MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Chlorobium phaeobacteroides BS1 chromosome

Total Repeats: 9457

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_010831	TTC	2	6	1672954	1672959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6002	NC_010831	TCA	2	6	1672981	1672986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6003	NC_010831	AGC	2	6	1673381	1673386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6004	NC_010831	GCC	2	6	1673391	1673396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6005	NC_010831	TCCA	2	8	1673449	1673456	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6006	NC_010831	ATC	2	6	1673546	1673551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6007	NC_010831	TGG	2	6	1673560	1673565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6008	NC_010831	CGA	2	6	1673573	1673578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6009	NC_010831	CTC	2	6	1674791	1674796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6010	NC_010831	GAC	2	6	1674811	1674816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6011	NC_010831	GTT	2	6	1674835	1674840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_010831	GAAA	2	8	1674874	1674881	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_010831	A	6	6	1674879	1674884	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6014	NC_010831	TC	3	6	1674916	1674921	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6015	NC_010831	A	6	6	1674958	1674963	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6016	NC_010831	ATT	2	6	1674970	1674975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_010831	T	6	6	1674990	1674995	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6018	NC_010831	CCA	2	6	1675029	1675034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6019	NC_010831	GGT	2	6	1675093	1675098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6020	NC_010831	GCAA	2	8	1675110	1675117	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6021	NC_010831	TCA	2	6	1675253	1675258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6022	NC_010831	TTG	2	6	1675290	1675295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6023	NC_010831	TGC	2	6	1675323	1675328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6024	NC_010831	ATC	2	6	1675397	1675402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6025	NC_010831	CGGA	2	8	1675466	1675473	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6026	NC_010831	GAC	2	6	1675548	1675553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6027	NC_010831	ACG	2	6	1675582	1675587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6028	NC_010831	ACA	2	6	1675651	1675656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6029	NC_010831	TCG	3	9	1675675	1675683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6030	NC_010831	TCA	2	6	1675687	1675692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6031	NC_010831	TGCT	2	8	1675759	1675766	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6032	NC_010831	GCG	2	6	1675824	1675829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6033	NC_010831	GCA	2	6	1675908	1675913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6034	NC_010831	TCA	2	6	1675918	1675923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6035	NC_010831	GATC	2	8	1675928	1675935	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6036	NC_010831	CGC	2	6	1675997	1676002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6037	NC_010831	ACGC	2	8	1676023	1676030	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6038	NC_010831	AAG	2	6	1676034	1676039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_010831	AACGA	2	10	1676089	1676098	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
6040	NC_010831	CGG	2	6	1676106	1676111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6041	NC_010831	AAG	2	6	1676124	1676129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_010831	GAA	2	6	1676138	1676143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_010831	GCT	2	6	1676189	1676194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6044	NC_010831	TAC	2	6	1676259	1676264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6045	NC_010831	ATG	2	6	1676388	1676393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_010831	A	6	6	1676591	1676596	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6047	NC_010831	TGATA	2	10	1676678	1676687	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6048	NC_010831	TCG	2	6	1676721	1676726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6049	NC_010831	C	6	6	1676738	1676743	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6050	NC_010831	C	6	6	1677631	1677636	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6051	NC_010831	ATTG	3	12	1677638	1677649	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6052	NC_010831	ATC	2	6	1677670	1677675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6053	NC_010831	GCC	2	6	1677699	1677704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6054	NC_010831	AAG	2	6	1677740	1677745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_010831	GAA	2	6	1677752	1677757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6056	NC_010831	A	6	6	1677782	1677787	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6057	NC_010831	AAT	2	6	1677840	1677845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6058	NC_010831	CAT	2	6	1677882	1677887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6059	NC_010831	CAAA	2	8	1677942	1677949	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6060	NC_010831	T	6	6	1679272	1679277	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6061	NC_010831	CAG	2	6	1679296	1679301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6062	NC_010831	CTGAA	2	10	1679304	1679313	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6063	NC_010831	CTG	2	6	1679319	1679324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6064	NC_010831	CA	3	6	1679352	1679357	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6065	NC_010831	AAT	2	6	1679415	1679420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6066	NC_010831	TC	3	6	1679482	1679487	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6067	NC_010831	A	6	6	1679500	1679505	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6068	NC_010831	GCC	2	6	1679528	1679533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6069	NC_010831	T	8	8	1679687	1679694	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6070	NC_010831	ATT	2	6	1679708	1679713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6071	NC_010831	A	7	7	1679755	1679761	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6072	NC_010831	TTG	2	6	1679828	1679833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6073	NC_010831	GA	3	6	1679851	1679856	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6074	NC_010831	GTA	2	6	1679872	1679877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6075	NC_010831	T	7	7	1680105	1680111	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6076	NC_010831	CAT	2	6	1682007	1682012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6077	NC_010831	CAT	2	6	1682036	1682041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6078	NC_010831	AGT	2	6	1683797	1683802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6079	NC_010831	TAC	2	6	1683842	1683847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6080	NC_010831	TGA	2	6	1683887	1683892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6081	NC_010831	GC	3	6	1683896	1683901	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6082	NC_010831	GTT	2	6	1689822	1689827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6083	NC_010831	ACA	2	6	1689831	1689836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6084	NC_010831	CAA	2	6	1689852	1689857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6085	NC_010831	CAA	2	6	1689882	1689887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6086	NC_010831	CTATA	2	10	1689924	1689933	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6087	NC_010831	TGA	2	6	1690133	1690138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6088	NC_010831	CTG	2	6	1690193	1690198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6089	NC_010831	A	7	7	1690261	1690267	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6090	NC_010831	AGT	2	6	1690340	1690345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6091	NC_010831	T	6	6	1690401	1690406	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6092	NC_010831	TTA	2	6	1690432	1690437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6093	NC_010831	T	6	6	1690488	1690493	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6094	NC_010831	ATG	2	6	1691129	1691134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6095	NC_010831	TGA	2	6	1691175	1691180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6096	NC_010831	TC	3	6	1691245	1691250	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6097	NC_010831	CGT	2	6	1691262	1691267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6098	NC_010831	GAA	2	6	1691299	1691304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6099	NC_010831	A	6	6	1692043	1692048	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6100	NC_010831	A	6	6	1692114	1692119	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6101	NC_010831	ATCAA	2	10	1692160	1692169	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
6102	NC_010831	A	8	8	1692716	1692723	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_010831	AAGTC	2	10	1692752	1692761	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6104	NC_010831	TCA	2	6	1692771	1692776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6105	NC_010831	TCA	2	6	1692778	1692783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6106	NC_010831	TCA	2	6	1692785	1692790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6107	NC_010831	TG	3	6	1694411	1694416	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6108	NC_010831	TAA	2	6	1694417	1694422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6109	NC_010831	TGT	2	6	1694423	1694428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6110	NC_010831	TGC	2	6	1694434	1694439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6111	NC_010831	TGA	2	6	1694465	1694470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6112	NC_010831	AACA	2	8	1694623	1694630	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6113	NC_010831	GATT	2	8	1696913	1696920	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6114	NC_010831	GTT	2	6	1696942	1696947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6115	NC_010831	GTT	2	6	1697722	1697727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6116	NC_010831	GTT	2	6	1697730	1697735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6117	NC_010831	CTT	3	9	1698365	1698373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6118	NC_010831	TTC	2	6	1698389	1698394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6119	NC_010831	A	6	6	1698411	1698416	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6120	NC_010831	TAC	2	6	1698456	1698461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6121	NC_010831	CTC	2	6	1698486	1698491	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6122	NC_010831	CTG	2	6	1698536	1698541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6123	NC_010831	AT	3	6	1698621	1698626	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6124	NC_010831	TGA	2	6	1698658	1698663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6125	NC_010831	CAA	2	6	1698724	1698729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6126	NC_010831	CTC	2	6	1698833	1698838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6127	NC_010831	T	6	6	1698905	1698910	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6128	NC_010831	GTT	2	6	1698923	1698928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6130	NC_010831	CTT	2	6	1698987	1698992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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