MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Chloroflexus aggregans DSM 9485 chromosome

Total Repeats: 12718

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_011831	GC	3	6	3182785	3182790	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8502	NC_011831	GCGCG	2	10	3182866	3182875	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
8503	NC_011831	GCGCG	2	10	3182953	3182962	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
8504	NC_011831	GCGCG	2	10	3183041	3183050	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
8505	NC_011831	CGC	2	6	3183132	3183137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8506	NC_011831	GC	3	6	3183136	3183141	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8507	NC_011831	GCGCG	2	10	3183217	3183226	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
8508	NC_011831	GCGCG	2	10	3183305	3183314	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
8509	NC_011831	C	6	6	3183400	3183405	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8510	NC_011831	TGCA	2	8	3183412	3183419	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8511	NC_011831	TCA	2	6	3183516	3183521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8512	NC_011831	TTC	3	9	3183530	3183538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8513	NC_011831	T	6	6	3183550	3183555	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8514	NC_011831	GT	3	6	3183589	3183594	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8515	NC_011831	TAG	2	6	3183598	3183603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8516	NC_011831	TTA	2	6	3183610	3183615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8517	NC_011831	AT	3	6	3183662	3183667	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8518	NC_011831	GTT	2	6	3183680	3183685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8519	NC_011831	TGT	2	6	3183707	3183712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8520	NC_011831	CCG	2	6	3183861	3183866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8521	NC_011831	CGC	2	6	3183883	3183888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8522	NC_011831	GC	3	6	3183887	3183892	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8523	NC_011831	GCGCG	2	10	3183968	3183977	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
8524	NC_011831	GCGCG	2	10	3184056	3184065	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
8525	NC_011831	GCGCG	2	10	3184144	3184153	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
8526	NC_011831	CCA	2	6	3184261	3184266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8527	NC_011831	GTC	2	6	3184286	3184291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8528	NC_011831	GTC	2	6	3184299	3184304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8529	NC_011831	CGC	2	6	3184343	3184348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8530	NC_011831	ACC	3	9	3186544	3186552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8531	NC_011831	TGG	2	6	3186646	3186651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8532	NC_011831	GCA	2	6	3186717	3186722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8533	NC_011831	TGG	2	6	3186882	3186887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8534	NC_011831	GCC	2	6	3186893	3186898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8535	NC_011831	CCG	2	6	3186928	3186933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8536	NC_011831	CAA	2	6	3186940	3186945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8537	NC_011831	CAA	2	6	3187000	3187005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8538	NC_011831	CGA	2	6	3187053	3187058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8539	NC_011831	TTCG	2	8	3190095	3190102	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8540	NC_011831	ACG	2	6	3190151	3190156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8541	NC_011831	ATG	2	6	3190165	3190170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8542	NC_011831	TGA	2	6	3190249	3190254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8543	NC_011831	CAC	2	6	3194784	3194789	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8544	NC_011831	A	6	6	3194811	3194816	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8545	NC_011831	GGC	2	6	3194848	3194853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8546	NC_011831	CA	4	8	3194891	3194898	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8547	NC_011831	TAC	2	6	3194912	3194917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8548	NC_011831	CGA	2	6	3199689	3199694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8549	NC_011831	CGTT	2	8	3199698	3199705	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8550	NC_011831	GGA	3	9	3199726	3199734	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8551	NC_011831	ATGT	2	8	3200659	3200666	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8552	NC_011831	TG	3	6	3200675	3200680	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8553	NC_011831	GTA	2	6	3200862	3200867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8554	NC_011831	GTA	2	6	3201928	3201933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8555	NC_011831	TC	3	6	3201973	3201978	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8556	NC_011831	TGT	2	6	3201989	3201994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8557	NC_011831	CTC	2	6	3205085	3205090	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8558	NC_011831	TCA	2	6	3206244	3206249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8559	NC_011831	TGA	2	6	3206259	3206264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8560	NC_011831	ACA	2	6	3207326	3207331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8561	NC_011831	TGT	2	6	3207338	3207343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8562	NC_011831	GAG	2	6	3207392	3207397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8563	NC_011831	AAC	2	6	3208938	3208943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8564	NC_011831	TC	3	6	3211248	3211253	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8565	NC_011831	TGC	2	6	3211298	3211303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8566	NC_011831	CTTTC	2	10	3212431	3212440	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
8567	NC_011831	GTT	2	6	3212462	3212467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8568	NC_011831	TAC	2	6	3212475	3212480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8569	NC_011831	CGAG	2	8	3213228	3213235	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8570	NC_011831	TC	3	6	3213254	3213259	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8571	NC_011831	GT	3	6	3216169	3216174	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8572	NC_011831	TGA	2	6	3216204	3216209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8573	NC_011831	TGG	2	6	3216212	3216217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8574	NC_011831	TTCA	2	8	3216228	3216235	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8575	NC_011831	CATA	2	8	3216292	3216299	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8576	NC_011831	TGA	2	6	3216305	3216310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8577	NC_011831	GTA	2	6	3216312	3216317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8578	NC_011831	TG	3	6	3216318	3216323	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8579	NC_011831	CTT	2	6	3216340	3216345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8580	NC_011831	CTG	2	6	3221959	3221964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8581	NC_011831	CA	3	6	3221976	3221981	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8582	NC_011831	CAAAT	2	10	3223761	3223770	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
8583	NC_011831	AGT	2	6	3223779	3223784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8584	NC_011831	GTCG	2	8	3223809	3223816	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8585	NC_011831	GA	3	6	3223844	3223849	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8586	NC_011831	T	7	7	3223869	3223875	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8587	NC_011831	TA	3	6	3223912	3223917	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8588	NC_011831	AC	3	6	3223927	3223932	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8589	NC_011831	GCG	2	6	3223980	3223985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8590	NC_011831	GGCT	2	8	3223998	3224005	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8591	NC_011831	GAG	2	6	3224226	3224231	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8592	NC_011831	GGCC	2	8	3224421	3224428	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8593	NC_011831	CAG	2	6	3224454	3224459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8594	NC_011831	CTG	2	6	3224465	3224470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8595	NC_011831	GCT	2	6	3224501	3224506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8596	NC_011831	A	6	6	3224523	3224528	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8597	NC_011831	GA	3	6	3224563	3224568	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8598	NC_011831	GTT	2	6	3224569	3224574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8599	NC_011831	GCG	2	6	3224579	3224584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8600	NC_011831	CCG	2	6	3224593	3224598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8601	NC_011831	TCG	2	6	3224627	3224632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8602	NC_011831	GA	3	6	3224652	3224657	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8603	NC_011831	GGT	2	6	3226006	3226011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8604	NC_011831	AG	3	6	3226071	3226076	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8605	NC_011831	GAC	2	6	3228316	3228321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8606	NC_011831	GTT	2	6	3228362	3228367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8607	NC_011831	GCA	2	6	3228516	3228521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8608	NC_011831	GCG	2	6	3228560	3228565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8609	NC_011831	TCAA	2	8	3228608	3228615	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8610	NC_011831	CGA	2	6	3228636	3228641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8611	NC_011831	TCT	2	6	3228642	3228647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8612	NC_011831	TTG	2	6	3228651	3228656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8613	NC_011831	CAA	2	6	3228670	3228675	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8614	NC_011831	A	6	6	3228674	3228679	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8615	NC_011831	GCA	2	6	3228706	3228711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8616	NC_011831	TTTG	2	8	3229170	3229177	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8617	NC_011831	ATC	2	6	3229187	3229192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8618	NC_011831	AC	4	8	3229224	3229231	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8619	NC_011831	GATACC	2	12	3229316	3229327	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8620	NC_011831	ATTT	2	8	3229347	3229354	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8621	NC_011831	AT	3	6	3229373	3229378	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8622	NC_011831	ATT	2	6	3229383	3229388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8623	NC_011831	TAAT	2	8	3229392	3229399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8624	NC_011831	AAG	2	6	3229407	3229412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8625	NC_011831	CGA	2	6	3229436	3229441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8626	NC_011831	TCC	2	6	3229448	3229453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8627	NC_011831	GA	3	6	3229466	3229471	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8628	NC_011831	GAG	2	6	3229478	3229483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8629	NC_011831	GTC	2	6	3229490	3229495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8631	NC_011831	CTGC	2	8	3234171	3234178	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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