MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Candidatus Phytoplasma mali chromosome

Total Repeats: 6616

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011047	AT	5	10	1	10	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011047	GC	3	6	24	29	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_011047	TTA	2	6	36	41	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011047	AGGG	2	8	66	73	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011047	TAT	2	6	113	118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011047	A	8	8	128	135	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011047	AAT	2	6	142	147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011047	T	8	8	158	165	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011047	TA	5	10	173	182	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011047	TA	4	8	211	218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011047	TTA	2	6	219	224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011047	ATAA	3	12	227	238	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011047	TAATTA	2	12	240	251	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011047	T	8	8	252	259	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011047	ATA	2	6	266	271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011047	TTTA	2	8	272	279	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011047	A	8	8	289	296	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011047	ATA	2	6	308	313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011047	ATT	2	6	315	320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011047	T	6	6	332	337	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011047	A	7	7	338	344	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011047	A	8	8	382	389	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011047	ATT	2	6	400	405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011047	TAAA	2	8	415	422	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011047	AGAA	2	8	443	450	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011047	A	7	7	449	455	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011047	A	9	9	459	467	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011047	A	8	8	475	482	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011047	A	7	7	484	490	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011047	TAAA	2	8	491	498	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011047	TAC	2	6	502	507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_011047	TATT	2	8	508	515	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011047	TTTA	2	8	516	523	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011047	TAT	2	6	536	541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011047	T	8	8	545	552	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011047	AATA	2	8	564	571	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011047	A	8	8	578	585	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011047	AAAT	2	8	587	594	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011047	AAT	2	6	597	602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011047	TAAA	2	8	662	669	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011047	AAC	2	6	698	703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_011047	A	6	6	727	732	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011047	AAC	2	6	794	799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_011047	A	6	6	823	828	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011047	AAC	2	6	890	895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_011047	A	6	6	919	924	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011047	ATAA	2	8	940	947	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011047	AAC	2	6	965	970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_011047	A	6	6	994	999	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011047	A	6	6	1055	1060	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011047	CA	3	6	1062	1067	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_011047	A	6	6	1090	1095	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011047	ATAA	2	8	1111	1118	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011047	AAC	2	6	1136	1141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_011047	A	6	6	1165	1170	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011047	ATT	2	6	1452	1457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011047	ATT	3	9	1459	1467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011047	TTTA	2	8	1469	1476	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011047	AT	3	6	1488	1493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011047	A	6	6	1509	1514	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011047	A	6	6	1519	1524	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011047	TAA	3	9	1532	1540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011047	A	7	7	1551	1557	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011047	TA	3	6	1568	1573	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011047	TAT	2	6	1583	1588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011047	ATA	2	6	1610	1615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011047	TATAAA	2	12	1623	1634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011047	AACT	2	8	1645	1652	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_011047	AT	3	6	1657	1662	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011047	A	6	6	1663	1668	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011047	ATAA	2	8	1673	1680	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011047	ATT	2	6	1685	1690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011047	TTA	2	6	2293	2298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011047	ATT	2	6	2313	2318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011047	TTA	2	6	2329	2334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011047	TAT	2	6	2357	2362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011047	C	6	6	2365	2370	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
78	NC_011047	AT	5	10	2381	2390	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011047	AT	5	10	2393	2402	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011047	A	7	7	5359	5365	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011047	TAT	2	6	5366	5371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011047	ATT	2	6	6466	6471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011047	TCC	2	6	6478	6483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_011047	TATTT	2	10	6490	6499	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011047	T	6	6	6497	6502	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011047	A	7	7	6520	6526	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011047	ATTTTT	2	12	6537	6548	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011047	TTTTAA	2	12	6555	6566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011047	ATT	2	6	6608	6613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011047	AAT	2	6	6628	6633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011047	A	7	7	6650	6656	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011047	ATC	2	6	6675	6680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_011047	A	7	7	6709	6715	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011047	ATT	3	9	6731	6739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011047	A	7	7	6769	6775	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011047	AT	3	6	6784	6789	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011047	T	8	8	6789	6796	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011047	T	7	7	6809	6815	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011047	AAT	2	6	6821	6826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011047	TA	3	6	6838	6843	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011047	T	6	6	6874	6879	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011047	ATTTA	2	10	6880	6889	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011047	TA	3	6	6895	6900	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011047	A	6	6	6900	6905	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011047	T	7	7	6922	6928	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011047	T	6	6	6930	6935	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011047	ATG	2	6	6937	6942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011047	ATTTT	2	10	6945	6954	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011047	A	6	6	6963	6968	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011047	A	7	7	6971	6977	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011047	AATT	2	8	6986	6993	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011047	T	7	7	7010	7016	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011047	ATT	2	6	7029	7034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011047	A	6	6	7049	7054	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011047	TAA	2	6	7066	7071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011047	T	7	7	7086	7092	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011047	A	8	8	7115	7122	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011047	TAT	3	9	7166	7174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011047	ATAA	2	8	7187	7194	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011047	A	6	6	7193	7198	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011047	AATAC	2	10	7226	7235	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_011047	ATTA	2	8	7250	7257	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011047	ATTT	3	12	7266	7277	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011047	T	7	7	7275	7281	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011047	A	8	8	7288	7295	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011047	TTTA	2	8	7302	7309	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011047	T	8	8	7320	7327	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011047	A	6	6	7395	7400	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011047	ATA	2	6	7467	7472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011047	T	6	6	7475	7480	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011047	TTTC	2	8	7489	7496	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_011047	TA	3	6	7517	7522	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011047	AT	7	14	7529	7542	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011047	T	7	7	7576	7582	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011047	GAT	2	6	7593	7598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011047	AT	3	6	7597	7602	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011047	TAA	2	6	7656	7661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011047	ATAAA	2	10	7668	7677	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011047	A	7	7	7699	7705	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011047	AT	3	6	7755	7760	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011047	TCT	2	6	7805	7810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_011047	A	6	6	7826	7831	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011047	TG	3	6	7858	7863	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_011047	A	6	6	7866	7871	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_011047	ATAAA	2	10	7926	7935	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_011047	A	6	6	7933	7938	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_011047	TTA	2	6	7943	7948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_011047	AAT	2	6	7959	7964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_011047	A	8	8	7969	7976	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_011047	T	6	6	7989	7994	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_011047	T	6	6	8004	8009	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_011047	ATA	2	6	8027	8032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_011047	A	8	8	8041	8048	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_011047	TTAAAA	2	12	8780	8791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_011047	A	6	6	8788	8793	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_011047	GAT	2	6	8796	8801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
157	NC_011047	ATT	2	6	8809	8814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_011047	AAT	3	9	8826	8834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_011047	CTT	2	6	8842	8847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_011047	TA	3	6	8848	8853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_011047	T	6	6	8854	8859	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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461	NC_011047	TAAT	2	8	28010	28017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
462	NC_011047	ACT	2	6	28026	28031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
463	NC_011047	ATTTT	2	10	28043	28052	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
464	NC_011047	T	7	7	28049	28055	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
465	NC_011047	T	6	6	28064	28069	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
466	NC_011047	TCT	2	6	28072	28077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
467	NC_011047	AAACTT	2	12	28085	28096	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
468	NC_011047	T	7	7	28104	28110	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
469	NC_011047	A	7	7	28128	28134	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
470	NC_011047	TTAT	2	8	28145	28152	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
471	NC_011047	T	6	6	28221	28226	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
472	NC_011047	T	6	6	28242	28247	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
473	NC_011047	AATT	2	8	28274	28281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
474	NC_011047	ATG	2	6	28288	28293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
475	NC_011047	TATTT	3	15	28327	28341	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
476	NC_011047	T	6	6	28339	28344	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
477	NC_011047	GTT	2	6	28365	28370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
478	NC_011047	ATATTT	2	12	28417	28428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
479	NC_011047	T	8	8	28426	28433	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
480	NC_011047	TAAT	2	8	28451	28458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
481	NC_011047	ACT	2	6	28467	28472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
482	NC_011047	ATTTT	2	10	28484	28493	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
483	NC_011047	T	6	6	28490	28495	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
484	NC_011047	A	7	7	28505	28511	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
485	NC_011047	T	8	8	28524	28531	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
486	NC_011047	ATT	2	6	28542	28547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
487	NC_011047	CCA	2	6	29135	29140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
488	NC_011047	ATC	2	6	29152	29157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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490	NC_011047	TA	3	6	29196	29201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
491	NC_011047	TA	3	6	29217	29222	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
492	NC_011047	T	7	7	29229	29235	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
493	NC_011047	T	7	7	29447	29453	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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495	NC_011047	TAAT	2	8	29470	29477	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
496	NC_011047	AT	3	6	29492	29497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
497	NC_011047	TTA	2	6	29506	29511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
498	NC_011047	A	7	7	29511	29517	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
499	NC_011047	ATT	2	6	29533	29538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
500	NC_011047	T	7	7	29537	29543	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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