MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7424 plasmid pP742403

Total Repeats: 126

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011730	TTC	2	6	15	20	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_011730	AT	3	6	80	85	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011730	CGG	2	6	143	148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_011730	ATT	2	6	165	170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011730	AGT	2	6	211	216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011730	T	8	8	298	305	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011730	TTC	2	6	760	765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_011730	AAG	2	6	774	779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011730	TGT	2	6	849	854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011730	TAACT	2	10	1760	1769	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_011730	AGA	2	6	2127	2132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011730	ACAG	2	8	2161	2168	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_011730	AAG	2	6	2199	2204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011730	TCT	2	6	2230	2235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_011730	T	7	7	2353	2359	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011730	ATATA	2	10	3119	3128	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011730	GTTC	2	8	3207	3214	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_011730	CGT	2	6	3274	3279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_011730	TG	3	6	3373	3378	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011730	AAC	2	6	3432	3437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_011730	ACA	2	6	3470	3475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_011730	ACT	2	6	3498	3503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_011730	TCT	2	6	3504	3509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_011730	CAG	2	6	3542	3547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_011730	GAA	2	6	3553	3558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011730	ACA	2	6	3573	3578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_011730	ACA	2	6	3590	3595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_011730	AAG	2	6	3656	3661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011730	CCTA	2	8	3752	3759	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_011730	TTCTA	2	10	4698	4707	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_011730	TAAT	2	8	5122	5129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011730	CGG	2	6	5189	5194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_011730	CTC	2	6	5207	5212	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_011730	CAAAA	2	10	5290	5299	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_011730	GAT	2	6	8815	8820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011730	TGA	2	6	8842	8847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011730	AAT	2	6	8901	8906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011730	TGC	2	6	8910	8915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_011730	CTC	2	6	11822	11827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_011730	T	7	7	11874	11880	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011730	CT	3	6	13910	13915	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_011730	TTA	2	6	13953	13958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011730	CATTT	2	10	13992	14001	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_011730	A	6	6	14019	14024	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011730	TAT	2	6	14029	14034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011730	TA	3	6	14044	14049	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011730	GTT	2	6	14069	14074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011730	GTT	2	6	14168	14173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011730	A	6	6	14217	14222	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011730	GTT	2	6	14225	14230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011730	AATG	2	8	14235	14242	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011730	T	6	6	14284	14289	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011730	T	6	6	14433	14438	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011730	CAG	2	6	14541	14546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_011730	T	6	6	15291	15296	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011730	TTG	2	6	15302	15307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011730	ATT	2	6	15373	15378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011730	TAA	2	6	15381	15386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011730	TTA	2	6	15394	15399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011730	ATTA	2	8	15534	15541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011730	GAAA	2	8	15555	15562	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011730	A	8	8	16937	16944	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011730	TA	3	6	17076	17081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011730	AGC	2	6	17111	17116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_011730	CCCA	2	8	17166	17173	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
66	NC_011730	A	6	6	17547	17552	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011730	ATT	2	6	17559	17564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011730	T	8	8	17563	17570	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011730	T	7	7	17584	17590	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011730	TTAA	2	8	17592	17599	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011730	A	7	7	17598	17604	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011730	TTAA	2	8	17742	17749	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011730	CTT	2	6	17781	17786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_011730	ATT	2	6	17838	17843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011730	TAG	2	6	18813	18818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011730	T	6	6	18843	18848	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011730	AAT	2	6	18857	18862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011730	TTTTG	2	10	18865	18874	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011730	ATTA	2	8	18889	18896	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011730	A	7	7	20174	20180	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011730	T	8	8	20233	20240	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011730	AAT	2	6	20292	20297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011730	TCTT	2	8	20313	20320	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_011730	T	7	7	20319	20325	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011730	AAAAG	2	10	20350	20359	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011730	A	9	9	20388	20396	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011730	CAAG	2	8	20417	20424	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_011730	A	7	7	20430	20436	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011730	A	6	6	20451	20456	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011730	TA	3	6	20461	20466	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011730	A	6	6	20474	20479	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011730	GGA	2	6	20483	20488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011730	TTA	2	6	20500	20505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011730	AAAG	2	8	20517	20524	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011730	T	6	6	20542	20547	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011730	ATCAA	2	10	20548	20557	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_011730	T	6	6	20595	20600	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011730	TTC	2	6	20625	20630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_011730	AAG	2	6	21314	21319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011730	T	6	6	21489	21494	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011730	ATT	2	6	21539	21544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011730	ATC	2	6	21577	21582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_011730	ACA	2	6	21586	21591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_011730	ATCA	2	8	21641	21648	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_011730	T	8	8	21651	21658	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011730	TAG	2	6	21720	21725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011730	T	8	8	21731	21738	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011730	T	9	9	21779	21787	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011730	TATGT	2	10	21796	21805	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011730	ACA	2	6	21819	21824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_011730	T	6	6	22300	22305	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011730	GAT	2	6	22817	22822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011730	AGT	2	6	22827	22832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011730	A	6	6	22864	22869	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011730	TA	3	6	22894	22899	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011730	ACT	2	6	22900	22905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_011730	TGT	2	6	22936	22941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011730	TAGA	2	8	23304	23311	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011730	TTC	2	6	23328	23333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_011730	GCT	2	6	23336	23341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_011730	ATT	2	6	23342	23347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011730	AAC	2	6	23429	23434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_011730	AT	3	6	23442	23447	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011730	ATT	2	6	23455	23460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011730	CTT	2	6	23485	23490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_011730	TTTTG	2	10	25047	25056	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.