MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Chloroflexus aggregans DSM 9485 chromosome

Total Repeats: 12718

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_011831	CGATAA	2	12	2435582	2435593	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6502	NC_011831	GTT	2	6	2435622	2435627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6503	NC_011831	TAC	2	6	2435647	2435652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6504	NC_011831	TGA	2	6	2435726	2435731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6505	NC_011831	ACG	2	6	2435737	2435742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6506	NC_011831	AGGC	2	8	2435771	2435778	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6507	NC_011831	GAC	2	6	2438284	2438289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6508	NC_011831	CGC	2	6	2439527	2439532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6509	NC_011831	CTG	2	6	2443955	2443960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6510	NC_011831	ACA	2	6	2443969	2443974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6511	NC_011831	TGA	2	6	2444077	2444082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6512	NC_011831	GTA	2	6	2444100	2444105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6513	NC_011831	CCG	2	6	2444155	2444160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6514	NC_011831	CGT	2	6	2444202	2444207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6515	NC_011831	CGGA	2	8	2444234	2444241	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6516	NC_011831	GTAT	2	8	2444281	2444288	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6517	NC_011831	AACC	2	8	2444353	2444360	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6518	NC_011831	CCT	2	6	2445542	2445547	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6519	NC_011831	CGA	2	6	2445641	2445646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6520	NC_011831	TGA	2	6	2447083	2447088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6521	NC_011831	TATCG	2	10	2447092	2447101	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
6522	NC_011831	TCT	2	6	2447166	2447171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6523	NC_011831	TTCT	2	8	2447239	2447246	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6524	NC_011831	AG	3	6	2447252	2447257	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6525	NC_011831	GAT	2	6	2449659	2449664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6526	NC_011831	GAT	2	6	2451115	2451120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6527	NC_011831	T	6	6	2451242	2451247	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6528	NC_011831	GCCA	2	8	2451254	2451261	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6529	NC_011831	GCA	2	6	2451316	2451321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6530	NC_011831	GCG	2	6	2451393	2451398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6531	NC_011831	G	6	6	2451415	2451420	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6532	NC_011831	TCCC	3	12	2451442	2451453	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
6533	NC_011831	CAA	2	6	2451526	2451531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6534	NC_011831	A	7	7	2451530	2451536	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6535	NC_011831	GT	3	6	2451572	2451577	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6536	NC_011831	AGC	2	6	2451596	2451601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6537	NC_011831	CCAA	2	8	2451609	2451616	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6538	NC_011831	GATAA	2	10	2451703	2451712	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
6539	NC_011831	AC	3	6	2454735	2454740	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6540	NC_011831	TGA	2	6	2454744	2454749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6541	NC_011831	T	6	6	2454780	2454785	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6542	NC_011831	GCT	2	6	2454812	2454817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6543	NC_011831	GTT	2	6	2454821	2454826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6544	NC_011831	TCC	2	6	2466548	2466553	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6545	NC_011831	ACTGAG	2	12	2466613	2466624	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6546	NC_011831	TTTA	2	8	2466714	2466721	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6547	NC_011831	CAT	2	6	2466735	2466740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6548	NC_011831	AAT	2	6	2466764	2466769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6549	NC_011831	TGT	2	6	2466852	2466857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6550	NC_011831	TCA	2	6	2466859	2466864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6551	NC_011831	GGCC	2	8	2469739	2469746	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6552	NC_011831	GGAA	2	8	2472225	2472232	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6553	NC_011831	GTT	2	6	2472242	2472247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6554	NC_011831	TCA	2	6	2474344	2474349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6555	NC_011831	GCA	2	6	2474395	2474400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6556	NC_011831	GTT	2	6	2474425	2474430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6557	NC_011831	GTT	2	6	2474455	2474460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6558	NC_011831	CCG	2	6	2474499	2474504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6559	NC_011831	T	6	6	2474521	2474526	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6560	NC_011831	AAGG	2	8	2475367	2475374	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6561	NC_011831	CCCTT	2	10	2475393	2475402	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
6562	NC_011831	CAGG	2	8	2475413	2475420	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6563	NC_011831	TCTG	2	8	2477069	2477076	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6564	NC_011831	GAAGC	2	10	2477150	2477159	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
6565	NC_011831	CTT	2	6	2477205	2477210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6566	NC_011831	TCG	2	6	2477257	2477262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6567	NC_011831	CAA	2	6	2477346	2477351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6568	NC_011831	GGA	2	6	2477352	2477357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6569	NC_011831	GAAT	2	8	2477402	2477409	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6570	NC_011831	TGG	2	6	2481091	2481096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6571	NC_011831	TAC	2	6	2481161	2481166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6572	NC_011831	AGG	2	6	2481202	2481207	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6573	NC_011831	CAA	2	6	2481649	2481654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6574	NC_011831	GCACG	2	10	2481670	2481679	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6575	NC_011831	GGC	2	6	2481790	2481795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6576	NC_011831	CAA	2	6	2481801	2481806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6577	NC_011831	GCACG	2	10	2481822	2481831	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6578	NC_011831	CAA	2	6	2481906	2481911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6579	NC_011831	GCACG	2	10	2481927	2481936	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6580	NC_011831	AGG	2	6	2482005	2482010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6581	NC_011831	ACA	2	6	2482055	2482060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6582	NC_011831	TTG	2	6	2483112	2483117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6583	NC_011831	CGA	2	6	2483151	2483156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6584	NC_011831	ATGCG	2	10	2483782	2483791	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
6585	NC_011831	GC	3	6	2483847	2483852	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6586	NC_011831	CAA	2	6	2483878	2483883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6587	NC_011831	T	6	6	2484030	2484035	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6588	NC_011831	TTG	2	6	2484076	2484081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6589	NC_011831	GTT	2	6	2484106	2484111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6590	NC_011831	GAA	2	6	2484164	2484169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6591	NC_011831	TAA	2	6	2484193	2484198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6592	NC_011831	TGT	2	6	2484232	2484237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6593	NC_011831	CAAGT	2	10	2484277	2484286	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6594	NC_011831	GGC	2	6	2484314	2484319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6595	NC_011831	AACG	2	8	2485229	2485236	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6596	NC_011831	CGA	2	6	2485295	2485300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6597	NC_011831	TTA	2	6	2487949	2487954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6598	NC_011831	ATT	2	6	2487960	2487965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6599	NC_011831	ATA	2	6	2487985	2487990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6600	NC_011831	GA	3	6	2488110	2488115	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6601	NC_011831	AAC	2	6	2488143	2488148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6602	NC_011831	AGCC	2	8	2488858	2488865	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6603	NC_011831	GCG	2	6	2488918	2488923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6604	NC_011831	GGA	2	6	2489003	2489008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6605	NC_011831	GAT	2	6	2489012	2489017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6606	NC_011831	GGC	2	6	2489030	2489035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6607	NC_011831	ATT	2	6	2490266	2490271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6608	NC_011831	GT	3	6	2490278	2490283	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6609	NC_011831	ATC	2	6	2490302	2490307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6610	NC_011831	GCA	2	6	2490312	2490317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6611	NC_011831	TGG	2	6	2490447	2490452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6612	NC_011831	TCCC	2	8	2490474	2490481	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
6613	NC_011831	GAGGGA	2	12	2490487	2490498	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6614	NC_011831	GA	3	6	2490502	2490507	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6615	NC_011831	GA	4	8	2490539	2490546	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6616	NC_011831	CCT	2	6	2491362	2491367	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6617	NC_011831	CCG	2	6	2491454	2491459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6618	NC_011831	T	6	6	2491462	2491467	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6619	NC_011831	TGG	2	6	2491516	2491521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6620	NC_011831	TC	4	8	2491524	2491531	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6621	NC_011831	GCG	2	6	2491548	2491553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6622	NC_011831	ATA	2	6	2491564	2491569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6623	NC_011831	GCA	2	6	2491577	2491582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6624	NC_011831	GAG	2	6	2491605	2491610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6625	NC_011831	GCA	2	6	2493230	2493235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6626	NC_011831	TCGG	2	8	2494242	2494249	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6627	NC_011831	TAT	2	6	2494277	2494282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6628	NC_011831	ATT	2	6	2497500	2497505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6629	NC_011831	GAC	2	6	2501046	2501051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6630	NC_011831	CGG	2	6	2501070	2501075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6631	NC_011831	C	6	6	2501087	2501092	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6632	NC_011831	GCC	2	6	2503048	2503053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6633	NC_011831	AGG	2	6	2503146	2503151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6634	NC_011831	ACAG	2	8	2504245	2504252	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6635	NC_011831	TCA	2	6	2504286	2504291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6645	NC_011831	TTCCTC	2	12	2509534	2509545	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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