MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Chloroflexus aggregans DSM 9485 chromosome

Total Repeats: 12718

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9501	NC_011831	TGAT	2	8	3545642	3545649	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9502	NC_011831	CTA	2	6	3545659	3545664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9503	NC_011831	ATT	2	6	3545676	3545681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9504	NC_011831	GAG	2	6	3545702	3545707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9505	NC_011831	CTG	2	6	3547294	3547299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9506	NC_011831	AAC	2	6	3552439	3552444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9507	NC_011831	AAG	2	6	3552536	3552541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9508	NC_011831	AG	3	6	3552583	3552588	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9509	NC_011831	GCA	2	6	3552590	3552595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9510	NC_011831	GTTTC	2	10	3553575	3553584	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
9511	NC_011831	GATAA	2	10	3553732	3553741	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
9512	NC_011831	GTT	2	6	3553782	3553787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9513	NC_011831	GAG	2	6	3553897	3553902	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9514	NC_011831	TGGAA	2	10	3557335	3557344	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
9515	NC_011831	AG	3	6	3558874	3558879	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9516	NC_011831	A	6	6	3558926	3558931	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9517	NC_011831	GCG	2	6	3559040	3559045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9518	NC_011831	CGG	2	6	3559060	3559065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9519	NC_011831	CAT	2	6	3559222	3559227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9520	NC_011831	CCACGC	2	12	3559385	3559396	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
9521	NC_011831	GCC	2	6	3559430	3559435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9522	NC_011831	TGC	2	6	3559450	3559455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9523	NC_011831	TCG	2	6	3559459	3559464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9524	NC_011831	ACCCA	2	10	3559576	3559585	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
9525	NC_011831	CGGTC	2	10	3559591	3559600	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
9526	NC_011831	TGT	2	6	3559647	3559652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9527	NC_011831	GCC	2	6	3559675	3559680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9528	NC_011831	GCG	2	6	3559707	3559712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9529	NC_011831	GCT	2	6	3559752	3559757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9530	NC_011831	GCA	2	6	3559802	3559807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9531	NC_011831	GCC	2	6	3559883	3559888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9532	NC_011831	CGC	2	6	3559897	3559902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9533	NC_011831	TCGC	2	8	3559904	3559911	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9534	NC_011831	CGC	2	6	3559941	3559946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9535	NC_011831	GCG	2	6	3560105	3560110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9536	NC_011831	CGC	2	6	3560169	3560174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9537	NC_011831	CCA	2	6	3560208	3560213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9538	NC_011831	G	6	6	3560242	3560247	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
9539	NC_011831	ACT	2	6	3560312	3560317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9540	NC_011831	GCA	2	6	3560381	3560386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9541	NC_011831	GCA	2	6	3560471	3560476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9542	NC_011831	TGC	2	6	3560554	3560559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9543	NC_011831	CCG	2	6	3560611	3560616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9544	NC_011831	TTGC	2	8	3560624	3560631	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9545	NC_011831	GCA	2	6	3560703	3560708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9546	NC_011831	TC	3	6	3560709	3560714	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9547	NC_011831	GCC	2	6	3560723	3560728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9548	NC_011831	ACT	2	6	3560809	3560814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9549	NC_011831	CCG	2	6	3560856	3560861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9550	NC_011831	CGGC	2	8	3560955	3560962	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9551	NC_011831	ATCAC	2	10	3560990	3560999	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
9552	NC_011831	A	6	6	3561001	3561006	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9553	NC_011831	ACC	2	6	3561060	3561065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9554	NC_011831	CCAATC	2	12	3561071	3561082	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
9555	NC_011831	GTG	2	6	3561116	3561121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9556	NC_011831	TAC	2	6	3561676	3561681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9557	NC_011831	AAT	2	6	3561683	3561688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9558	NC_011831	TGT	2	6	3562474	3562479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9559	NC_011831	AGTG	2	8	3562496	3562503	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
9560	NC_011831	CGT	2	6	3563542	3563547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9561	NC_011831	CTG	2	6	3563572	3563577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9562	NC_011831	GCCG	2	8	3566713	3566720	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9563	NC_011831	TCC	2	6	3567692	3567697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9564	NC_011831	ACG	2	6	3567707	3567712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9565	NC_011831	CTTG	2	8	3567751	3567758	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9566	NC_011831	CCT	2	6	3567764	3567769	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9567	NC_011831	AGT	2	6	3571115	3571120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9568	NC_011831	TGCC	2	8	3571134	3571141	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9569	NC_011831	CGG	2	6	3574554	3574559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9570	NC_011831	CTT	2	6	3574617	3574622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9571	NC_011831	TTA	2	6	3575701	3575706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9572	NC_011831	TCA	2	6	3575721	3575726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9573	NC_011831	CTT	2	6	3575728	3575733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9574	NC_011831	CTAA	2	8	3575742	3575749	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9575	NC_011831	AGG	2	6	3575811	3575816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9576	NC_011831	CCG	2	6	3577367	3577372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9577	NC_011831	CCAA	2	8	3577414	3577421	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9578	NC_011831	ATT	2	6	3578130	3578135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9579	NC_011831	GAG	2	6	3578218	3578223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9580	NC_011831	GGC	2	6	3579611	3579616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9581	NC_011831	GCC	2	6	3579629	3579634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9582	NC_011831	TG	3	6	3580483	3580488	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9583	NC_011831	GAT	2	6	3581459	3581464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9584	NC_011831	CTAT	2	8	3581490	3581497	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9585	NC_011831	CTACAT	2	12	3581558	3581569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9586	NC_011831	CTC	2	6	3583581	3583586	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9587	NC_011831	CGAGC	2	10	3583637	3583646	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
9588	NC_011831	AAT	2	6	3583699	3583704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9589	NC_011831	CGG	2	6	3583719	3583724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9590	NC_011831	GGC	2	6	3583744	3583749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9591	NC_011831	A	6	6	3583800	3583805	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9592	NC_011831	CCTG	2	8	3583812	3583819	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9593	NC_011831	CTCA	2	8	3583851	3583858	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
9594	NC_011831	ATT	2	6	3583867	3583872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9595	NC_011831	CAA	2	6	3583885	3583890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9596	NC_011831	ATC	3	9	3583901	3583909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9597	NC_011831	TAG	2	6	3583933	3583938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9598	NC_011831	GATG	2	8	3585467	3585474	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
9599	NC_011831	A	6	6	3585518	3585523	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9600	NC_011831	TGT	2	6	3585548	3585553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9601	NC_011831	TG	3	6	3585598	3585603	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9602	NC_011831	GTA	2	6	3585620	3585625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9603	NC_011831	ATT	2	6	3585626	3585631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9604	NC_011831	AGC	2	6	3585634	3585639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9605	NC_011831	CTTG	2	8	3585649	3585656	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9606	NC_011831	GAG	2	6	3585703	3585708	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9607	NC_011831	CT	3	6	3588087	3588092	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9608	NC_011831	TAG	2	6	3588925	3588930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9609	NC_011831	TGA	2	6	3588958	3588963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9610	NC_011831	ACCG	2	8	3588974	3588981	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9611	NC_011831	TTA	2	6	3592107	3592112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9612	NC_011831	TAT	2	6	3592181	3592186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9613	NC_011831	GCT	2	6	3592262	3592267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9614	NC_011831	GTA	2	6	3595639	3595644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9615	NC_011831	AAGTG	2	10	3595698	3595707	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
9616	NC_011831	CAA	2	6	3595737	3595742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9617	NC_011831	GCTC	2	8	3595774	3595781	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9618	NC_011831	CCT	2	6	3596479	3596484	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9619	NC_011831	GGT	2	6	3596500	3596505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9620	NC_011831	ATT	2	6	3596585	3596590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9621	NC_011831	GCT	2	6	3597314	3597319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9622	NC_011831	ACC	2	6	3597404	3597409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9623	NC_011831	CGG	2	6	3597420	3597425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9624	NC_011831	CAC	2	6	3597524	3597529	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9625	NC_011831	GTGCC	2	10	3597546	3597555	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
9626	NC_011831	GCC	2	6	3597715	3597720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9627	NC_011831	CGG	2	6	3597734	3597739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9628	NC_011831	GT	3	6	3597777	3597782	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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