	3825308	3825313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10095	NC_011831	CCA	2	6	3825322	3825327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10096	NC_011831	GCA	2	6	3834696	3834701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10097	NC_011831	TTG	2	6	3834740	3834745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10098	NC_011831	ATG	2	6	3834773	3834778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10099	NC_011831	CA	3	6	3834889	3834894	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10100	NC_011831	CAT	2	6	3834896	3834901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10101	NC_011831	TGC	2	6	3836370	3836375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10102	NC_011831	AAG	2	6	3836389	3836394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10103	NC_011831	TCA	2	6	3837484	3837489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10104	NC_011831	GAC	2	6	3837529	3837534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10105	NC_011831	CAT	2	6	3837574	3837579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10106	NC_011831	TAT	2	6	3840477	3840482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10107	NC_011831	GT	3	6	3841294	3841299	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10108	NC_011831	ACG	2	6	3841331	3841336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10109	NC_011831	CAGA	2	8	3841346	3841353	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10110	NC_011831	CTCG	2	8	3841372	3841379	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10111	NC_011831	GGT	2	6	3841431	3841436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10112	NC_011831	AGCA	2	8	3841478	3841485	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10113	NC_011831	GTC	3	9	3843113	3843121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10114	NC_011831	GAC	2	6	3843158	3843163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10115	NC_011831	ACA	2	6	3843167	3843172	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10116	NC_011831	ATG	2	6	3843276	3843281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10117	NC_011831	AGC	2	6	3846031	3846036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10118	NC_011831	ACAA	2	8	3847917	3847924	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10119	NC_011831	TC	3	6	3847953	3847958	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10120	NC_011831	TCGTT	2	10	3850361	3850370	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
10121	NC_011831	CGC	2	6	3851183	3851188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10122	NC_011831	AGG	2	6	3851196	3851201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10123	NC_011831	TAG	2	6	3851204	3851209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10124	NC_011831	AAG	2	6	3851251	3851256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10125	NC_011831	TGA	2	6	3852426	3852431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10126	NC_011831	GCG	2	6	3852440	3852445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10127	NC_011831	GCC	2	6	3852457	3852462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10128	NC_011831	ATTGA	2	10	3855262	3855271	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10129	NC_011831	CGCAG	2	10	3855310	3855319	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
10130	NC_011831	CTTGC	2	10	3855343	3855352	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
10131	NC_011831	AT	3	6	3855377	3855382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10136	NC_011831	TAGT	2	8	3857703	3857710	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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10254	NC_011831	TAT	2	6	3925114	3925119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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