MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 8801 chromosome

Total Repeats: 14746

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_011726	ACT	2	6	2131704	2131709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6502	NC_011726	TTAGT	2	10	2132621	2132630	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
6503	NC_011726	AAT	2	6	2132639	2132644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6504	NC_011726	TTTGT	2	10	2133855	2133864	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
6505	NC_011726	TGCG	2	8	2133884	2133891	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6506	NC_011726	AAT	2	6	2133967	2133972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6507	NC_011726	TGG	2	6	2133997	2134002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6508	NC_011726	TTTA	2	8	2134020	2134027	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6509	NC_011726	ACC	2	6	2134030	2134035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6510	NC_011726	CAA	2	6	2135542	2135547	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6511	NC_011726	GAT	2	6	2135571	2135576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6512	NC_011726	TAATC	2	10	2135581	2135590	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6513	NC_011726	TCTT	2	8	2137193	2137200	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6514	NC_011726	AT	3	6	2137325	2137330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6515	NC_011726	ATT	2	6	2137347	2137352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6516	NC_011726	TTGA	2	8	2137373	2137380	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6517	NC_011726	T	6	6	2137474	2137479	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6518	NC_011726	TAC	2	6	2137505	2137510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6519	NC_011726	ATTA	2	8	2137555	2137562	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6520	NC_011726	CAAT	2	8	2138035	2138042	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6521	NC_011726	AGC	2	6	2138077	2138082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6522	NC_011726	T	7	7	2138083	2138089	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6523	NC_011726	AGG	2	6	2138750	2138755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6524	NC_011726	ATT	2	6	2138785	2138790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6525	NC_011726	T	6	6	2138793	2138798	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6526	NC_011726	AAC	2	6	2138883	2138888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6527	NC_011726	GTT	2	6	2138926	2138931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6528	NC_011726	GTG	2	6	2140025	2140030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6529	NC_011726	TAA	2	6	2140055	2140060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6530	NC_011726	A	6	6	2140095	2140100	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6531	NC_011726	GTT	2	6	2140110	2140115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6532	NC_011726	CAT	2	6	2140133	2140138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6533	NC_011726	AAGC	2	8	2141000	2141007	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6534	NC_011726	GGATG	2	10	2141017	2141026	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
6535	NC_011726	CAA	2	6	2141085	2141090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6536	NC_011726	AT	3	6	2141149	2141154	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6537	NC_011726	A	7	7	2141159	2141165	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6538	NC_011726	TAA	2	6	2141178	2141183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6539	NC_011726	T	6	6	2141299	2141304	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6540	NC_011726	GTT	2	6	2144086	2144091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6541	NC_011726	AAC	2	6	2144092	2144097	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6542	NC_011726	T	6	6	2144105	2144110	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6543	NC_011726	AAT	2	6	2144128	2144133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6544	NC_011726	TTA	2	6	2144146	2144151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6545	NC_011726	T	6	6	2145633	2145638	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6546	NC_011726	AT	3	6	2145656	2145661	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6547	NC_011726	TAT	2	6	2145669	2145674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6548	NC_011726	GATAA	2	10	2145679	2145688	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
6549	NC_011726	AGGGT	2	10	2145694	2145703	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
6550	NC_011726	GT	3	6	2145702	2145707	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6551	NC_011726	GTA	2	6	2145777	2145782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6552	NC_011726	ACG	2	6	2145805	2145810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6553	NC_011726	GTT	2	6	2147818	2147823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6554	NC_011726	AG	3	6	2147853	2147858	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6555	NC_011726	ATT	2	6	2148451	2148456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6556	NC_011726	AGATTT	2	12	2148521	2148532	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6557	NC_011726	ATT	2	6	2148585	2148590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6558	NC_011726	TAA	2	6	2149807	2149812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6559	NC_011726	CGC	2	6	2150406	2150411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6560	NC_011726	TAT	2	6	2151432	2151437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6561	NC_011726	AGC	2	6	2151470	2151475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6562	NC_011726	AAT	2	6	2151477	2151482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6563	NC_011726	TA	3	6	2152328	2152333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6564	NC_011726	AGA	2	6	2152369	2152374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6565	NC_011726	AGA	2	6	2152445	2152450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6566	NC_011726	TAG	2	6	2152999	2153004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6567	NC_011726	TAAA	3	12	2153090	2153101	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6568	NC_011726	TTAT	2	8	2153109	2153116	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6569	NC_011726	AGA	2	6	2153137	2153142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6571	NC_011726	GAG	2	6	2154616	2154621	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6572	NC_011726	TAA	2	6	2154675	2154680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6573	NC_011726	T	6	6	2154765	2154770	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6574	NC_011726	TTG	2	6	2154790	2154795	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6580	NC_011726	A	7	7	2158494	2158500	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6581	NC_011726	T	7	7	2158722	2158728	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6582	NC_011726	TAT	2	6	2158734	2158739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6588	NC_011726	CAAG	2	8	2158918	2158925	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6589	NC_011726	GTATT	2	10	2158946	2158955	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
6590	NC_011726	TG	3	6	2158963	2158968	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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6595	NC_011726	T	6	6	2163179	2163184	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6596	NC_011726	TTCA	2	8	2163205	2163212	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6597	NC_011726	TGT	2	6	2163246	2163251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6599	NC_011726	TAGT	2	8	2163307	2163314	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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6602	NC_011726	T	6	6	2163412	2163417	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6603	NC_011726	CAA	2	6	2163423	2163428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6604	NC_011726	AATG	2	8	2163534	2163541	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6605	NC_011726	AG	3	6	2165295	2165300	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6606	NC_011726	AAT	2	6	2165348	2165353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6607	NC_011726	TC	3	6	2165370	2165375	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6608	NC_011726	CAC	2	6	2165498	2165503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6609	NC_011726	GTT	2	6	2165508	2165513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6610	NC_011726	CAT	2	6	2165774	2165779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6611	NC_011726	TTGA	2	8	2165849	2165856	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6612	NC_011726	TAT	2	6	2167096	2167101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6613	NC_011726	TAA	2	6	2167105	2167110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6614	NC_011726	TAT	2	6	2167159	2167164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6615	NC_011726	TGA	2	6	2167249	2167254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6619	NC_011726	T	6	6	2168098	2168103	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6620	NC_011726	CT	4	8	2168125	2168132	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6621	NC_011726	A	7	7	2168964	2168970	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6622	NC_011726	TAT	2	6	2168975	2168980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6623	NC_011726	GAGG	2	8	2168992	2168999	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
6624	NC_011726	G	6	6	2169626	2169631	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6625	NC_011726	CAT	2	6	2169637	2169642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6626	NC_011726	T	7	7	2170616	2170622	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6627	NC_011726	GATT	2	8	2170644	2170651	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6628	NC_011726	AT	3	6	2171009	2171014	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6629	NC_011726	AAC	2	6	2171018	2171023	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6630	NC_011726	TTA	3	9	2171024	2171032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6631	NC_011726	ATA	2	6	2171069	2171074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6632	NC_011726	TAAA	2	8	2171078	2171085	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6634	NC_011726	AGT	2	6	2172464	2172469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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