MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Candidatus Azobacteroides pseudotrichonymphae genomovar. CFP2 plasmid pCFPG2

Total Repeats: 352

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011561	TGT	2	6	1650	1655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011561	GTA	2	6	4456	4461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011561	GCA	2	6	4518	4523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_011561	TGA	2	6	4558	4563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011561	T	6	6	4600	4605	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011561	TAT	2	6	4624	4629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011561	ATT	2	6	4649	4654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011561	TTAA	2	8	5655	5662	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011561	AT	3	6	7226	7231	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011561	AT	3	6	7235	7240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011561	TAC	2	6	7248	7253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_011561	ACT	2	6	7281	7286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_011561	CAG	2	6	7308	7313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_011561	TAA	3	9	7318	7326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011561	A	6	6	7340	7345	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011561	AATCA	2	10	7348	7357	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_011561	GAT	2	6	7371	7376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011561	AATA	2	8	7392	7399	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011561	ATT	2	6	7403	7408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011561	AT	4	8	7481	7488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011561	CCA	2	6	10789	10794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_011561	TTC	2	6	10809	10814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_011561	CAT	2	6	10819	10824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_011561	AGT	5	15	10892	10906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011561	AGGA	2	8	10967	10974	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011561	CTT	2	6	10983	10988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_011561	TTA	2	6	11036	11041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011561	T	6	6	11109	11114	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011561	T	6	6	11904	11909	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011561	ACAAA	2	10	11969	11978	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_011561	TCTG	2	8	11981	11988	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_011561	A	7	7	12075	12081	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011561	TA	3	6	12139	12144	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011561	T	9	9	12181	12189	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011561	TGA	2	6	12217	12222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011561	A	6	6	12268	12273	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011561	AAT	2	6	12288	12293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011561	ATTTA	3	15	12317	12331	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011561	TTATT	2	10	12333	12342	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011561	TGT	2	6	12367	12372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011561	AAC	2	6	12380	12385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_011561	GAA	2	6	12420	12425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011561	TACATC	2	12	12447	12458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_011561	CATCTA	2	12	12461	12472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_011561	TGAAA	2	10	12495	12504	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011561	CTT	2	6	12600	12605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_011561	GAA	2	6	12628	12633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011561	GAA	2	6	12642	12647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011561	GAA	2	6	12656	12661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011561	ATG	2	6	12704	12709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011561	GTCT	2	8	12715	12722	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_011561	ACA	2	6	12737	12742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_011561	ATGGG	2	10	12756	12765	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011561	CTA	2	6	12813	12818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_011561	A	9	9	12874	12882	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011561	T	9	9	12896	12904	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011561	TA	3	6	12917	12922	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011561	ATA	2	6	12952	12957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011561	T	9	9	13001	13009	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011561	T	9	9	13036	13044	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011561	AG	7	14	13373	13386	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011561	A	6	6	13423	13428	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011561	TA	3	6	13448	13453	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011561	GAT	2	6	14183	14188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011561	ATT	2	6	14213	14218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011561	TCT	2	6	14630	14635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_011561	TCGT	2	8	14668	14675	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_011561	TAT	2	6	14694	14699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011561	T	6	6	14792	14797	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011561	ATG	2	6	14809	14814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011561	AAT	2	6	14892	14897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011561	GAT	2	6	14972	14977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011561	AG	3	6	14988	14993	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011561	CTT	2	6	15022	15027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_011561	ATTC	2	8	15055	15062	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_011561	GT	3	6	15072	15077	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011561	TG	3	6	15194	15199	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011561	CT	3	6	15242	15247	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_011561	GAAAG	2	10	15953	15962	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011561	AAGCA	2	10	15966	15975	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
81	NC_011561	TGA	2	6	15978	15983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011561	TAGT	2	8	15990	15997	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011561	ATC	2	6	16023	16028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_011561	TTA	2	6	16038	16043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011561	AT	3	6	18417	18422	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011561	ATAG	2	8	18838	18845	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011561	TCC	3	9	18867	18875	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_011561	T	7	7	18887	18893	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011561	TTTC	2	8	18916	18923	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_011561	TGT	2	6	18932	18937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011561	T	6	6	18958	18963	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011561	TCT	2	6	18967	18972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_011561	AAC	2	6	19033	19038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_011561	TAA	2	6	19081	19086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011561	TTAT	2	8	19087	19094	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011561	AATG	2	8	19144	19151	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011561	CTT	2	6	19156	19161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_011561	GACA	2	8	19192	19199	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_011561	ATTC	2	8	19211	19218	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_011561	TA	3	6	19282	19287	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011561	TCT	2	6	19288	19293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_011561	TCA	2	6	19297	19302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_011561	TCTGA	2	10	19314	19323	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
104	NC_011561	ACA	2	6	19347	19352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_011561	T	7	7	19599	19605	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011561	TC	3	6	19608	19613	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_011561	TGC	2	6	19670	19675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_011561	ATA	2	6	19707	19712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011561	ATC	2	6	19775	19780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_011561	T	7	7	19912	19918	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011561	A	8	8	19963	19970	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011561	CCAGA	2	10	19979	19988	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
113	NC_011561	CGAA	2	8	20011	20018	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_011561	ATA	2	6	20063	20068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011561	CTT	2	6	20082	20087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_011561	TCT	2	6	20146	20151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_011561	TAA	2	6	20608	20613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011561	T	8	8	21248	21255	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011561	CA	3	6	21296	21301	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_011561	AT	3	6	21359	21364	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011561	GTT	2	6	21365	21370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011561	TC	3	6	21442	21447	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_011561	CTG	2	6	21449	21454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_011561	TG	3	6	21484	21489	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011561	CAT	2	6	21497	21502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_011561	GTATTC	2	12	21517	21528	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_011561	ATAG	2	8	21539	21546	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011561	GTA	2	6	21547	21552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011561	ATG	2	6	21580	21585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011561	CAT	2	6	21592	21597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_011561	TGC	2	6	21628	21633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_011561	ATA	2	6	21672	21677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011561	CAA	2	6	21691	21696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_011561	TA	3	6	21718	21723	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011561	TCG	2	6	21801	21806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_011561	TGA	2	6	21891	21896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011561	GAA	2	6	21930	21935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011561	TGT	2	6	21966	21971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011561	GAA	2	6	22031	22036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011561	AAT	2	6	22047	22052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011561	T	6	6	22052	22057	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011561	TTATT	2	10	22066	22075	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011561	AAT	2	6	22100	22105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_011561	TCA	2	6	22178	22183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_011561	CAA	2	6	22317	22322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_011561	CA	3	6	22347	22352	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_011561	ATC	3	9	22393	22401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_011561	TGC	2	6	22462	22467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_011561	TAG	2	6	22483	22488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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152	NC_011561	TACGT	2	10	22760	22769	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
153	NC_011561	TCTG	2	8	22798	22805	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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157	NC_011561	TAG	2	6	22970	22975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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291	NC_011561	AAG	2	6	33986	33991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
292	NC_011561	CCA	2	6	34017	34022	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
293	NC_011561	AACA	2	8	34035	34042	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
294	NC_011561	TAAAA	2	10	34064	34073	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
295	NC_011561	A	6	6	34118	34123	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
296	NC_011561	AAT	2	6	34134	34139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
297	NC_011561	TAA	2	6	34154	34159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
298	NC_011561	TTTA	2	8	34172	34179	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
299	NC_011561	TCA	2	6	34180	34185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
300	NC_011561	TTC	2	6	34224	34229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
301	NC_011561	TACAGT	2	12	34244	34255	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
302	NC_011561	TCA	2	6	34261	34266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
303	NC_011561	TCTA	2	8	34371	34378	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
304	NC_011561	CTC	2	6	34415	34420	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
305	NC_011561	TCTCTT	2	12	34477	34488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
306	NC_011561	TCA	2	6	34534	34539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
307	NC_011561	TCT	2	6	34564	34569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
308	NC_011561	TCT	2	6	34577	34582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
309	NC_011561	TTC	2	6	34586	34591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
310	NC_011561	TCT	2	6	34624	34629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
311	NC_011561	AATC	2	8	34661	34668	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
312	NC_011561	T	8	8	34712	34719	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
313	NC_011561	TC	3	6	34724	34729	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
314	NC_011561	CTT	2	6	34755	34760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
315	NC_011561	TA	3	6	34767	34772	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
316	NC_011561	GCAT	2	8	34773	34780	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
317	NC_011561	TAT	2	6	34796	34801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
318	NC_011561	AGA	2	6	34818	34823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
319	NC_011561	TAA	2	6	34883	34888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
320	NC_011561	TTAC	2	8	34898	34905	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
321	NC_011561	TCTA	2	8	34912	34919	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
322	NC_011561	TATT	2	8	35003	35010	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
323	NC_011561	TCA	2	6	35040	35045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
324	NC_011561	ATA	2	6	35050	35055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
325	NC_011561	TTCTT	2	10	35067	35076	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
326	NC_011561	GGAT	2	8	35101	35108	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
327	NC_011561	T	8	8	35192	35199	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
328	NC_011561	GAA	3	9	35213	35221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
329	NC_011561	TAAATC	2	12	35239	35250	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
330	NC_011561	ATA	2	6	35269	35274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
331	NC_011561	AT	3	6	35294	35299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
332	NC_011561	TTG	2	6	35306	35311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
333	NC_011561	TAC	2	6	35363	35368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
334	NC_011561	TTTTC	2	10	35403	35412	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
335	NC_011561	GTT	4	12	35501	35512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
336	NC_011561	A	6	6	35526	35531	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
337	NC_011561	TCC	2	6	36571	36576	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
338	NC_011561	CAA	2	6	36596	36601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
339	NC_011561	ACA	3	9	36619	36627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
340	NC_011561	ACA	2	6	36684	36689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
341	NC_011561	TCTTT	2	10	36711	36720	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
342	NC_011561	GTT	2	6	36761	36766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
343	NC_011561	ATT	2	6	36796	36801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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345	NC_011561	A	7	7	36866	36872	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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347	NC_011561	GTTAAA	2	12	36909	36920	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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349	NC_011561	ACTT	2	8	36959	36966	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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351	NC_011561	ACTT	2	8	37023	37030	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
352	NC_011561	ACTT	2	8	37055	37062	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.