MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Coxiella burnetii CbuK_Q154 chromosome

Total Repeats: 10424

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_011528	TCGCT	2	10	676701	676710	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3002	NC_011528	GAC	2	6	676718	676723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3003	NC_011528	CG	3	6	677387	677392	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3004	NC_011528	TGA	2	6	677406	677411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_011528	GTT	2	6	677423	677428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_011528	TTTAT	2	10	677452	677461	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_011528	CTT	2	6	677475	677480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3008	NC_011528	TATT	3	12	677491	677502	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_011528	TTA	2	6	677516	677521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_011528	ATT	2	6	677541	677546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_011528	TTG	2	6	677566	677571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_011528	GTTT	2	8	677578	677585	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_011528	CGG	2	6	677603	677608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3014	NC_011528	GGA	2	6	677632	677637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_011528	AATC	2	8	677638	677645	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3016	NC_011528	TAA	2	6	677655	677660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_011528	CGA	3	9	677747	677755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3018	NC_011528	TGG	2	6	677791	677796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_011528	GGGT	2	8	677852	677859	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_011528	TTAT	2	8	677877	677884	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_011528	TCA	2	6	677911	677916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3022	NC_011528	CGA	2	6	677919	677924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3023	NC_011528	ATT	2	6	677933	677938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_011528	A	6	6	678001	678006	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_011528	TTG	2	6	678066	678071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_011528	TAG	2	6	678118	678123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_011528	TATT	2	8	678161	678168	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_011528	TTA	2	6	678172	678177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_011528	TAT	2	6	678205	678210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_011528	CTT	2	6	678223	678228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3031	NC_011528	TTA	2	6	678273	678278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_011528	GC	3	6	678302	678307	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3033	NC_011528	TGC	2	6	678376	678381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3034	NC_011528	ATT	3	9	678393	678401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_011528	T	6	6	678400	678405	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_011528	GGC	2	6	678458	678463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3037	NC_011528	AAGG	2	8	678496	678503	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_011528	GTT	2	6	678534	678539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_011528	TTA	2	6	678549	678554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_011528	T	6	6	678569	678574	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_011528	TGGG	2	8	678624	678631	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_011528	TGG	2	6	678634	678639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_011528	TAT	2	6	678655	678660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_011528	TGG	2	6	678738	678743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_011528	ACT	2	6	678803	678808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3046	NC_011528	TGC	2	6	678838	678843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3047	NC_011528	GGTG	2	8	678868	678875	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_011528	ATT	2	6	678896	678901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_011528	T	6	6	678900	678905	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_011528	CAC	2	6	678993	678998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3051	NC_011528	GTT	3	9	679056	679064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_011528	GA	3	6	679075	679080	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_011528	GTCA	2	8	679110	679117	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3054	NC_011528	CGG	2	6	679136	679141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3055	NC_011528	ACG	2	6	679231	679236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3056	NC_011528	ATA	2	6	679306	679311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_011528	TG	3	6	679320	679325	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_011528	TTA	2	6	679356	679361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_011528	TGGT	2	8	679392	679399	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_011528	TAG	2	6	679435	679440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_011528	CTC	2	6	679441	679446	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3062	NC_011528	CGT	2	6	679462	679467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3063	NC_011528	CAG	2	6	679473	679478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3064	NC_011528	TTG	2	6	679480	679485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_011528	CA	3	6	679515	679520	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3066	NC_011528	TGC	2	6	679550	679555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3067	NC_011528	CGG	2	6	679668	679673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3068	NC_011528	AGCGA	2	10	684540	684549	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3069	NC_011528	TAA	2	6	684585	684590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_011528	TC	3	6	684950	684955	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3071	NC_011528	TTC	2	6	684997	685002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3072	NC_011528	ACT	2	6	685027	685032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3073	NC_011528	CAAAA	2	10	685053	685062	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
3074	NC_011528	A	6	6	685059	685064	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_011528	GC	3	6	687066	687071	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3076	NC_011528	GC	3	6	687077	687082	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3077	NC_011528	ATTTT	2	10	689279	689288	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_011528	ATC	2	6	689296	689301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3079	NC_011528	GCC	2	6	689315	689320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3080	NC_011528	TC	3	6	689392	689397	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3081	NC_011528	TTG	2	6	689401	689406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_011528	CTCG	2	8	689432	689439	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3083	NC_011528	AG	3	6	689441	689446	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_011528	AGG	2	6	689462	689467	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_011528	CTAAA	2	10	689471	689480	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3086	NC_011528	TA	3	6	693128	693133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_011528	TTA	2	6	694425	694430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_011528	GA	3	6	694446	694451	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_011528	TCT	2	6	694496	694501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3090	NC_011528	AAATT	2	10	694508	694517	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_011528	ATC	3	9	696694	696702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3092	NC_011528	TTG	2	6	696794	696799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_011528	ATCC	2	8	696880	696887	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3094	NC_011528	AGCC	2	8	698028	698035	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3095	NC_011528	ATC	3	9	698093	698101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3096	NC_011528	CAG	2	6	698113	698118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3097	NC_011528	T	6	6	698141	698146	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_011528	AAT	2	6	698300	698305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_011528	A	8	8	698323	698330	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_011528	CGC	2	6	698336	698341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3101	NC_011528	ATC	2	6	699383	699388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3102	NC_011528	ATC	3	9	700905	700913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3103	NC_011528	GTC	2	6	700919	700924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3104	NC_011528	CATTG	2	10	700984	700993	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3105	NC_011528	TTG	2	6	701004	701009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_011528	GACAT	2	10	701029	701038	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3107	NC_011528	T	7	7	701803	701809	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_011528	TTC	2	6	701821	701826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3109	NC_011528	ATG	2	6	701882	701887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_011528	CTTT	2	8	701892	701899	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3111	NC_011528	GT	3	6	702090	702095	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_011528	ATGTC	2	10	702101	702110	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3113	NC_011528	T	6	6	702142	702147	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_011528	CTG	2	6	702326	702331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3115	NC_011528	TGC	2	6	702351	702356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3116	NC_011528	AC	3	6	702369	702374	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3117	NC_011528	T	6	6	702411	702416	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_011528	TTA	2	6	702422	702427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_011528	TAG	2	6	702438	702443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_011528	CTC	2	6	702518	702523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3121	NC_011528	AGGA	2	8	702536	702543	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_011528	GA	3	6	704367	704372	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_011528	T	6	6	705564	705569	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_011528	ACG	2	6	708961	708966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3125	NC_011528	A	7	7	709689	709695	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_011528	AGTTTG	2	12	709751	709762	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_011528	GGA	2	6	709771	709776	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_011528	TTA	2	6	711525	711530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_011528	AGA	2	6	712505	712510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_011528	A	6	6	712530	712535	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_011528	GCT	2	6	717357	717362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3132	NC_011528	TGG	2	6	718054	718059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3133	NC_011528	TAA	2	6	718103	718108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3134	NC_011528	TA	3	6	718126	718131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3136	NC_011528	C	6	6	718212	718217	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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