MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Coxiella burnetii CbuK_Q154 chromosome

Total Repeats: 10424

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_011528	CAAA	2	8	1692054	1692061	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8502	NC_011528	GACTTT	2	12	1692184	1692195	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8503	NC_011528	TGA	2	6	1692221	1692226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8504	NC_011528	CT	3	6	1692319	1692324	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8505	NC_011528	AACTG	2	10	1692361	1692370	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
8506	NC_011528	GCC	2	6	1692372	1692377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8507	NC_011528	AAT	2	6	1692395	1692400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8508	NC_011528	T	7	7	1692400	1692406	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8509	NC_011528	CTT	2	6	1692519	1692524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8510	NC_011528	TATC	2	8	1692627	1692634	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8511	NC_011528	C	6	6	1692679	1692684	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8512	NC_011528	A	6	6	1692713	1692718	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8513	NC_011528	CAG	2	6	1692720	1692725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8514	NC_011528	GCA	2	6	1692784	1692789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8515	NC_011528	CAA	2	6	1692797	1692802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8516	NC_011528	AGC	2	6	1692866	1692871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8517	NC_011528	GATAA	2	10	1692876	1692885	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
8518	NC_011528	TG	3	6	1693007	1693012	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8519	NC_011528	GGT	2	6	1693028	1693033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8520	NC_011528	TATT	2	8	1693068	1693075	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8521	NC_011528	AAAGT	2	10	1693101	1693110	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
8522	NC_011528	ATTTA	2	10	1693124	1693133	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8523	NC_011528	TTTTCT	2	12	1693176	1693187	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8524	NC_011528	TGT	3	9	1693265	1693273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8525	NC_011528	AAT	2	6	1693316	1693321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8526	NC_011528	T	7	7	1693330	1693336	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8527	NC_011528	AAT	2	6	1693358	1693363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8528	NC_011528	CTA	2	6	1693470	1693475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8529	NC_011528	GAA	2	6	1693510	1693515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8530	NC_011528	AGT	2	6	1693567	1693572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8531	NC_011528	CAA	2	6	1693583	1693588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8532	NC_011528	TGC	2	6	1693647	1693652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8533	NC_011528	GCC	2	6	1693655	1693660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8534	NC_011528	CGA	2	6	1693790	1693795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8535	NC_011528	A	6	6	1693915	1693920	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8536	NC_011528	TCT	2	6	1693926	1693931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8537	NC_011528	TGC	2	6	1694004	1694009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8538	NC_011528	TTG	2	6	1694012	1694017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8539	NC_011528	CAG	2	6	1694021	1694026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8540	NC_011528	CTC	3	9	1694135	1694143	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8541	NC_011528	GCTTC	2	10	1694149	1694158	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
8542	NC_011528	CTC	2	6	1694159	1694164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8543	NC_011528	TA	3	6	1694191	1694196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8544	NC_011528	T	6	6	1694217	1694222	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8545	NC_011528	CTT	2	6	1694251	1694256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8546	NC_011528	AGG	2	6	1694286	1694291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8547	NC_011528	TGA	2	6	1694315	1694320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8548	NC_011528	T	8	8	1694339	1694346	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8549	NC_011528	CTT	2	6	1694347	1694352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8550	NC_011528	CTC	2	6	1694363	1694368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8551	NC_011528	GGT	3	9	1694377	1694385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8552	NC_011528	TC	3	6	1694429	1694434	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8553	NC_011528	CAG	2	6	1698155	1698160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8554	NC_011528	AT	3	6	1700142	1700147	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8555	NC_011528	AT	3	6	1700169	1700174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8556	NC_011528	T	6	6	1700200	1700205	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8557	NC_011528	AGTAA	2	10	1700210	1700219	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
8558	NC_011528	ACCC	2	8	1700238	1700245	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
8559	NC_011528	A	7	7	1700291	1700297	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8560	NC_011528	TG	3	6	1700360	1700365	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8561	NC_011528	TGA	2	6	1700370	1700375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8562	NC_011528	GTAT	2	8	1700418	1700425	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8563	NC_011528	GTG	2	6	1700455	1700460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8564	NC_011528	GGA	2	6	1700473	1700478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8565	NC_011528	GCA	2	6	1700538	1700543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8566	NC_011528	AAC	2	6	1700651	1700656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8567	NC_011528	GTT	2	6	1700733	1700738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8568	NC_011528	GTG	2	6	1700765	1700770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8569	NC_011528	AGCG	2	8	1700805	1700812	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8570	NC_011528	TTGT	2	8	1700853	1700860	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8571	NC_011528	TTG	2	6	1700869	1700874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8572	NC_011528	GAG	2	6	1700902	1700907	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8573	NC_011528	GGGT	2	8	1700966	1700973	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
8574	NC_011528	TCA	2	6	1701015	1701020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8575	NC_011528	ACA	2	6	1701068	1701073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8576	NC_011528	AGG	2	6	1701088	1701093	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8577	NC_011528	TGT	2	6	1701094	1701099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8578	NC_011528	A	6	6	1701176	1701181	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8579	NC_011528	GAAT	2	8	1701232	1701239	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8580	NC_011528	TG	3	6	1701246	1701251	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8581	NC_011528	CAT	2	6	1701711	1701716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8582	NC_011528	CGT	2	6	1701745	1701750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8583	NC_011528	ATA	2	6	1701764	1701769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8584	NC_011528	GGATA	2	10	1701783	1701792	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
8585	NC_011528	GGAT	2	8	1701797	1701804	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8586	NC_011528	CGAGA	2	10	1701840	1701849	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
8587	NC_011528	TCCT	2	8	1701854	1701861	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8588	NC_011528	AAACG	2	10	1701884	1701893	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
8589	NC_011528	ATT	2	6	1701943	1701948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8590	NC_011528	TTA	2	6	1701963	1701968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8591	NC_011528	TTA	2	6	1702008	1702013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8592	NC_011528	TGGA	2	8	1702022	1702029	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8593	NC_011528	ATT	2	6	1702072	1702077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8594	NC_011528	AG	3	6	1702088	1702093	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8595	NC_011528	CAT	2	6	1702101	1702106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8596	NC_011528	ATTT	2	8	1702135	1702142	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8597	NC_011528	ACG	2	6	1702170	1702175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8598	NC_011528	AAC	2	6	1702187	1702192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8599	NC_011528	CCG	2	6	1702210	1702215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8600	NC_011528	TGA	2	6	1702228	1702233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8601	NC_011528	TGCTTT	2	12	1702277	1702288	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8602	NC_011528	GGT	2	6	1702290	1702295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8603	NC_011528	GGT	2	6	1702330	1702335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8604	NC_011528	A	6	6	1702348	1702353	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8605	NC_011528	TTA	2	6	1702368	1702373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8606	NC_011528	A	8	8	1702405	1702412	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8607	NC_011528	AGA	2	6	1702481	1702486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8608	NC_011528	CAAA	2	8	1702500	1702507	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8609	NC_011528	AGAAA	2	10	1702511	1702520	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
8610	NC_011528	A	6	6	1702518	1702523	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8611	NC_011528	TAA	2	6	1702585	1702590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8612	NC_011528	CCAA	2	8	1702634	1702641	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8613	NC_011528	ACT	2	6	1702665	1702670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8614	NC_011528	A	6	6	1702676	1702681	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8615	NC_011528	A	6	6	1702689	1702694	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8616	NC_011528	A	6	6	1702703	1702708	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8617	NC_011528	CGG	2	6	1702716	1702721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8618	NC_011528	GGCA	2	8	1702732	1702739	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8619	NC_011528	CTG	2	6	1702766	1702771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8620	NC_011528	GCT	2	6	1702802	1702807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8621	NC_011528	T	6	6	1702809	1702814	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8622	NC_011528	A	6	6	1702856	1702861	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8623	NC_011528	CAA	2	6	1702880	1702885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8624	NC_011528	ATT	2	6	1702929	1702934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8625	NC_011528	AGG	2	6	1703017	1703022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8626	NC_011528	A	7	7	1703078	1703084	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8627	NC_011528	T	6	6	1703112	1703117	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8628	NC_011528	CATA	2	8	1703156	1703163	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8629	NC_011528	TAA	2	6	1703172	1703177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8630	NC_011528	TAA	2	6	1705162	1705167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8632	NC_011528	ATTT	2	8	1711140	1711147	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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