MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Chloroflexus aggregans DSM 9485 chromosome

Total Repeats: 12718

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011831	GCA	2	6	247501	247506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_011831	AAT	2	6	247621	247626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_011831	TGT	2	6	247658	247663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
504	NC_011831	AGA	2	6	247710	247715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
505	NC_011831	ATGCG	2	10	247730	247739	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
506	NC_011831	AAC	2	6	247796	247801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_011831	TG	3	6	248807	248812	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
508	NC_011831	TCA	2	6	248823	248828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_011831	GCA	2	6	250288	250293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_011831	CTG	2	6	250401	250406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_011831	AAT	2	6	250452	250457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_011831	TG	3	6	250542	250547	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
513	NC_011831	ACC	2	6	250581	250586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
514	NC_011831	AAAT	2	8	250731	250738	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_011831	CGG	2	6	250739	250744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_011831	GCA	2	6	250808	250813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_011831	A	7	7	250855	250861	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_011831	ATC	2	6	251035	251040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_011831	CGA	2	6	251067	251072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_011831	GAC	2	6	251084	251089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_011831	CA	3	6	252436	252441	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
522	NC_011831	GCCT	2	8	253632	253639	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
523	NC_011831	CTC	2	6	254826	254831	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
524	NC_011831	TGA	2	6	254834	254839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
525	NC_011831	TAT	2	6	254867	254872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_011831	TG	3	6	254889	254894	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
527	NC_011831	CGA	2	6	259198	259203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_011831	TCCT	2	8	260901	260908	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
529	NC_011831	GGC	2	6	260914	260919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_011831	CGC	2	6	260947	260952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
531	NC_011831	ACC	2	6	261448	261453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
532	NC_011831	TAT	2	6	261503	261508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_011831	ACG	2	6	261553	261558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_011831	TTA	2	6	263114	263119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_011831	TGC	2	6	263187	263192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_011831	TTCG	2	8	263214	263221	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
537	NC_011831	GCA	2	6	263242	263247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_011831	GCA	2	6	263298	263303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_011831	CTG	2	6	263307	263312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_011831	AGA	2	6	263899	263904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
541	NC_011831	TGTT	2	8	269065	269072	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
542	NC_011831	TCA	2	6	270371	270376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_011831	AGT	2	6	271671	271676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
544	NC_011831	T	7	7	271685	271691	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_011831	GGA	2	6	271705	271710	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
546	NC_011831	CCG	2	6	271781	271786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
547	NC_011831	AGT	2	6	271905	271910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
548	NC_011831	GGA	2	6	271938	271943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
549	NC_011831	CCG	2	6	272014	272019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
550	NC_011831	CCA	2	6	272118	272123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
551	NC_011831	CCG	2	6	272141	272146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
552	NC_011831	AGT	2	6	272203	272208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
553	NC_011831	GGA	2	6	272236	272241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
554	NC_011831	CGG	2	6	272307	272312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_011831	CCG	2	6	272472	272477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
556	NC_011831	CCA	2	6	272576	272581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
557	NC_011831	CCG	2	6	272599	272604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
558	NC_011831	AGT	2	6	272738	272743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
559	NC_011831	GGA	2	6	272771	272776	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
560	NC_011831	CCG	2	6	272847	272852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
561	NC_011831	AGT	2	6	272971	272976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
562	NC_011831	GGA	2	6	273004	273009	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
563	NC_011831	GT	3	6	274713	274718	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
564	NC_011831	GA	3	6	280804	280809	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
565	NC_011831	GTA	2	6	281539	281544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
566	NC_011831	TAC	2	6	281572	281577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_011831	GAA	2	6	281601	281606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
568	NC_011831	AAGC	2	8	281663	281670	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
569	NC_011831	CGG	2	6	281698	281703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_011831	TGG	2	6	282657	282662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
571	NC_011831	TGA	2	6	285080	285085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
572	NC_011831	AC	3	6	285137	285142	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
573	NC_011831	GTT	2	6	287042	287047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
574	NC_011831	TCCG	2	8	287081	287088	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
575	NC_011831	AAC	2	6	289312	289317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_011831	CAGG	2	8	289440	289447	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
577	NC_011831	AGT	2	6	289498	289503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
578	NC_011831	GAG	2	6	289587	289592	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
579	NC_011831	AGGT	2	8	293889	293896	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
580	NC_011831	CCA	2	6	293910	293915	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
581	NC_011831	T	6	6	293951	293956	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_011831	AGTA	2	8	294054	294061	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
583	NC_011831	A	6	6	294083	294088	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_011831	A	7	7	294094	294100	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_011831	AGGC	2	8	294129	294136	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
586	NC_011831	CGG	2	6	294139	294144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_011831	AGG	3	9	294194	294202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
588	NC_011831	AAG	2	6	296514	296519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
589	NC_011831	TTG	2	6	296527	296532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
590	NC_011831	AAG	2	6	296597	296602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
591	NC_011831	GCG	2	6	298602	298607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_011831	CAG	2	6	298608	298613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_011831	ACA	2	6	299154	299159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_011831	GCAA	2	8	299220	299227	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
595	NC_011831	AACG	2	8	299245	299252	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
596	NC_011831	TAT	2	6	303161	303166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_011831	A	6	6	303182	303187	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_011831	TGT	2	6	303673	303678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
599	NC_011831	GCC	2	6	303748	303753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
600	NC_011831	GCT	2	6	303754	303759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_011831	CAA	2	6	303782	303787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_011831	AG	3	6	303805	303810	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
603	NC_011831	ATT	2	6	304340	304345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_011831	GAG	2	6	304349	304354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
605	NC_011831	TG	3	6	304399	304404	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
606	NC_011831	GA	3	6	304414	304419	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
607	NC_011831	TCG	2	6	304945	304950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_011831	CTT	2	6	304951	304956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_011831	TGC	2	6	305079	305084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_011831	AGCG	2	8	309154	309161	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
611	NC_011831	TTGC	2	8	309175	309182	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
612	NC_011831	GAA	2	6	309214	309219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
613	NC_011831	TTGC	2	8	311237	311244	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
614	NC_011831	TCC	2	6	313863	313868	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
615	NC_011831	TGC	2	6	313893	313898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_011831	ATG	2	6	314619	314624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
617	NC_011831	TTA	2	6	314688	314693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_011831	TGCCG	2	10	314763	314772	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
619	NC_011831	TACT	2	8	321309	321316	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
620	NC_011831	GAA	2	6	324592	324597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
621	NC_011831	CGG	2	6	324604	324609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_011831	CG	3	6	324640	324645	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
623	NC_011831	TAT	2	6	324650	324655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_011831	TCAT	2	8	324786	324793	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
625	NC_011831	TA	3	6	324808	324813	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_011831	ACA	2	6	329584	329589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_011831	GCT	2	6	329695	329700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_011831	ATCT	2	8	331621	331628	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
629	NC_011831	CGG	2	6	331643	331648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_011831	TG	3	6	332874	332879	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
631	NC_011831	TCT	2	6	332908	332913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_011831	GAG	2	6	332935	332940	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
633	NC_011831	GTC	2	6	334250	334255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_011831	TAC	2	6	334270	334275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_011831	CTA	2	6	334904	334909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_011831	ACGA	2	8	334926	334933	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
637	NC_011831	CTC	2	6	336333	336338	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
638	NC_011831	TTG	2	6	336355	336360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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650	NC_011831	CATTG	2	10	339198	339207	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
651	NC_011831	GC	4	8	339232	339239	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
652	NC_011831	CTC	2	6	343197	343202	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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660	NC_011831	CGG	2	6	343531	343536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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673	NC_011831	GAT	2	6	349543	349548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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682	NC_011831	GCG	2	6	358592	358597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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769	NC_011831	TCA	2	6	406980	406985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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911	NC_011831	CG	3	6	485343	485348	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
912	NC_011831	CGG	2	6	485362	485367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
913	NC_011831	GGA	2	6	485384	485389	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
914	NC_011831	CGG	2	6	485448	485453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
915	NC_011831	CTC	2	6	487517	487522	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
916	NC_011831	A	6	6	487541	487546	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
917	NC_011831	CCT	2	6	488207	488212	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
918	NC_011831	GTCA	2	8	488235	488242	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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920	NC_011831	GGA	2	6	488279	488284	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
921	NC_011831	GGA	2	6	488290	488295	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
922	NC_011831	GTC	2	6	488307	488312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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924	NC_011831	GC	3	6	489461	489466	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
925	NC_011831	AGG	2	6	489512	489517	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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927	NC_011831	GAA	2	6	495251	495256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
928	NC_011831	ATC	2	6	496402	496407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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930	NC_011831	TCCT	2	8	497275	497282	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
931	NC_011831	AGC	2	6	501537	501542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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933	NC_011831	CAG	2	6	501577	501582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
934	NC_011831	ACA	2	6	501591	501596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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939	NC_011831	TTAC	2	8	503242	503249	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
940	NC_011831	TTCA	2	8	503256	503263	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
941	NC_011831	GA	3	6	503332	503337	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
942	NC_011831	GTT	2	6	503354	503359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
943	NC_011831	GAG	2	6	503373	503378	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
944	NC_011831	TAC	2	6	503381	503386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
945	NC_011831	CAA	2	6	506747	506752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
946	NC_011831	CGG	2	6	506771	506776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
947	NC_011831	GCG	2	6	506809	506814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
948	NC_011831	GA	3	6	508398	508403	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
949	NC_011831	CTGTA	2	10	508425	508434	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
950	NC_011831	AG	3	6	508455	508460	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
951	NC_011831	TGT	2	6	508473	508478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
952	NC_011831	TAGG	2	8	508512	508519	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
953	NC_011831	AGT	2	6	508520	508525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
954	NC_011831	TAA	2	6	508580	508585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
955	NC_011831	CA	3	6	509707	509712	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
956	NC_011831	AAT	2	6	509770	509775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
957	NC_011831	CCT	2	6	511569	511574	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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959	NC_011831	TTTG	2	8	512819	512826	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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963	NC_011831	AATGCT	2	12	520061	520072	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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971	NC_011831	CTTG	2	8	523679	523686	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
972	NC_011831	GAA	2	6	523768	523773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
973	NC_011831	TAT	2	6	525492	525497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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982	NC_011831	TCG	2	6	534640	534645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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988	NC_011831	CGAGC	2	10	536354	536363	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
989	NC_011831	ACC	2	6	536402	536407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
990	NC_011831	CCG	2	6	536412	536417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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993	NC_011831	GTA	2	6	536591	536596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1000	NC_011831	CAA	2	6	540520	540525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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