MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Chloroflexus aggregans DSM 9485 chromosome

Total Repeats: 12718

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_011831	GGA	2	6	3343082	3343087	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9002	NC_011831	ATT	2	6	3343091	3343096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9003	NC_011831	T	6	6	3343126	3343131	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9004	NC_011831	GTT	2	6	3343132	3343137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9005	NC_011831	TGCA	2	8	3343939	3343946	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9006	NC_011831	GC	3	6	3345049	3345054	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9007	NC_011831	CAT	2	6	3345060	3345065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9008	NC_011831	TG	4	8	3345077	3345084	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9009	NC_011831	CTC	2	6	3345116	3345121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9010	NC_011831	ATG	2	6	3345130	3345135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9011	NC_011831	GCA	2	6	3345170	3345175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9012	NC_011831	GAC	2	6	3347410	3347415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9013	NC_011831	TGA	2	6	3347874	3347879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9014	NC_011831	AT	3	6	3347899	3347904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9015	NC_011831	GGC	2	6	3350106	3350111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9016	NC_011831	ATC	2	6	3350124	3350129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9017	NC_011831	GAAGG	2	10	3350143	3350152	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
9018	NC_011831	CTG	2	6	3350175	3350180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9019	NC_011831	TGC	2	6	3350207	3350212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9020	NC_011831	GCG	2	6	3350228	3350233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9021	NC_011831	CGC	2	6	3350247	3350252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9022	NC_011831	TCA	2	6	3350293	3350298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9023	NC_011831	GGA	2	6	3350306	3350311	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9024	NC_011831	GAT	2	6	3350328	3350333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9025	NC_011831	AAT	2	6	3350349	3350354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9026	NC_011831	CGG	2	6	3350373	3350378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9027	NC_011831	TTC	2	6	3350433	3350438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9028	NC_011831	AGC	2	6	3350470	3350475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9029	NC_011831	GAT	2	6	3350505	3350510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9030	NC_011831	TTC	2	6	3350581	3350586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9031	NC_011831	AC	3	6	3350644	3350649	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9032	NC_011831	ATG	2	6	3350664	3350669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9033	NC_011831	GATAT	2	10	3350805	3350814	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
9034	NC_011831	TGA	2	6	3350819	3350824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9035	NC_011831	ATC	2	6	3351064	3351069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9036	NC_011831	GCG	2	6	3351133	3351138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9037	NC_011831	CGC	2	6	3351147	3351152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9038	NC_011831	GGC	2	6	3351172	3351177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9039	NC_011831	AGC	2	6	3351546	3351551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9040	NC_011831	TTGA	3	12	3351592	3351603	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9041	NC_011831	TCAA	2	8	3351604	3351611	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9042	NC_011831	GC	3	6	3351683	3351688	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9043	NC_011831	TGCT	2	8	3351779	3351786	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9044	NC_011831	CGG	2	6	3351864	3351869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9045	NC_011831	GACG	2	8	3354310	3354317	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9046	NC_011831	GGA	2	6	3357402	3357407	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9047	NC_011831	GTT	2	6	3358472	3358477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9048	NC_011831	A	6	6	3359384	3359389	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9049	NC_011831	GC	3	6	3359473	3359478	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9050	NC_011831	TCT	2	6	3359514	3359519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9051	NC_011831	ACC	2	6	3359595	3359600	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9052	NC_011831	TGA	2	6	3359643	3359648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9053	NC_011831	CG	3	6	3359659	3359664	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9054	NC_011831	GAC	2	6	3359757	3359762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9055	NC_011831	TC	3	6	3359870	3359875	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9056	NC_011831	GCC	2	6	3359907	3359912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9057	NC_011831	GCC	2	6	3359951	3359956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9058	NC_011831	GGC	2	6	3359960	3359965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9059	NC_011831	AGC	2	6	3359990	3359995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9060	NC_011831	GCA	2	6	3360030	3360035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9061	NC_011831	CTACC	2	10	3360036	3360045	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
9062	NC_011831	CCG	2	6	3360071	3360076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9063	NC_011831	CTA	2	6	3360087	3360092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9064	NC_011831	C	6	6	3360135	3360140	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
9065	NC_011831	TTC	2	6	3360164	3360169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9066	NC_011831	ACC	2	6	3360236	3360241	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9067	NC_011831	CTC	2	6	3360257	3360262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9068	NC_011831	CGTTG	2	10	3360324	3360333	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
9069	NC_011831	TGC	2	6	3360352	3360357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9070	NC_011831	TCA	2	6	3360409	3360414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9071	NC_011831	AAT	2	6	3360422	3360427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9072	NC_011831	GCATT	2	10	3360446	3360455	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
9073	NC_011831	TGGC	2	8	3360526	3360533	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9074	NC_011831	CCG	2	6	3360601	3360606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9075	NC_011831	TGC	2	6	3360652	3360657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9076	NC_011831	TAT	2	6	3360670	3360675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9077	NC_011831	AT	3	6	3360722	3360727	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9078	NC_011831	CGG	2	6	3360742	3360747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9079	NC_011831	GTC	3	9	3360756	3360764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9080	NC_011831	ATG	2	6	3360776	3360781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9081	NC_011831	CTG	2	6	3360909	3360914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9082	NC_011831	ATCT	2	8	3360929	3360936	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9083	NC_011831	CGA	2	6	3360969	3360974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9084	NC_011831	CGTTT	2	10	3361140	3361149	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
9085	NC_011831	CGG	3	9	3361291	3361299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9086	NC_011831	ACT	2	6	3361430	3361435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9087	NC_011831	ACCGC	2	10	3361466	3361475	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
9088	NC_011831	CAC	2	6	3361558	3361563	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9089	NC_011831	TGA	2	6	3361584	3361589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9090	NC_011831	GCT	2	6	3361634	3361639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9091	NC_011831	ATCA	2	8	3361754	3361761	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9092	NC_011831	CCG	2	6	3361773	3361778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9093	NC_011831	GCC	2	6	3361805	3361810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9094	NC_011831	TCGC	2	8	3361911	3361918	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9095	NC_011831	AGC	2	6	3361972	3361977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9096	NC_011831	GCG	2	6	3362000	3362005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9097	NC_011831	GCG	2	6	3362010	3362015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9098	NC_011831	AG	3	6	3363586	3363591	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9099	NC_011831	GAT	2	6	3363657	3363662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9100	NC_011831	TAA	2	6	3363674	3363679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9101	NC_011831	AGG	2	6	3363711	3363716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9102	NC_011831	GCC	2	6	3363786	3363791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9103	NC_011831	AGG	2	6	3363818	3363823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9104	NC_011831	GAC	2	6	3364115	3364120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9105	NC_011831	TAG	2	6	3364162	3364167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9106	NC_011831	CTA	2	6	3364187	3364192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9107	NC_011831	GAG	2	6	3364205	3364210	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9108	NC_011831	A	6	6	3365609	3365614	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9109	NC_011831	ACCTC	2	10	3367074	3367083	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
9110	NC_011831	GCT	2	6	3367160	3367165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9111	NC_011831	CTT	2	6	3367992	3367997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9112	NC_011831	GTG	2	6	3368015	3368020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9113	NC_011831	TAT	2	6	3368023	3368028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9114	NC_011831	TCA	2	6	3368046	3368051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9115	NC_011831	T	6	6	3368085	3368090	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9116	NC_011831	TCA	2	6	3368106	3368111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9117	NC_011831	GGA	2	6	3373838	3373843	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9118	NC_011831	AGG	2	6	3375693	3375698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9119	NC_011831	GTG	2	6	3376468	3376473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9120	NC_011831	CAT	2	6	3376494	3376499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9121	NC_011831	TTG	2	6	3378034	3378039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9122	NC_011831	CGA	2	6	3378041	3378046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9123	NC_011831	CTC	2	6	3378911	3378916	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9124	NC_011831	TGTA	2	8	3378948	3378955	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9125	NC_011831	ATT	2	6	3390127	3390132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9126	NC_011831	GGGA	2	8	3390138	3390145	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
9127	NC_011831	GTT	2	6	3390181	3390186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9128	NC_011831	TGG	2	6	3390204	3390209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9129	NC_011831	GTT	2	6	3390236	3390241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9130	NC_011831	GTC	2	6	3392341	3392346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9131	NC_011831	TGAT	2	8	3392428	3392435	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9132	NC_011831	GC	3	6	3393475	3393480	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9133	NC_011831	AGT	2	6	3397154	3397159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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9143	NC_011831	T	6	6	3406137	3406142	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9151	NC_011831	TTC	2	6	3412726	3412731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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9251	NC_011831	GAG	2	6	3448469	3448474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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9256	NC_011831	GT	3	6	3449519	3449524	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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