MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7424 plasmid pP742401

Total Repeats: 1727

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_011738	A	7	7	282156	282162	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_011738	CATT	2	8	282193	282200	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1503	NC_011738	T	6	6	282222	282227	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_011738	CTT	2	6	282262	282267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1505	NC_011738	CTC	2	6	282277	282282	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1506	NC_011738	TTTTGC	2	12	282329	282340	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1507	NC_011738	TTC	2	6	282443	282448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1508	NC_011738	CAA	2	6	282462	282467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1509	NC_011738	GAATT	2	10	282468	282477	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_011738	CTT	2	6	283409	283414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1511	NC_011738	TAT	2	6	283418	283423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_011738	ATA	2	6	283458	283463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_011738	TTGT	2	8	283562	283569	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_011738	CGA	2	6	283585	283590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1515	NC_011738	TAA	2	6	283608	283613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_011738	ATT	2	6	283640	283645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_011738	TAT	2	6	283657	283662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_011738	CGG	2	6	283697	283702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1519	NC_011738	AAC	2	6	283747	283752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_011738	TAA	2	6	283781	283786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_011738	TA	3	6	283849	283854	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_011738	A	6	6	283966	283971	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_011738	AAGT	2	8	283974	283981	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_011738	ATT	2	6	284007	284012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_011738	T	9	9	284011	284019	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_011738	CAA	2	6	284024	284029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1527	NC_011738	A	10	10	284048	284057	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_011738	TA	3	6	284068	284073	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_011738	TGA	2	6	284102	284107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_011738	A	7	7	284107	284113	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_011738	TTA	2	6	284162	284167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_011738	GAA	2	6	284212	284217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_011738	ATTGA	2	10	284228	284237	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_011738	AAAAG	2	10	285036	285045	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_011738	A	9	9	285048	285056	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_011738	TA	3	6	286072	286077	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_011738	TATAA	2	10	286132	286141	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_011738	TCT	2	6	286188	286193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1539	NC_011738	T	6	6	286214	286219	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_011738	TAA	2	6	286241	286246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_011738	ATTT	2	8	286266	286273	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_011738	TAA	2	6	286289	286294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_011738	TGA	2	6	286331	286336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_011738	TAT	2	6	286389	286394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_011738	TCC	2	6	286396	286401	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1546	NC_011738	A	6	6	286444	286449	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_011738	CTC	2	6	286480	286485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1548	NC_011738	AGG	2	6	286508	286513	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_011738	T	6	6	289999	290004	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_011738	AG	3	6	291236	291241	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_011738	AT	3	6	291266	291271	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_011738	A	7	7	292572	292578	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_011738	TCAA	2	8	292583	292590	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1554	NC_011738	TAA	2	6	293890	293895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_011738	AAT	2	6	293901	293906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_011738	TA	4	8	294623	294630	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_011738	T	6	6	294633	294638	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_011738	AAC	2	6	294644	294649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1559	NC_011738	A	9	9	294670	294678	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_011738	ATA	2	6	294744	294749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_011738	AAT	2	6	301260	301265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_011738	ATCA	2	8	301338	301345	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1563	NC_011738	CCTAA	2	10	301348	301357	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
1564	NC_011738	CAA	2	6	304623	304628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1565	NC_011738	T	6	6	304637	304642	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_011738	GA	3	6	304645	304650	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_011738	ATT	2	6	304719	304724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_011738	A	6	6	309434	309439	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_011738	CATT	2	8	309472	309479	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1570	NC_011738	TTG	2	6	309544	309549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_011738	AAG	2	6	310047	310052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_011738	TGCT	2	8	310980	310987	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1573	NC_011738	AGA	2	6	311015	311020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_011738	CTT	2	6	311064	311069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1575	NC_011738	A	8	8	311108	311115	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_011738	TAG	2	6	311126	311131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_011738	CTC	2	6	311149	311154	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1578	NC_011738	GAAA	2	8	311187	311194	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_011738	AAT	2	6	311255	311260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_011738	GAG	2	6	311298	311303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_011738	CAG	2	6	311310	311315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1582	NC_011738	GAA	2	6	311357	311362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_011738	TGC	2	6	311364	311369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1584	NC_011738	CAA	2	6	311371	311376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1585	NC_011738	AGA	2	6	311416	311421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_011738	A	6	6	311461	311466	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_011738	TTGA	2	8	311511	311518	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_011738	C	6	6	311520	311525	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1589	NC_011738	TTTC	2	8	311544	311551	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1590	NC_011738	ACA	2	6	311583	311588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1591	NC_011738	T	6	6	311589	311594	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_011738	CCT	2	6	311706	311711	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1593	NC_011738	TGG	2	6	311784	311789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_011738	CAT	2	6	311799	311804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1595	NC_011738	C	6	6	311813	311818	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1596	NC_011738	AAT	2	6	311823	311828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_011738	GA	3	6	311835	311840	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_011738	ACAG	2	8	311906	311913	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1599	NC_011738	ACTG	2	8	311921	311928	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1600	NC_011738	GTC	2	6	311941	311946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1601	NC_011738	T	6	6	311969	311974	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_011738	CGG	2	6	312000	312005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1603	NC_011738	AGTG	2	8	312006	312013	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_011738	T	6	6	312099	312104	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_011738	AATT	2	8	312114	312121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_011738	AAG	2	6	312412	312417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_011738	AAG	2	6	313980	313985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_011738	AT	3	6	314015	314020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_011738	ATA	2	6	314078	314083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_011738	A	6	6	314169	314174	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_011738	CAA	2	6	314250	314255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1612	NC_011738	ATAA	2	8	314262	314269	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_011738	T	7	7	314438	314444	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_011738	CTT	2	6	314450	314455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1615	NC_011738	TGC	2	6	314477	314482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1616	NC_011738	TTG	2	6	314580	314585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_011738	TTC	2	6	314628	314633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1618	NC_011738	TCA	2	6	314642	314647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1619	NC_011738	G	6	6	314651	314656	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_011738	AACTT	2	10	314663	314672	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1621	NC_011738	CCT	2	6	314710	314715	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1622	NC_011738	TTGA	2	8	314747	314754	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_011738	CTTC	2	8	314824	314831	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1624	NC_011738	TCTT	2	8	314855	314862	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1625	NC_011738	CGC	2	6	314876	314881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1626	NC_011738	TGC	2	6	314895	314900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1627	NC_011738	TTC	2	6	314903	314908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1628	NC_011738	CTT	2	6	314969	314974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1629	NC_011738	TTAGT	2	10	314975	314984	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_011738	TAG	2	6	315008	315013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_011738	AG	3	6	315019	315024	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_011738	GAA	2	6	315029	315034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_011738	GTG	2	6	315089	315094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_011738	T	6	6	315133	315138	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_011738	ATAA	2	8	315182	315189	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1636	NC_011738	AGG	2	6	315214	315219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1637	NC_011738	A	6	6	315695	315700	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1639	NC_011738	ATGA	2	8	315815	315822	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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