MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7424 chromosome

Total Repeats: 25026

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011729	TCT	2	6	9	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_011729	TAT	2	6	29	34	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011729	CCTAA	2	10	40	49	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
4	NC_011729	AGG	2	6	1456	1461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011729	A	6	6	1470	1475	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011729	GTTAA	2	10	1498	1507	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011729	ATTTT	2	10	1515	1524	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011729	T	7	7	1521	1527	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011729	TTGT	2	8	1541	1548	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011729	TAA	2	6	2556	2561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011729	ATCT	2	8	4303	4310	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_011729	TTC	2	6	4323	4328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_011729	CAT	2	6	4343	4348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_011729	CAT	2	6	4407	4412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_011729	T	9	9	4622	4630	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011729	TAA	2	6	4633	4638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011729	A	6	6	4713	4718	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011729	AAG	2	6	4742	4747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011729	TAA	2	6	4795	4800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011729	GAT	2	6	5640	5645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011729	ATA	2	6	5689	5694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011729	GTA	2	6	7281	7286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011729	AATT	2	8	7294	7301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011729	ATA	2	6	7308	7313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011729	AAC	2	6	7426	7431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_011729	AC	3	6	7459	7464	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_011729	AAG	2	6	7470	7475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011729	T	6	6	8889	8894	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011729	AT	3	6	11456	11461	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011729	TTTA	2	8	11463	11470	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011729	CTA	2	6	11509	11514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_011729	GT	3	6	11543	11548	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011729	CTT	2	6	11591	11596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_011729	GTT	2	6	11704	11709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011729	TGA	2	6	11717	11722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011729	GTTTT	2	10	11747	11756	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011729	AAG	2	6	11808	11813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011729	A	7	7	11817	11823	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011729	A	9	9	11828	11836	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011729	CAC	2	6	11852	11857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_011729	TA	3	6	14267	14272	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011729	CTTTA	2	10	14284	14293	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_011729	T	6	6	15244	15249	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011729	A	7	7	15282	15288	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011729	GTT	2	6	15318	15323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011729	C	6	6	15359	15364	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
47	NC_011729	C	6	6	15367	15372	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
48	NC_011729	G	6	6	15380	15385	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011729	G	6	6	15393	15398	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011729	TAGA	2	8	15428	15435	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011729	AT	5	10	15860	15869	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011729	AC	3	6	15936	15941	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_011729	TAA	2	6	16388	16393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011729	ATTTT	2	10	16394	16403	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011729	AC	3	6	16416	16421	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_011729	A	9	9	16442	16450	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011729	ACC	2	6	16463	16468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_011729	ATG	2	6	16501	16506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011729	GAG	2	6	17823	17828	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011729	TTTTC	2	10	17829	17838	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_011729	GT	3	6	17908	17913	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011729	TG	3	6	17940	17945	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011729	ATTAA	2	10	19055	19064	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011729	T	6	6	22748	22753	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011729	AAC	2	6	22847	22852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_011729	A	6	6	22869	22874	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011729	T	9	9	22885	22893	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011729	TCC	2	6	22986	22991	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_011729	TAA	2	6	23019	23024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011729	TTA	2	6	23026	23031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011729	CTA	2	6	23035	23040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_011729	ATG	2	6	26733	26738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011729	TCT	2	6	28894	28899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_011729	T	7	7	28902	28908	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011729	A	8	8	30018	30025	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011729	A	9	9	30206	30214	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011729	ATG	2	6	30245	30250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011729	ATA	2	6	31012	31017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011729	ATTTTA	2	12	31035	31046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011729	GA	3	6	33084	33089	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011729	CTT	2	6	33409	33414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_011729	TATAGT	2	12	33416	33427	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011729	AAG	2	6	33455	33460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011729	T	6	6	33505	33510	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011729	GT	3	6	34440	34445	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011729	TAA	2	6	34446	34451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011729	TTA	2	6	34469	34474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011729	CTGAA	2	10	34512	34521	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_011729	TTG	2	6	34615	34620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011729	ATG	2	6	34639	34644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011729	CT	3	6	34692	34697	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_011729	TGA	2	6	36181	36186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011729	TTGAC	2	10	36273	36282	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
94	NC_011729	ATT	2	6	36293	36298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011729	ATAA	2	8	36905	36912	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011729	TAG	2	6	36989	36994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011729	CCT	2	6	37006	37011	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_011729	CCT	2	6	37035	37040	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_011729	CCT	2	6	37047	37052	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_011729	TCC	2	6	37054	37059	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_011729	CA	3	6	37088	37093	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_011729	ATT	2	6	37123	37128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011729	GTA	2	6	37133	37138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011729	AGA	2	6	37247	37252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011729	GTTT	2	8	37406	37413	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011729	ATA	2	6	37423	37428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011729	TCTCTT	2	12	38277	38288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_011729	TTTCT	2	10	38289	38298	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_011729	AG	3	6	38305	38310	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011729	ATG	2	6	38311	38316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011729	ATT	2	6	38325	38330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011729	TCTT	2	8	38395	38402	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_011729	CTC	2	6	38407	38412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_011729	GGA	2	6	38441	38446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011729	T	6	6	38494	38499	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011729	T	7	7	41373	41379	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011729	AT	3	6	41424	41429	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011729	ATT	2	6	41434	41439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011729	CCT	2	6	41472	41477	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_011729	AGG	2	6	41486	41491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011729	AGG	2	6	41500	41505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011729	AGGA	2	8	41530	41537	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011729	TAAC	2	8	42012	42019	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_011729	CCT	2	6	42024	42029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_011729	CCT	2	6	42031	42036	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_011729	CCT	2	6	42045	42050	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_011729	T	6	6	42549	42554	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011729	AATC	2	8	42656	42663	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_011729	ATT	2	6	42670	42675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011729	A	6	6	42709	42714	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011729	TCT	2	6	42758	42763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_011729	A	6	6	42769	42774	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011729	TAT	2	6	42803	42808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011729	A	6	6	42909	42914	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011729	A	6	6	45662	45667	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011729	AGG	2	6	45689	45694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011729	AAC	2	6	45707	45712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_011729	AATT	2	8	46897	46904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011729	TTAGG	2	10	46910	46919	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011729	AAACT	2	10	46940	46949	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_011729	ATT	3	9	46965	46973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011729	TTTG	2	8	47017	47024	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011729	ATA	2	6	47046	47051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_011729	CCAA	2	8	47110	47117	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_011729	TTA	2	6	47245	47250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_011729	A	6	6	47260	47265	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_011729	AG	3	6	47282	47287	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_011729	AGT	2	6	47310	47315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_011729	T	6	6	47347	47352	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_011729	GAT	2	6	47508	47513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
151	NC_011729	GAT	2	6	47563	47568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_011729	CAC	2	6	47579	47584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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156	NC_011729	A	6	6	47789	47794	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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158	NC_011729	GCGT	2	8	47975	47982	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
159	NC_011729	A	6	6	49184	49189	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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287	NC_011729	CTT	3	9	84570	84578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
288	NC_011729	CAAAC	2	10	84582	84591	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
289	NC_011729	ATC	2	6	84637	84642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
290	NC_011729	TAA	2	6	84739	84744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
291	NC_011729	AT	3	6	84810	84815	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_011729	TTCTTT	2	12	84823	84834	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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