MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Candidatus Azobacteroides pseudotrichonymphae genomovar. CFP2 chromosome

Total Repeats: 9016

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_011565	T	6	6	660929	660934	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_011565	TTAT	2	8	660980	660987	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_011565	GAATT	2	10	661010	661019	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_011565	T	6	6	661038	661043	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_011565	T	7	7	661067	661073	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_011565	TCT	2	6	661090	661095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5007	NC_011565	AAG	2	6	661099	661104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_011565	T	7	7	661125	661131	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_011565	TAT	2	6	661137	661142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_011565	ATT	2	6	661153	661158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_011565	A	7	7	661174	661180	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_011565	TATT	2	8	661207	661214	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_011565	ATT	3	9	661260	661268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_011565	T	6	6	661304	661309	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_011565	CTT	2	6	661320	661325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5016	NC_011565	CTTGAT	2	12	661336	661347	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5017	NC_011565	TAC	2	6	661374	661379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5018	NC_011565	TTA	2	6	661396	661401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_011565	GTT	2	6	661443	661448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_011565	T	8	8	661469	661476	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_011565	TCT	2	6	661488	661493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5022	NC_011565	AGT	2	6	661542	661547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_011565	T	7	7	661569	661575	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_011565	CAGA	2	8	661658	661665	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5025	NC_011565	TTG	2	6	661684	661689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_011565	AAT	2	6	661753	661758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_011565	TGAAT	2	10	661761	661770	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_011565	ATT	2	6	661785	661790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_011565	TTC	2	6	661811	661816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5030	NC_011565	CTC	2	6	661828	661833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5031	NC_011565	AG	3	6	661844	661849	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_011565	TAA	2	6	661874	661879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_011565	A	6	6	661881	661886	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_011565	T	7	7	661916	661922	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_011565	GAT	2	6	661947	661952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_011565	TCA	2	6	661992	661997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5037	NC_011565	AAT	2	6	662014	662019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_011565	TGCT	2	8	662028	662035	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5039	NC_011565	T	7	7	662064	662070	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_011565	AAAT	2	8	662092	662099	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_011565	ATTTTT	2	12	662111	662122	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_011565	TCTCTT	2	12	662134	662145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5043	NC_011565	TTG	2	6	662156	662161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_011565	TTG	2	6	662168	662173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_011565	GA	3	6	662177	662182	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_011565	ATAGT	2	10	662196	662205	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_011565	ATT	2	6	662210	662215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_011565	T	6	6	662214	662219	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_011565	GGTT	2	8	662313	662320	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_011565	CTA	2	6	662336	662341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5051	NC_011565	GAA	2	6	662349	662354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_011565	TGA	2	6	662389	662394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5054	NC_011565	T	6	6	662490	662495	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_011565	TTA	2	6	662525	662530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_011565	ATT	2	6	662580	662585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_011565	T	8	8	662584	662591	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_011565	ACA	2	6	662606	662611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5059	NC_011565	T	6	6	662637	662642	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_011565	ATCA	2	8	662656	662663	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5061	NC_011565	GGT	2	6	662760	662765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_011565	AG	3	6	662787	662792	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_011565	TCT	2	6	662810	662815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5064	NC_011565	TAT	2	6	662848	662853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_011565	A	6	6	662898	662903	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_011565	TTCT	2	8	662921	662928	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5067	NC_011565	CTT	2	6	662977	662982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5068	NC_011565	ATC	2	6	662999	663004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5069	NC_011565	A	6	6	663025	663030	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_011565	ATT	2	6	663044	663049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_011565	CATT	2	8	663056	663063	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5072	NC_011565	ATG	2	6	663071	663076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_011565	GTT	2	6	663101	663106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_011565	TAAG	2	8	663123	663130	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_011565	AT	3	6	663142	663147	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5077	NC_011565	T	6	6	663182	663187	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_011565	TTG	2	6	663220	663225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_011565	T	8	8	663234	663241	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_011565	TA	3	6	663254	663259	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_011565	T	6	6	663333	663338	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_011565	TTC	2	6	663351	663356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5083	NC_011565	T	6	6	663389	663394	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_011565	TGT	2	6	663404	663409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_011565	AAT	2	6	663507	663512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_011565	T	6	6	663512	663517	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_011565	ATCTT	2	10	663550	663559	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
5088	NC_011565	TTG	2	6	663578	663583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_011565	A	8	8	663596	663603	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_011565	T	6	6	663628	663633	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_011565	A	8	8	663652	663659	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5096	NC_011565	T	6	6	663788	663793	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_011565	TTTTTC	2	12	663901	663912	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5098	NC_011565	A	6	6	663920	663925	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_011565	TAA	2	6	663931	663936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_011565	TTG	2	6	665205	665210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_011565	ATAA	2	8	665232	665239	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_011565	TAA	2	6	665299	665304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_011565	T	6	6	665367	665372	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_011565	AGA	2	6	665409	665414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_011565	AGA	2	6	665438	665443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_011565	T	6	6	665501	665506	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_011565	A	9	9	666428	666436	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_011565	A	6	6	666461	666466	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_011565	CAA	2	6	667847	667852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5111	NC_011565	CTT	2	6	667924	667929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5112	NC_011565	TTAA	2	8	668075	668082	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_011565	ACA	2	6	668092	668097	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5114	NC_011565	GTT	2	6	668104	668109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_011565	AAC	2	6	668110	668115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5116	NC_011565	T	6	6	668191	668196	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_011565	T	7	7	668206	668212	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_011565	AAAAT	2	10	668246	668255	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_011565	ACAAT	2	10	668261	668270	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5120	NC_011565	A	6	6	668352	668357	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_011565	TTG	2	6	668387	668392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_011565	ATTA	2	8	668408	668415	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_011565	GGAT	2	8	668443	668450	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_011565	GAT	2	6	668488	668493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_011565	CTT	2	6	668770	668775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5126	NC_011565	T	7	7	668807	668813	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_011565	ACT	2	6	668814	668819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5128	NC_011565	TACAGA	2	12	668880	668891	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5129	NC_011565	ATGCA	2	10	668896	668905	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5130	NC_011565	TGC	2	6	668920	668925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5131	NC_011565	T	6	6	668959	668964	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5132	NC_011565	GTT	2	6	668969	668974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5133	NC_011565	TGTA	2	8	669101	669108	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5134	NC_011565	T	6	6	669186	669191	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5135	NC_011565	T	8	8	669236	669243	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5136	NC_011565	GAG	2	6	669288	669293	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5137	NC_011565	AAG	2	6	669294	669299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5139	NC_011565	TTTA	2	8	669359	669366	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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