MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Chlorobium phaeobacteroides BS1 chromosome

Total Repeats: 9457

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_010831	CAT	2	6	1829882	1829887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6502	NC_010831	TGA	2	6	1830455	1830460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6503	NC_010831	A	7	7	1830463	1830469	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6504	NC_010831	TTG	2	6	1830493	1830498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6505	NC_010831	TCACA	2	10	1830536	1830545	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
6506	NC_010831	AGG	2	6	1830552	1830557	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6507	NC_010831	AGC	2	6	1832253	1832258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6508	NC_010831	GT	3	6	1832283	1832288	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6509	NC_010831	CCTTT	2	10	1832321	1832330	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
6510	NC_010831	TTCAG	2	10	1835056	1835065	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
6511	NC_010831	TA	3	6	1835082	1835087	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6512	NC_010831	GCGT	2	8	1836178	1836185	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6513	NC_010831	TGC	2	6	1836194	1836199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6514	NC_010831	GCA	2	6	1836207	1836212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6515	NC_010831	CAA	2	6	1836256	1836261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6516	NC_010831	AGA	2	6	1836316	1836321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6517	NC_010831	GCC	2	6	1836324	1836329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6518	NC_010831	GAATA	2	10	1836339	1836348	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
6519	NC_010831	T	6	6	1839729	1839734	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6520	NC_010831	GACA	2	8	1839827	1839834	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6521	NC_010831	AAT	2	6	1839878	1839883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6522	NC_010831	GGAAT	2	10	1839953	1839962	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
6523	NC_010831	GAC	2	6	1840042	1840047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6524	NC_010831	ATGGG	2	10	1840148	1840157	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
6525	NC_010831	TGG	2	6	1840261	1840266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6526	NC_010831	GGA	2	6	1840307	1840312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6527	NC_010831	AT	3	6	1840342	1840347	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6528	NC_010831	AGA	2	6	1840390	1840395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6529	NC_010831	A	6	6	1840510	1840515	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6530	NC_010831	TTATAT	2	12	1840534	1840545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6531	NC_010831	AGT	2	6	1840547	1840552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6532	NC_010831	GAACA	2	10	1840557	1840566	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
6533	NC_010831	CAAAT	2	10	1840577	1840586	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
6534	NC_010831	TA	3	6	1841325	1841330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6535	NC_010831	AAC	2	6	1842089	1842094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6536	NC_010831	CAA	2	6	1843331	1843336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6537	NC_010831	TTATA	2	10	1844917	1844926	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6538	NC_010831	TA	5	10	1844923	1844932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6539	NC_010831	CTG	2	6	1844942	1844947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6540	NC_010831	A	6	6	1844960	1844965	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6541	NC_010831	CAG	2	6	1845655	1845660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6542	NC_010831	AC	3	6	1845903	1845908	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6543	NC_010831	GAA	2	6	1845953	1845958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6544	NC_010831	T	7	7	1845963	1845969	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6545	NC_010831	AATA	2	8	1845986	1845993	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6546	NC_010831	TA	3	6	1845996	1846001	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6547	NC_010831	ACC	2	6	1846002	1846007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6548	NC_010831	GCA	2	6	1846034	1846039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6549	NC_010831	ACA	2	6	1846057	1846062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6550	NC_010831	CTA	2	6	1846690	1846695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6551	NC_010831	CT	3	6	1846713	1846718	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6552	NC_010831	TC	3	6	1846745	1846750	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6553	NC_010831	CTA	2	6	1846840	1846845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6554	NC_010831	CTA	2	6	1846861	1846866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6555	NC_010831	CT	3	6	1846891	1846896	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6556	NC_010831	TC	3	6	1846923	1846928	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6557	NC_010831	GGCA	2	8	1846966	1846973	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6558	NC_010831	CTA	2	6	1847011	1847016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6559	NC_010831	CTA	2	6	1847018	1847023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6560	NC_010831	CT	3	6	1847048	1847053	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6561	NC_010831	TC	3	6	1847080	1847085	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6562	NC_010831	GGCA	2	8	1847123	1847130	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6563	NC_010831	CTTC	2	8	1847220	1847227	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6564	NC_010831	CAGA	2	8	1847256	1847263	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6565	NC_010831	ACTC	2	8	1847281	1847288	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6566	NC_010831	A	7	7	1847391	1847397	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6567	NC_010831	AGG	2	6	1847441	1847446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6568	NC_010831	TAT	2	6	1847878	1847883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6569	NC_010831	A	6	6	1849880	1849885	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6570	NC_010831	A	6	6	1850490	1850495	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6571	NC_010831	GCTT	2	8	1850531	1850538	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6572	NC_010831	TAA	2	6	1851400	1851405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6573	NC_010831	GA	3	6	1851408	1851413	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6574	NC_010831	ATTC	2	8	1851904	1851911	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6575	NC_010831	A	7	7	1851928	1851934	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6576	NC_010831	CAA	2	6	1851968	1851973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6577	NC_010831	CAA	2	6	1851984	1851989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6578	NC_010831	A	8	8	1851991	1851998	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6579	NC_010831	TGC	2	6	1852007	1852012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6580	NC_010831	A	6	6	1852145	1852150	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6581	NC_010831	CAG	2	6	1852173	1852178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6582	NC_010831	GCA	2	6	1852248	1852253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6583	NC_010831	TGC	2	6	1852268	1852273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6584	NC_010831	TGG	4	12	1852321	1852332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6585	NC_010831	GGTGGC	3	18	1852358	1852375	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
6586	NC_010831	CTT	2	6	1852383	1852388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6587	NC_010831	TAG	2	6	1852482	1852487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6588	NC_010831	AGC	2	6	1853860	1853865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6589	NC_010831	TTC	2	6	1853866	1853871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6590	NC_010831	CTG	2	6	1853961	1853966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6591	NC_010831	ATT	2	6	1854856	1854861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6592	NC_010831	A	8	8	1857543	1857550	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6593	NC_010831	A	6	6	1857622	1857627	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6594	NC_010831	CAG	2	6	1857645	1857650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6595	NC_010831	A	7	7	1857777	1857783	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6596	NC_010831	TTA	2	6	1857849	1857854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6597	NC_010831	TAG	2	6	1857880	1857885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6598	NC_010831	A	6	6	1857935	1857940	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6599	NC_010831	CTG	2	6	1857946	1857951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6600	NC_010831	TCC	2	6	1857965	1857970	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6601	NC_010831	CTT	2	6	1858065	1858070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6602	NC_010831	CAAT	2	8	1858080	1858087	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6603	NC_010831	T	6	6	1862082	1862087	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6604	NC_010831	CATC	2	8	1862092	1862099	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6605	NC_010831	AATA	2	8	1862100	1862107	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6606	NC_010831	AGAA	2	8	1867103	1867110	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6607	NC_010831	ACGA	2	8	1867685	1867692	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6608	NC_010831	AGGAA	2	10	1867700	1867709	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
6609	NC_010831	T	6	6	1869428	1869433	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6610	NC_010831	AAC	2	6	1871374	1871379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6611	NC_010831	A	9	9	1871389	1871397	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6612	NC_010831	TTC	2	6	1871417	1871422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6613	NC_010831	AAT	3	9	1871485	1871493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6614	NC_010831	AATG	2	8	1871497	1871504	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6615	NC_010831	ACA	2	6	1871512	1871517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6616	NC_010831	GTA	2	6	1871544	1871549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6617	NC_010831	A	6	6	1871642	1871647	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6618	NC_010831	CCA	2	6	1873992	1873997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6619	NC_010831	GTT	2	6	1874004	1874009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6620	NC_010831	GTT	2	6	1874011	1874016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6621	NC_010831	AAT	2	6	1874054	1874059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6622	NC_010831	CTC	2	6	1874158	1874163	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6623	NC_010831	CT	3	6	1874228	1874233	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6624	NC_010831	GCC	2	6	1874239	1874244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6625	NC_010831	CATC	2	8	1874283	1874290	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6626	NC_010831	TC	5	10	1874435	1874444	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6627	NC_010831	C	8	8	1874448	1874455	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6628	NC_010831	G	7	7	1874497	1874503	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6629	NC_010831	CCT	2	6	1874827	1874832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6630	NC_010831	ATC	2	6	1874836	1874841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6631	NC_010831	ATA	2	6	1874843	1874848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6633	NC_010831	TGT	2	6	1874862	1874867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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